Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HKJ6

Protein Details
Accession A0A139HKJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
214-255LVCAVCRRRRYCSKECQRYDYRRHKRFCRKPGGERGMPRRSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-254KRFCRKPGGERGMPRRS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01753  zf-MYND  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01360  ZF_MYND_1  
PS50865  ZF_MYND_2  
Amino Acid Sequences MSNSEADRDQDLIDAVTWRPGQPEENGNLVEFGTRIVITRRMFNEPGWMLSRASEMLGFPLKIRCARAPDPSLNRQEMIRRQNSLACYLTLYLNTPGPTTLGLGTGGAGDIIDEVVFVRQDGGPLQLQHIDVLYIFATSHTDIMQYQLGDFPGRAAEAQRIWAQFTPRAFARCLEDERRNPHEDTGSLEGVESPILQLCGRCCEEKQDDGSPMLVCAVCRRRRYCSKECQRYDYRRHKRFCRKPGGERGMPRRSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.18
7 0.19
8 0.2
9 0.23
10 0.29
11 0.27
12 0.3
13 0.3
14 0.28
15 0.27
16 0.24
17 0.2
18 0.13
19 0.11
20 0.08
21 0.07
22 0.08
23 0.11
24 0.17
25 0.18
26 0.25
27 0.28
28 0.32
29 0.34
30 0.33
31 0.39
32 0.33
33 0.36
34 0.33
35 0.31
36 0.25
37 0.24
38 0.25
39 0.16
40 0.16
41 0.13
42 0.1
43 0.11
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.15
48 0.18
49 0.19
50 0.23
51 0.23
52 0.28
53 0.32
54 0.38
55 0.41
56 0.46
57 0.51
58 0.54
59 0.56
60 0.51
61 0.48
62 0.42
63 0.43
64 0.43
65 0.44
66 0.41
67 0.38
68 0.38
69 0.41
70 0.41
71 0.38
72 0.31
73 0.23
74 0.2
75 0.18
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.03
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.15
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.19
155 0.21
156 0.2
157 0.2
158 0.22
159 0.23
160 0.28
161 0.31
162 0.37
163 0.4
164 0.46
165 0.51
166 0.49
167 0.46
168 0.43
169 0.4
170 0.33
171 0.32
172 0.3
173 0.25
174 0.21
175 0.2
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.09
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.09
186 0.14
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.25
191 0.3
192 0.33
193 0.36
194 0.35
195 0.35
196 0.34
197 0.36
198 0.28
199 0.23
200 0.21
201 0.17
202 0.12
203 0.18
204 0.26
205 0.32
206 0.39
207 0.43
208 0.51
209 0.61
210 0.7
211 0.71
212 0.74
213 0.78
214 0.81
215 0.83
216 0.83
217 0.83
218 0.84
219 0.85
220 0.85
221 0.85
222 0.84
223 0.86
224 0.88
225 0.9
226 0.91
227 0.9
228 0.9
229 0.89
230 0.9
231 0.92
232 0.91
233 0.88
234 0.86
235 0.85
236 0.83