Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139GZR1

Protein Details
Accession A0A139GZR1    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-257EAAPPKKEKKVKKEPVAKEKKPBasic
363-392VVTKGKGFTKEKNKKKRGKNNSTHLRQTSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-274PPKKEKKVKKEPVAKEKKPDTSVRKASVAISRKEAK
368-382KGFTKEKNKKKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MADQHVPDGLWPHNTPAPKLPDLLAQISKFLGDLGYSKTVASLDKDAAKNGVAKPSHSDERTSLLNYYQPTTPPTTAGATDDSSDSSSSDSESGSESDDESENDEAEGLLVDVEAEETSDDDSDEKSDSGSSSDSSDSDSSSVGEVKVSSKRKRVATPPSSDDGSSSSSEADSDSDSSSDETDARPAKRTKVGPASSPSDSGSDASSSSGSDSSDSDSESDTSDSDSSSSSDSDSEAAPPKKEKKVKKEPVAKEKKPDTSVRKASVAISRKEAKKDGSQSSATLDAESAGETPGESEEKSGMHPDRLKRLPQLQKNVTAIVDGKKKKQVPFSRIPADQYVDPRFASNEYVSYDYADRAYQDLVVTKGKGFTKEKNKKKRGKNNSTHLRQTSARDRRSRMDEEFGSFEDDFSGGNAFGFKEDLWDFCAGVGFNPILTCSAGAYRGGAIDLTPKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.36
4 0.41
5 0.38
6 0.39
7 0.35
8 0.37
9 0.39
10 0.41
11 0.38
12 0.31
13 0.31
14 0.29
15 0.28
16 0.22
17 0.17
18 0.12
19 0.08
20 0.09
21 0.13
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.18
27 0.18
28 0.2
29 0.18
30 0.19
31 0.26
32 0.27
33 0.28
34 0.28
35 0.28
36 0.3
37 0.29
38 0.33
39 0.27
40 0.27
41 0.32
42 0.37
43 0.44
44 0.4
45 0.4
46 0.34
47 0.37
48 0.39
49 0.35
50 0.29
51 0.23
52 0.25
53 0.24
54 0.25
55 0.23
56 0.22
57 0.23
58 0.28
59 0.27
60 0.24
61 0.25
62 0.24
63 0.23
64 0.23
65 0.22
66 0.17
67 0.17
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.1
120 0.11
121 0.1
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.1
134 0.18
135 0.25
136 0.29
137 0.35
138 0.42
139 0.46
140 0.52
141 0.58
142 0.61
143 0.62
144 0.63
145 0.61
146 0.58
147 0.54
148 0.48
149 0.4
150 0.31
151 0.25
152 0.19
153 0.15
154 0.12
155 0.1
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.11
170 0.16
171 0.16
172 0.22
173 0.24
174 0.27
175 0.33
176 0.35
177 0.37
178 0.42
179 0.42
180 0.4
181 0.43
182 0.44
183 0.38
184 0.37
185 0.31
186 0.22
187 0.21
188 0.18
189 0.14
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.2
227 0.25
228 0.33
229 0.4
230 0.46
231 0.5
232 0.61
233 0.69
234 0.75
235 0.8
236 0.8
237 0.84
238 0.87
239 0.79
240 0.76
241 0.72
242 0.68
243 0.62
244 0.61
245 0.57
246 0.56
247 0.59
248 0.54
249 0.5
250 0.45
251 0.44
252 0.43
253 0.41
254 0.33
255 0.32
256 0.36
257 0.37
258 0.39
259 0.39
260 0.35
261 0.36
262 0.42
263 0.41
264 0.39
265 0.37
266 0.34
267 0.33
268 0.33
269 0.26
270 0.19
271 0.15
272 0.1
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.13
288 0.14
289 0.18
290 0.23
291 0.26
292 0.34
293 0.38
294 0.4
295 0.4
296 0.49
297 0.54
298 0.56
299 0.63
300 0.58
301 0.61
302 0.59
303 0.55
304 0.46
305 0.37
306 0.32
307 0.27
308 0.32
309 0.28
310 0.31
311 0.37
312 0.42
313 0.45
314 0.53
315 0.57
316 0.57
317 0.63
318 0.68
319 0.67
320 0.64
321 0.62
322 0.55
323 0.49
324 0.43
325 0.39
326 0.34
327 0.29
328 0.28
329 0.25
330 0.23
331 0.21
332 0.21
333 0.17
334 0.15
335 0.16
336 0.18
337 0.17
338 0.18
339 0.18
340 0.16
341 0.16
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.14
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.2
354 0.21
355 0.27
356 0.29
357 0.36
358 0.45
359 0.55
360 0.65
361 0.71
362 0.8
363 0.83
364 0.9
365 0.92
366 0.92
367 0.93
368 0.92
369 0.92
370 0.93
371 0.91
372 0.89
373 0.8
374 0.74
375 0.66
376 0.64
377 0.63
378 0.62
379 0.63
380 0.62
381 0.64
382 0.66
383 0.7
384 0.69
385 0.62
386 0.6
387 0.54
388 0.51
389 0.49
390 0.42
391 0.39
392 0.33
393 0.28
394 0.21
395 0.18
396 0.14
397 0.12
398 0.12
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.12
407 0.13
408 0.14
409 0.16
410 0.17
411 0.16
412 0.15
413 0.18
414 0.13
415 0.13
416 0.15
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.11
422 0.11
423 0.11
424 0.09
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.11
433 0.09
434 0.13
435 0.14
436 0.17
437 0.18
438 0.17