Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HMD4

Protein Details
Accession A0A139HMD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-207QFCLRRDDRDRDTRRDRDREYDRNYRRRSRSRDRRDDRTRDRSRDYPRDHRDRGYERDRSREHGRNRRGPRSRSRGPQNGRSPVRDPKNKPRHPREDDHVHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-200NYRRRSRSRDRRDDRTRDRSRDYPRDHRDRGYERDRSREHGRNRRGPRSRSRGPQNGRSPVRDPKNKPRHPR
252-277KQKAKAERQAKVELWKAKKAAEKAKL
Subcellular Location(s) cyto 12.5cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17953  DEADc_DDX46  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MLLWWWWWWWMLFVWLGLSHDIDSSLRVSSSSNLVLALAKPLETPSHPPPAHVLELSTSSVLLSKAHFAKNTPPPDLRLPSPLRHRITLLRHWHCPQRHTDNYNQQFCLRRDDRDRDTRRDRDREYDRNYRRRSRSRDRRDDRTRDRSRDYPRDHRDRGYERDRSREHGRNRRGPRSRSRGPQNGRSPVRDPKNKPRHPREDDHVHDNGHRIKRQRTTSVERGEPSSRPSTSSGPLNGDSRKPPPTAEDEAKQKAKAERQAKVELWKAKKAAEKAKLEAGKAASASALTPTVASPSNSQPTTAVGSPAPAPTFEDTPATTRAKFDPKAIKKQTEGKSKSEQATLGGDAAVPATANGNANAQNAVPQTVNVPKGDCNVKATNSNVAKMTGFGLNKSAVEKAGDKAAAAKSAALDDEDDVQRKFRKLPDLALESTTSDVVAANGEDDQDDDVEDLRSDEEEAEAARQAAQKRAEEAQEEQDATMPDAETSAPATTSAAVADTAMELDEEVDPLDAFMDKLEEVPERRPQPSAAKRGAREPQLFDEDDGPDLDAVGDNPEDLLNPARRKKKEIPAVNHSKIDYEEFRKNFYNESIEVSEMTEDDVTTLRAELDNITVRGVDPPKPIMKWSQAGFGAQVLDVIRENKFQSPTSIQCQALPAIMSGRDTIGIAKTGSGKTLAFILPMFRHIKDQRPVANLEGPIGIIMAPTRELAVQIHRECKPYLKALGLRGVCAYGGAPIKDQIAELKRGAEVVVCTPGRMIDLLAANQGRVTNLRRVTYVVMDEADRMFDMGFEPQITRILGNVRPDRQTVLFSATFPKKMESLARKTLSKPVEIVVGGRSVVAPEITQIIEVRPEDTKFRRVLELLGNLHEEDEDARSLIFVERQETADHIFKELGKKGYPSVSVHGGREQIDRDQAILDFKSGAIPIMVATSVAARGLDVKQLKLVINFDSPNHGEDYVHRAGRTGRAGNTGTAVTFVTPEQDRYAPFLVRCLEDSKQEPPDGLKELAAAHKKKVEAGEASRAGSGFGGHGIERLDAARAAERAREKSMFKTGDEPEEENEEAKKEKDKKESDVEKLVSKAAGKVTDRDAQAEQTRQADIRTDLKTHLANALKVSKTETPAANAATISDPVQKALAAAASIGVRLGTKGSTRPGAPIDNRGPDAGAFHATLEINDFPQKARWAVTNRTNVAKILEATGTSITSKGVHYPPGKEINPGDEPKLYILVEGDTEIAVQSAMRELSRHLTEGTLQAQDAENRSGGGGRYRVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.15
5 0.15
6 0.13
7 0.12
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.13
17 0.17
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.17
23 0.17
24 0.19
25 0.15
26 0.13
27 0.14
28 0.15
29 0.18
30 0.19
31 0.25
32 0.26
33 0.37
34 0.36
35 0.37
36 0.41
37 0.43
38 0.44
39 0.38
40 0.33
41 0.25
42 0.28
43 0.28
44 0.23
45 0.17
46 0.13
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.17
52 0.22
53 0.26
54 0.27
55 0.28
56 0.37
57 0.46
58 0.51
59 0.5
60 0.47
61 0.48
62 0.55
63 0.58
64 0.51
65 0.51
66 0.5
67 0.52
68 0.59
69 0.64
70 0.6
71 0.57
72 0.59
73 0.57
74 0.6
75 0.62
76 0.63
77 0.59
78 0.62
79 0.65
80 0.7
81 0.67
82 0.65
83 0.64
84 0.64
85 0.67
86 0.66
87 0.71
88 0.73
89 0.77
90 0.78
91 0.71
92 0.66
93 0.64
94 0.6
95 0.6
96 0.52
97 0.51
98 0.53
99 0.6
100 0.64
101 0.66
102 0.72
103 0.72
104 0.79
105 0.8
106 0.81
107 0.82
108 0.77
109 0.77
110 0.79
111 0.79
112 0.77
113 0.79
114 0.79
115 0.8
116 0.84
117 0.84
118 0.85
119 0.85
120 0.87
121 0.88
122 0.89
123 0.9
124 0.92
125 0.9
126 0.91
127 0.91
128 0.92
129 0.91
130 0.91
131 0.9
132 0.86
133 0.85
134 0.82
135 0.82
136 0.82
137 0.8
138 0.8
139 0.8
140 0.83
141 0.8
142 0.77
143 0.76
144 0.72
145 0.73
146 0.71
147 0.71
148 0.64
149 0.7
150 0.67
151 0.64
152 0.66
153 0.66
154 0.67
155 0.68
156 0.75
157 0.75
158 0.82
159 0.86
160 0.86
161 0.86
162 0.86
163 0.85
164 0.83
165 0.83
166 0.84
167 0.84
168 0.82
169 0.84
170 0.82
171 0.83
172 0.79
173 0.74
174 0.69
175 0.68
176 0.71
177 0.71
178 0.7
179 0.71
180 0.77
181 0.81
182 0.87
183 0.87
184 0.88
185 0.86
186 0.86
187 0.83
188 0.83
189 0.79
190 0.75
191 0.67
192 0.58
193 0.52
194 0.5
195 0.5
196 0.46
197 0.45
198 0.45
199 0.49
200 0.56
201 0.61
202 0.63
203 0.64
204 0.66
205 0.7
206 0.72
207 0.69
208 0.62
209 0.6
210 0.55
211 0.48
212 0.44
213 0.41
214 0.33
215 0.31
216 0.33
217 0.32
218 0.32
219 0.36
220 0.34
221 0.32
222 0.34
223 0.35
224 0.35
225 0.35
226 0.35
227 0.35
228 0.36
229 0.33
230 0.31
231 0.31
232 0.35
233 0.39
234 0.4
235 0.41
236 0.44
237 0.51
238 0.53
239 0.5
240 0.47
241 0.46
242 0.48
243 0.51
244 0.51
245 0.5
246 0.53
247 0.59
248 0.57
249 0.57
250 0.57
251 0.57
252 0.54
253 0.53
254 0.48
255 0.46
256 0.49
257 0.51
258 0.52
259 0.53
260 0.53
261 0.5
262 0.57
263 0.55
264 0.49
265 0.46
266 0.38
267 0.31
268 0.26
269 0.23
270 0.15
271 0.12
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.18
283 0.25
284 0.25
285 0.25
286 0.23
287 0.24
288 0.27
289 0.24
290 0.2
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.17
295 0.16
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.17
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.21
308 0.25
309 0.31
310 0.32
311 0.36
312 0.42
313 0.47
314 0.58
315 0.62
316 0.62
317 0.59
318 0.67
319 0.69
320 0.69
321 0.65
322 0.6
323 0.62
324 0.63
325 0.61
326 0.54
327 0.46
328 0.37
329 0.35
330 0.3
331 0.22
332 0.15
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.07
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.12
354 0.16
355 0.18
356 0.16
357 0.17
358 0.16
359 0.2
360 0.24
361 0.22
362 0.23
363 0.24
364 0.26
365 0.28
366 0.28
367 0.33
368 0.31
369 0.32
370 0.27
371 0.25
372 0.23
373 0.2
374 0.21
375 0.16
376 0.15
377 0.14
378 0.15
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.14
383 0.1
384 0.12
385 0.13
386 0.12
387 0.15
388 0.14
389 0.13
390 0.16
391 0.16
392 0.16
393 0.15
394 0.14
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.08
399 0.07
400 0.06
401 0.1
402 0.12
403 0.13
404 0.13
405 0.16
406 0.19
407 0.2
408 0.23
409 0.23
410 0.3
411 0.31
412 0.36
413 0.4
414 0.42
415 0.42
416 0.4
417 0.36
418 0.28
419 0.26
420 0.21
421 0.13
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.07
451 0.1
452 0.12
453 0.17
454 0.19
455 0.19
456 0.22
457 0.24
458 0.24
459 0.23
460 0.24
461 0.23
462 0.22
463 0.22
464 0.19
465 0.18
466 0.17
467 0.16
468 0.14
469 0.1
470 0.07
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.03
501 0.03
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.06
506 0.08
507 0.09
508 0.12
509 0.19
510 0.21
511 0.22
512 0.23
513 0.24
514 0.33
515 0.39
516 0.44
517 0.45
518 0.47
519 0.47
520 0.53
521 0.55
522 0.52
523 0.47
524 0.42
525 0.38
526 0.36
527 0.36
528 0.3
529 0.27
530 0.2
531 0.18
532 0.16
533 0.12
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.05
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.08
547 0.12
548 0.17
549 0.24
550 0.32
551 0.34
552 0.41
553 0.49
554 0.55
555 0.59
556 0.64
557 0.64
558 0.66
559 0.75
560 0.7
561 0.63
562 0.54
563 0.45
564 0.37
565 0.33
566 0.26
567 0.22
568 0.26
569 0.24
570 0.28
571 0.29
572 0.29
573 0.27
574 0.25
575 0.24
576 0.18
577 0.21
578 0.18
579 0.16
580 0.16
581 0.14
582 0.13
583 0.09
584 0.09
585 0.05
586 0.04
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.07
597 0.08
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.09
602 0.12
603 0.13
604 0.14
605 0.13
606 0.16
607 0.18
608 0.18
609 0.19
610 0.19
611 0.21
612 0.22
613 0.21
614 0.22
615 0.21
616 0.21
617 0.2
618 0.17
619 0.13
620 0.09
621 0.1
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.1
629 0.12
630 0.13
631 0.13
632 0.16
633 0.19
634 0.21
635 0.24
636 0.27
637 0.25
638 0.23
639 0.24
640 0.21
641 0.18
642 0.15
643 0.11
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.06
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.09
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.09
661 0.08
662 0.1
663 0.09
664 0.07
665 0.07
666 0.09
667 0.08
668 0.12
669 0.14
670 0.12
671 0.19
672 0.2
673 0.28
674 0.31
675 0.35
676 0.36
677 0.37
678 0.38
679 0.34
680 0.35
681 0.28
682 0.24
683 0.19
684 0.14
685 0.11
686 0.1
687 0.08
688 0.04
689 0.04
690 0.03
691 0.03
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.06
697 0.09
698 0.15
699 0.17
700 0.22
701 0.23
702 0.26
703 0.26
704 0.29
705 0.28
706 0.25
707 0.25
708 0.24
709 0.25
710 0.25
711 0.32
712 0.28
713 0.25
714 0.22
715 0.21
716 0.16
717 0.13
718 0.11
719 0.07
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.09
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.11
728 0.13
729 0.15
730 0.15
731 0.15
732 0.15
733 0.15
734 0.15
735 0.11
736 0.09
737 0.08
738 0.13
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.12
743 0.11
744 0.1
745 0.09
746 0.06
747 0.08
748 0.08
749 0.11
750 0.11
751 0.1
752 0.1
753 0.1
754 0.08
755 0.1
756 0.13
757 0.16
758 0.19
759 0.2
760 0.2
761 0.22
762 0.23
763 0.22
764 0.2
765 0.15
766 0.12
767 0.12
768 0.12
769 0.1
770 0.09
771 0.07
772 0.06
773 0.05
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.07
781 0.08
782 0.08
783 0.08
784 0.08
785 0.12
786 0.14
787 0.21
788 0.25
789 0.26
790 0.28
791 0.29
792 0.3
793 0.27
794 0.26
795 0.2
796 0.21
797 0.19
798 0.18
799 0.24
800 0.24
801 0.25
802 0.24
803 0.24
804 0.19
805 0.2
806 0.27
807 0.28
808 0.33
809 0.39
810 0.42
811 0.43
812 0.44
813 0.5
814 0.44
815 0.37
816 0.31
817 0.23
818 0.23
819 0.21
820 0.2
821 0.14
822 0.12
823 0.11
824 0.1
825 0.09
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.05
830 0.04
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.07
835 0.07
836 0.09
837 0.1
838 0.11
839 0.11
840 0.12
841 0.18
842 0.21
843 0.26
844 0.25
845 0.27
846 0.28
847 0.27
848 0.29
849 0.28
850 0.31
851 0.27
852 0.27
853 0.26
854 0.23
855 0.22
856 0.19
857 0.14
858 0.09
859 0.09
860 0.07
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.07
865 0.08
866 0.09
867 0.08
868 0.1
869 0.11
870 0.13
871 0.13
872 0.13
873 0.16
874 0.19
875 0.18
876 0.18
877 0.17
878 0.18
879 0.23
880 0.26
881 0.26
882 0.22
883 0.23
884 0.24
885 0.27
886 0.28
887 0.25
888 0.24
889 0.29
890 0.29
891 0.3
892 0.3
893 0.29
894 0.27
895 0.27
896 0.26
897 0.2
898 0.21
899 0.2
900 0.18
901 0.17
902 0.15
903 0.16
904 0.14
905 0.13
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.09
910 0.09
911 0.06
912 0.06
913 0.05
914 0.06
915 0.06
916 0.04
917 0.04
918 0.05
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.04
923 0.06
924 0.07
925 0.13
926 0.14
927 0.14
928 0.16
929 0.18
930 0.2
931 0.19
932 0.2
933 0.17
934 0.2
935 0.2
936 0.19
937 0.22
938 0.22
939 0.22
940 0.22
941 0.19
942 0.16
943 0.17
944 0.24
945 0.24
946 0.24
947 0.23
948 0.22
949 0.24
950 0.29
951 0.32
952 0.28
953 0.25
954 0.29
955 0.3
956 0.29
957 0.29
958 0.24
959 0.19
960 0.16
961 0.14
962 0.09
963 0.09
964 0.08
965 0.1
966 0.11
967 0.12
968 0.14
969 0.16
970 0.16
971 0.2
972 0.23
973 0.22
974 0.21
975 0.24
976 0.24
977 0.23
978 0.24
979 0.24
980 0.22
981 0.24
982 0.27
983 0.28
984 0.3
985 0.29
986 0.28
987 0.27
988 0.29
989 0.29
990 0.26
991 0.21
992 0.18
993 0.19
994 0.25
995 0.31
996 0.29
997 0.28
998 0.31
999 0.31
1000 0.33
1001 0.33
1002 0.31
1003 0.29
1004 0.31
1005 0.37
1006 0.35
1007 0.36
1008 0.33
1009 0.31
1010 0.27
1011 0.21
1012 0.17
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.07
1017 0.08
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.09
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.09
1024 0.1
1025 0.12
1026 0.12
1027 0.13
1028 0.18
1029 0.22
1030 0.25
1031 0.29
1032 0.32
1033 0.31
1034 0.35
1035 0.43
1036 0.4
1037 0.37
1038 0.41
1039 0.39
1040 0.41
1041 0.43
1042 0.39
1043 0.32
1044 0.35
1045 0.34
1046 0.27
1047 0.26
1048 0.21
1049 0.19
1050 0.19
1051 0.26
1052 0.3
1053 0.37
1054 0.46
1055 0.51
1056 0.55
1057 0.64
1058 0.7
1059 0.68
1060 0.68
1061 0.62
1062 0.56
1063 0.52
1064 0.47
1065 0.38
1066 0.31
1067 0.27
1068 0.22
1069 0.26
1070 0.24
1071 0.26
1072 0.3
1073 0.34
1074 0.34
1075 0.34
1076 0.32
1077 0.32
1078 0.35
1079 0.36
1080 0.34
1081 0.3
1082 0.31
1083 0.28
1084 0.28
1085 0.26
1086 0.24
1087 0.27
1088 0.27
1089 0.27
1090 0.27
1091 0.3
1092 0.31
1093 0.28
1094 0.32
1095 0.29
1096 0.27
1097 0.3
1098 0.35
1099 0.32
1100 0.31
1101 0.35
1102 0.32
1103 0.31
1104 0.35
1105 0.32
1106 0.29
1107 0.31
1108 0.32
1109 0.28
1110 0.24
1111 0.22
1112 0.18
1113 0.17
1114 0.15
1115 0.18
1116 0.17
1117 0.16
1118 0.17
1119 0.15
1120 0.14
1121 0.14
1122 0.13
1123 0.07
1124 0.07
1125 0.08
1126 0.08
1127 0.08
1128 0.08
1129 0.07
1130 0.06
1131 0.06
1132 0.08
1133 0.08
1134 0.1
1135 0.14
1136 0.18
1137 0.22
1138 0.23
1139 0.26
1140 0.3
1141 0.36
1142 0.37
1143 0.42
1144 0.44
1145 0.46
1146 0.46
1147 0.43
1148 0.39
1149 0.31
1150 0.3
1151 0.23
1152 0.19
1153 0.14
1154 0.13
1155 0.15
1156 0.14
1157 0.14
1158 0.16
1159 0.15
1160 0.14
1161 0.18
1162 0.18
1163 0.17
1164 0.21
1165 0.24
1166 0.23
1167 0.24
1168 0.29
1169 0.33
1170 0.41
1171 0.49
1172 0.53
1173 0.54
1174 0.58
1175 0.57
1176 0.5
1177 0.46
1178 0.41
1179 0.33
1180 0.26
1181 0.23
1182 0.18
1183 0.18
1184 0.18
1185 0.17
1186 0.14
1187 0.13
1188 0.11
1189 0.12
1190 0.12
1191 0.17
1192 0.19
1193 0.26
1194 0.3
1195 0.33
1196 0.4
1197 0.47
1198 0.47
1199 0.46
1200 0.45
1201 0.44
1202 0.48
1203 0.47
1204 0.43
1205 0.36
1206 0.36
1207 0.33
1208 0.34
1209 0.27
1210 0.2
1211 0.18
1212 0.16
1213 0.14
1214 0.13
1215 0.12
1216 0.09
1217 0.09
1218 0.08
1219 0.07
1220 0.06
1221 0.05
1222 0.05
1223 0.08
1224 0.09
1225 0.09
1226 0.1
1227 0.13
1228 0.2
1229 0.22
1230 0.23
1231 0.21
1232 0.22
1233 0.23
1234 0.27
1235 0.28
1236 0.23
1237 0.2
1238 0.2
1239 0.22
1240 0.24
1241 0.26
1242 0.24
1243 0.21
1244 0.19
1245 0.2
1246 0.21
1247 0.19
1248 0.22