Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HFE2

Protein Details
Accession A0A139HFE2    Localization Confidence High Confidence Score 24.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MKGKRSKQYRKLMQHYQLNFNFHydrophilic
206-242HEAPKPKKYKVKGPKAPNPLSVKKPKKDNVKDKQQGEBasic
269-297EGAGEEGQKKRKRKRKPKEPKVAATHGHEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-192EKAKIRAGVKGRRQTGTGEKRKR
209-252PKPKKYKVKGPKAPNPLSVKKPKKDNVKDKQQGEGQRAALRKFK
274-289EGQKKRKRKRKPKEPK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MKGKRSKQYRKLMQHYQLNFNFRQPYQVILDADIIKDAARFKMHLGKMLQNTLHGEIKPMITQCCIRHLYNEPASPEKDAWISVAKDAERRRCGHHELEEPLSALECIESVVDPKHTGNNKHRYVVAVQDDQVRRKMRKVVGVPLVYIARSVMILEPMAHATQEVREKDEKAKIRAGVKGRRQTGTGEKRKRDDEDADDEKENETHEAPKPKKYKVKGPKAPNPLSVKKPKKDNVKDKQQGEGQRAALRKFKQESQPGDRPAGASEAAEGAGEEGQKKRKRKRKPKEPKVAATHGHESGSED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.82
3 0.81
4 0.76
5 0.71
6 0.63
7 0.59
8 0.55
9 0.46
10 0.47
11 0.37
12 0.35
13 0.33
14 0.37
15 0.33
16 0.28
17 0.32
18 0.26
19 0.26
20 0.22
21 0.18
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.13
27 0.14
28 0.17
29 0.26
30 0.27
31 0.32
32 0.34
33 0.38
34 0.41
35 0.46
36 0.43
37 0.35
38 0.37
39 0.35
40 0.35
41 0.27
42 0.26
43 0.22
44 0.23
45 0.23
46 0.22
47 0.2
48 0.18
49 0.23
50 0.22
51 0.27
52 0.3
53 0.28
54 0.3
55 0.35
56 0.41
57 0.43
58 0.45
59 0.41
60 0.41
61 0.42
62 0.39
63 0.34
64 0.27
65 0.21
66 0.18
67 0.16
68 0.17
69 0.16
70 0.15
71 0.18
72 0.17
73 0.22
74 0.28
75 0.34
76 0.35
77 0.37
78 0.42
79 0.44
80 0.49
81 0.49
82 0.5
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.4
87 0.35
88 0.29
89 0.24
90 0.17
91 0.12
92 0.07
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.15
103 0.19
104 0.26
105 0.34
106 0.43
107 0.45
108 0.46
109 0.46
110 0.41
111 0.38
112 0.37
113 0.33
114 0.24
115 0.23
116 0.28
117 0.29
118 0.29
119 0.34
120 0.32
121 0.28
122 0.3
123 0.36
124 0.32
125 0.38
126 0.4
127 0.41
128 0.43
129 0.43
130 0.4
131 0.34
132 0.31
133 0.23
134 0.2
135 0.13
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.08
150 0.13
151 0.13
152 0.16
153 0.17
154 0.19
155 0.24
156 0.31
157 0.33
158 0.31
159 0.34
160 0.35
161 0.36
162 0.4
163 0.43
164 0.44
165 0.48
166 0.52
167 0.51
168 0.49
169 0.47
170 0.45
171 0.48
172 0.5
173 0.53
174 0.54
175 0.55
176 0.58
177 0.61
178 0.6
179 0.55
180 0.49
181 0.44
182 0.44
183 0.43
184 0.42
185 0.39
186 0.36
187 0.32
188 0.27
189 0.23
190 0.16
191 0.12
192 0.13
193 0.18
194 0.27
195 0.29
196 0.37
197 0.42
198 0.48
199 0.56
200 0.57
201 0.63
202 0.64
203 0.73
204 0.73
205 0.78
206 0.8
207 0.82
208 0.81
209 0.78
210 0.75
211 0.7
212 0.69
213 0.7
214 0.7
215 0.66
216 0.72
217 0.71
218 0.74
219 0.79
220 0.82
221 0.81
222 0.83
223 0.86
224 0.78
225 0.77
226 0.73
227 0.67
228 0.62
229 0.56
230 0.48
231 0.44
232 0.46
233 0.42
234 0.42
235 0.39
236 0.42
237 0.41
238 0.45
239 0.49
240 0.55
241 0.61
242 0.63
243 0.69
244 0.64
245 0.63
246 0.57
247 0.48
248 0.41
249 0.35
250 0.26
251 0.17
252 0.14
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.14
262 0.23
263 0.31
264 0.41
265 0.51
266 0.59
267 0.7
268 0.79
269 0.86
270 0.88
271 0.93
272 0.95
273 0.95
274 0.96
275 0.95
276 0.93
277 0.9
278 0.84
279 0.79
280 0.74
281 0.64
282 0.54