Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139H9M5

Protein Details
Accession A0A139H9M5    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MADLEAKKRKRQSNGIDRPNKRIAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-14KKRKRQSN
308-315AGKKLPKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 4, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MADLEAKKRKRQSNGIDRPNKRIAGDKIKLIHLDGETGAHPVLLTAPGVKTPQVPFKAYSKPRSSKHANAPVKPSTHDLLLHSSQHPKLDYTATPTLGEDDLKHYVCIFDPASNTLQVAEAHHLTLTSTLRSEIFDLDEAEKERLSNAKQREALGSEFGTKKAKKAIAAKTENAIIGDRKGKSKITDVESAILESVGETTAGAASKASEKEIADALLAAKPIPRPNIEAEHPEQVYTFEALVGDAQQYIKIKDWQDKAKAGDAVEFKGIQYPATRLKFVADDPRKLKALKYLTLLLEFHNVLSNAGKAGKKLPKKEVVQKRLPPSRWSEQLVDSVRRRFTDESGQELGKWQMDNLYTHICALALFIDNMEVDIWLLKEDTKLDIRTLGQYFHELGARVGPVTEAERTRREMTKAQAAATRMARLKLPLQFPQTRKGRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.88
3 0.89
4 0.85
5 0.84
6 0.81
7 0.72
8 0.62
9 0.6
10 0.58
11 0.58
12 0.58
13 0.56
14 0.53
15 0.54
16 0.53
17 0.46
18 0.41
19 0.31
20 0.29
21 0.23
22 0.2
23 0.17
24 0.17
25 0.16
26 0.11
27 0.1
28 0.08
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.09
34 0.11
35 0.13
36 0.14
37 0.17
38 0.2
39 0.29
40 0.31
41 0.33
42 0.34
43 0.39
44 0.49
45 0.52
46 0.57
47 0.59
48 0.63
49 0.64
50 0.7
51 0.73
52 0.72
53 0.75
54 0.76
55 0.74
56 0.71
57 0.74
58 0.71
59 0.65
60 0.58
61 0.51
62 0.42
63 0.37
64 0.33
65 0.28
66 0.29
67 0.3
68 0.31
69 0.3
70 0.33
71 0.33
72 0.34
73 0.33
74 0.27
75 0.26
76 0.27
77 0.26
78 0.27
79 0.3
80 0.28
81 0.27
82 0.26
83 0.25
84 0.22
85 0.21
86 0.15
87 0.15
88 0.18
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.19
95 0.15
96 0.13
97 0.14
98 0.17
99 0.19
100 0.18
101 0.18
102 0.14
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.16
133 0.21
134 0.24
135 0.3
136 0.32
137 0.33
138 0.34
139 0.33
140 0.32
141 0.27
142 0.23
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.24
147 0.22
148 0.22
149 0.27
150 0.28
151 0.29
152 0.36
153 0.43
154 0.47
155 0.51
156 0.5
157 0.45
158 0.44
159 0.39
160 0.32
161 0.24
162 0.15
163 0.13
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.19
168 0.2
169 0.21
170 0.26
171 0.3
172 0.29
173 0.33
174 0.32
175 0.32
176 0.31
177 0.29
178 0.23
179 0.16
180 0.12
181 0.06
182 0.06
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.08
208 0.1
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.16
213 0.21
214 0.21
215 0.24
216 0.24
217 0.26
218 0.25
219 0.23
220 0.21
221 0.17
222 0.16
223 0.13
224 0.1
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.14
238 0.16
239 0.22
240 0.28
241 0.33
242 0.36
243 0.39
244 0.39
245 0.38
246 0.38
247 0.31
248 0.31
249 0.26
250 0.23
251 0.2
252 0.18
253 0.14
254 0.16
255 0.16
256 0.12
257 0.12
258 0.14
259 0.21
260 0.23
261 0.23
262 0.2
263 0.21
264 0.22
265 0.23
266 0.31
267 0.27
268 0.32
269 0.34
270 0.38
271 0.39
272 0.38
273 0.37
274 0.34
275 0.34
276 0.31
277 0.32
278 0.33
279 0.31
280 0.33
281 0.32
282 0.25
283 0.22
284 0.19
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.2
296 0.27
297 0.33
298 0.39
299 0.46
300 0.51
301 0.57
302 0.67
303 0.7
304 0.71
305 0.74
306 0.75
307 0.77
308 0.78
309 0.74
310 0.68
311 0.65
312 0.63
313 0.59
314 0.56
315 0.5
316 0.43
317 0.47
318 0.48
319 0.47
320 0.45
321 0.44
322 0.43
323 0.4
324 0.42
325 0.36
326 0.35
327 0.38
328 0.36
329 0.37
330 0.38
331 0.38
332 0.34
333 0.34
334 0.32
335 0.24
336 0.21
337 0.15
338 0.15
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.15
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.1
366 0.14
367 0.18
368 0.19
369 0.19
370 0.22
371 0.23
372 0.28
373 0.29
374 0.27
375 0.23
376 0.24
377 0.25
378 0.24
379 0.24
380 0.18
381 0.17
382 0.18
383 0.18
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.13
389 0.18
390 0.19
391 0.23
392 0.27
393 0.32
394 0.37
395 0.41
396 0.44
397 0.45
398 0.48
399 0.53
400 0.51
401 0.49
402 0.48
403 0.45
404 0.46
405 0.42
406 0.42
407 0.35
408 0.35
409 0.33
410 0.33
411 0.37
412 0.38
413 0.41
414 0.42
415 0.48
416 0.55
417 0.56
418 0.63
419 0.66