Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139H2C7

Protein Details
Accession A0A139H2C7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MGSGKPKHFVRPPPKKKPAKTSALQSADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-20KPKHFVRPPPKKKPAK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Amino Acid Sequences MGSGKPKHFVRPPPKKKPAKTSALQSADDFQEAADYEEAAGGKHRAGDPVKSGRAFVRALEIYDKALAKHPTSFDLAYNKARLQLELSQHENLLEHIGLPLLKWLQLTLESHRYALRLSEENPDVLFNTAQVLTSLAEQLGEDDAESDAVQALQEALELLSSCLSRQEMMYEQHRLDFPDTEDGGVALDESAPQQSSAPAEDIDMGEQSAIVETPVGPSDLLDTVHASLSALTTLVPLADEAALQNLGDMARQLTESKAPDYLKLLPEEEQSKAHFSIAVGRAAFIAAYASAQFEHHMIELETYVERLESFDILSKEQDVDALVAEAEARTELVLSVIDRFGETSVLPAALCWKQLTSCQDLLSKAAKLNSEEAQKSKAEIYLSKGDTELLRHRIIHIPKTDLADGIRSSAPTLIQNAQTFYKGAVGNAKALGEDDVEGEAQQRWNVAKAIAALIYGGPALDDSIAGNLMEGLEECVEEGLISEQLADAIVNGKSASRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.92
4 0.92
5 0.91
6 0.89
7 0.85
8 0.83
9 0.83
10 0.78
11 0.71
12 0.61
13 0.56
14 0.48
15 0.41
16 0.31
17 0.2
18 0.17
19 0.15
20 0.16
21 0.12
22 0.1
23 0.1
24 0.12
25 0.12
26 0.1
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.15
31 0.16
32 0.2
33 0.23
34 0.27
35 0.32
36 0.39
37 0.45
38 0.41
39 0.42
40 0.38
41 0.4
42 0.37
43 0.3
44 0.29
45 0.24
46 0.25
47 0.27
48 0.25
49 0.22
50 0.25
51 0.26
52 0.19
53 0.24
54 0.26
55 0.24
56 0.29
57 0.29
58 0.28
59 0.31
60 0.31
61 0.29
62 0.31
63 0.34
64 0.33
65 0.35
66 0.32
67 0.35
68 0.34
69 0.31
70 0.29
71 0.31
72 0.33
73 0.35
74 0.38
75 0.33
76 0.33
77 0.33
78 0.29
79 0.23
80 0.18
81 0.13
82 0.09
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.11
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.13
94 0.15
95 0.18
96 0.24
97 0.24
98 0.25
99 0.26
100 0.25
101 0.23
102 0.22
103 0.21
104 0.17
105 0.19
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.23
111 0.2
112 0.18
113 0.16
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.04
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.1
155 0.13
156 0.17
157 0.21
158 0.23
159 0.23
160 0.25
161 0.25
162 0.24
163 0.22
164 0.2
165 0.18
166 0.2
167 0.2
168 0.18
169 0.17
170 0.15
171 0.13
172 0.11
173 0.1
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.16
249 0.19
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.16
254 0.18
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.13
263 0.11
264 0.18
265 0.18
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.16
270 0.16
271 0.15
272 0.07
273 0.05
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.04
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.1
337 0.1
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.16
343 0.21
344 0.22
345 0.23
346 0.25
347 0.27
348 0.27
349 0.29
350 0.28
351 0.25
352 0.21
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.24
357 0.25
358 0.28
359 0.29
360 0.29
361 0.29
362 0.28
363 0.28
364 0.25
365 0.24
366 0.19
367 0.19
368 0.23
369 0.28
370 0.29
371 0.28
372 0.27
373 0.25
374 0.24
375 0.27
376 0.28
377 0.24
378 0.25
379 0.25
380 0.28
381 0.34
382 0.38
383 0.41
384 0.38
385 0.38
386 0.39
387 0.43
388 0.4
389 0.34
390 0.3
391 0.27
392 0.23
393 0.21
394 0.19
395 0.15
396 0.15
397 0.15
398 0.16
399 0.14
400 0.17
401 0.18
402 0.22
403 0.23
404 0.25
405 0.25
406 0.25
407 0.24
408 0.2
409 0.22
410 0.18
411 0.18
412 0.22
413 0.22
414 0.23
415 0.23
416 0.23
417 0.17
418 0.17
419 0.17
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.13
431 0.14
432 0.16
433 0.18
434 0.17
435 0.16
436 0.16
437 0.18
438 0.16
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.08
444 0.06
445 0.04
446 0.04
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.05
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09