Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HJB3

Protein Details
Accession A0A139HJB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-50TTTTIAKAKMRPRPRARPTSSHAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-42KMRPRPRAR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002716  PIN_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
Amino Acid Sequences MKAMPDTDTNTDTDTQPPPAAIPTATTTTIAKAKMRPRPRARPTSSHAAQTHTQTPRAPRPPALRPARRVFNCIVDDSALVAGVKRSTRNGIRQWVKHGQIRLFVPLHALEELSRQKNGKNKHSEDVRETLQWLDEATTNSPDVVTLQGADETYERWAQVERFAVPRTLFSENNHEHELDLVESNASYEDHAGTADKSEQPVKEAASSVASDLTRSLSPSSLRSMHSSASPVSPPTSPQKASISPVPQMASLSLAGTRPTSSSASVPQPLQPLFNYILWRVHQEVDPVAALESFIFLCNDPRKVSFAKGFDIKTKRLEQLREAISREDRDYKNRLALQNKESQNLGAQSQAPPQGKATDVELNEEEPLFKPPKAPAAMLQKHQSNIIDPNDFSRGGQAQQTIKTVQADLPPPSFRASHVNHRGSPRGHQALPFAPRGSFRGRGNFRGAPRAHGGGLFHGRGGFNNGPVASTETATAASQIDPNSFTRPVSRGAPNSTRGSRKLWVPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.25
4 0.24
5 0.22
6 0.22
7 0.23
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.2
15 0.22
16 0.26
17 0.26
18 0.27
19 0.31
20 0.39
21 0.47
22 0.56
23 0.63
24 0.69
25 0.78
26 0.84
27 0.87
28 0.86
29 0.85
30 0.83
31 0.83
32 0.76
33 0.73
34 0.65
35 0.59
36 0.55
37 0.51
38 0.53
39 0.46
40 0.46
41 0.41
42 0.47
43 0.53
44 0.57
45 0.55
46 0.54
47 0.58
48 0.64
49 0.7
50 0.73
51 0.71
52 0.71
53 0.76
54 0.79
55 0.73
56 0.7
57 0.62
58 0.6
59 0.54
60 0.47
61 0.4
62 0.31
63 0.28
64 0.24
65 0.21
66 0.13
67 0.1
68 0.09
69 0.08
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.16
74 0.23
75 0.29
76 0.37
77 0.43
78 0.51
79 0.58
80 0.6
81 0.65
82 0.67
83 0.66
84 0.62
85 0.61
86 0.53
87 0.5
88 0.48
89 0.46
90 0.38
91 0.33
92 0.3
93 0.25
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.11
98 0.16
99 0.23
100 0.23
101 0.25
102 0.24
103 0.28
104 0.34
105 0.42
106 0.46
107 0.49
108 0.52
109 0.57
110 0.64
111 0.66
112 0.64
113 0.61
114 0.54
115 0.44
116 0.41
117 0.33
118 0.26
119 0.21
120 0.16
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.16
149 0.18
150 0.2
151 0.22
152 0.2
153 0.21
154 0.21
155 0.22
156 0.22
157 0.21
158 0.3
159 0.29
160 0.33
161 0.33
162 0.29
163 0.25
164 0.24
165 0.23
166 0.14
167 0.12
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.2
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.12
219 0.13
220 0.12
221 0.14
222 0.18
223 0.21
224 0.2
225 0.22
226 0.25
227 0.25
228 0.27
229 0.3
230 0.26
231 0.23
232 0.24
233 0.22
234 0.19
235 0.17
236 0.15
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.13
251 0.15
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.19
267 0.17
268 0.17
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.09
285 0.12
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.19
290 0.2
291 0.24
292 0.25
293 0.24
294 0.26
295 0.29
296 0.3
297 0.34
298 0.37
299 0.36
300 0.36
301 0.37
302 0.39
303 0.4
304 0.41
305 0.36
306 0.4
307 0.43
308 0.41
309 0.39
310 0.36
311 0.34
312 0.34
313 0.33
314 0.33
315 0.3
316 0.32
317 0.36
318 0.35
319 0.39
320 0.42
321 0.44
322 0.42
323 0.47
324 0.46
325 0.5
326 0.5
327 0.44
328 0.4
329 0.35
330 0.31
331 0.27
332 0.22
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.18
337 0.24
338 0.22
339 0.21
340 0.22
341 0.21
342 0.21
343 0.2
344 0.2
345 0.19
346 0.19
347 0.21
348 0.21
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.16
353 0.11
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.16
358 0.17
359 0.25
360 0.26
361 0.26
362 0.28
363 0.37
364 0.42
365 0.43
366 0.47
367 0.43
368 0.41
369 0.42
370 0.36
371 0.28
372 0.29
373 0.29
374 0.27
375 0.24
376 0.26
377 0.27
378 0.26
379 0.23
380 0.21
381 0.19
382 0.17
383 0.2
384 0.22
385 0.23
386 0.25
387 0.28
388 0.24
389 0.25
390 0.24
391 0.23
392 0.21
393 0.22
394 0.24
395 0.25
396 0.28
397 0.27
398 0.27
399 0.28
400 0.26
401 0.23
402 0.27
403 0.29
404 0.36
405 0.45
406 0.5
407 0.52
408 0.57
409 0.62
410 0.55
411 0.56
412 0.55
413 0.51
414 0.47
415 0.44
416 0.44
417 0.44
418 0.46
419 0.43
420 0.35
421 0.3
422 0.3
423 0.32
424 0.33
425 0.32
426 0.32
427 0.39
428 0.43
429 0.47
430 0.53
431 0.55
432 0.52
433 0.56
434 0.53
435 0.47
436 0.47
437 0.44
438 0.37
439 0.33
440 0.31
441 0.28
442 0.33
443 0.28
444 0.24
445 0.23
446 0.22
447 0.22
448 0.29
449 0.24
450 0.19
451 0.23
452 0.22
453 0.21
454 0.22
455 0.25
456 0.19
457 0.18
458 0.17
459 0.14
460 0.15
461 0.14
462 0.14
463 0.11
464 0.11
465 0.13
466 0.14
467 0.15
468 0.16
469 0.18
470 0.22
471 0.22
472 0.22
473 0.24
474 0.25
475 0.28
476 0.32
477 0.38
478 0.39
479 0.47
480 0.52
481 0.53
482 0.59
483 0.62
484 0.62
485 0.58
486 0.58
487 0.54