Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HH41

Protein Details
Accession A0A139HH41    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-48RFAAKPWKGKRVPREWPAKPBasic
225-246DAKGAPDAKKRKKQNQVNTGEIHydrophilic
256-300SPPSKPSKSSKGSKGKKDKVTSGRVTKSSKKPSSRRASSKNYSSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-58AKPWKGKRVPREWPAKPINAKKWIRPK
233-236KKRK
259-293SKPSKSSKGSKGKKDKVTSGRVTKSSKKPSSRRAS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001214  SET_dom  
IPR046341  SET_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00856  SET  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50280  SET  
Amino Acid Sequences MAGPFTVYSPGRPGGYLHTAGPERIEEFRFAAKPWKGKRVPREWPAKPINAKKWIRPKSVGDVLHNEYPDECVHCGGVEADDCGEQCIEQYRNANFKYEAEIRPAKFDLGAFNGKEKLPKDKYIGEYLGCLIPINEAPDSMYRMTVEGIFCVDANSAGNWTRYINSSCTPNLHCRRVCIGKRFGLFFHTLREILPGEELTFAYGYDYFAGKGMKCGCDWKPELHDAKGAPDAKKRKKQNQVNTGEITDESTEEEASPPSKPSKSSKGSKGKKDKVTSGRVTKSSKKPSSRRASSKNYSSMESASKNNKDKVTSGRVTKSSKNLSSRRASSKNYSSMGSTSKGNKDKVTSGRVTRSTPEASSKRAASKDHSMFIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.3
3 0.3
4 0.26
5 0.3
6 0.3
7 0.3
8 0.3
9 0.25
10 0.22
11 0.24
12 0.25
13 0.2
14 0.21
15 0.27
16 0.26
17 0.26
18 0.33
19 0.35
20 0.43
21 0.47
22 0.56
23 0.58
24 0.65
25 0.74
26 0.75
27 0.79
28 0.79
29 0.83
30 0.77
31 0.79
32 0.78
33 0.76
34 0.75
35 0.75
36 0.74
37 0.74
38 0.74
39 0.73
40 0.76
41 0.77
42 0.75
43 0.71
44 0.68
45 0.66
46 0.71
47 0.66
48 0.59
49 0.57
50 0.54
51 0.52
52 0.46
53 0.38
54 0.29
55 0.27
56 0.24
57 0.2
58 0.16
59 0.12
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.21
78 0.24
79 0.31
80 0.32
81 0.35
82 0.3
83 0.29
84 0.33
85 0.35
86 0.32
87 0.32
88 0.37
89 0.35
90 0.38
91 0.37
92 0.31
93 0.25
94 0.24
95 0.2
96 0.19
97 0.22
98 0.19
99 0.2
100 0.22
101 0.22
102 0.25
103 0.24
104 0.29
105 0.29
106 0.33
107 0.36
108 0.39
109 0.42
110 0.44
111 0.44
112 0.35
113 0.31
114 0.28
115 0.24
116 0.18
117 0.14
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.17
154 0.18
155 0.2
156 0.22
157 0.29
158 0.33
159 0.38
160 0.38
161 0.37
162 0.42
163 0.48
164 0.5
165 0.48
166 0.47
167 0.44
168 0.45
169 0.44
170 0.39
171 0.32
172 0.3
173 0.23
174 0.21
175 0.18
176 0.16
177 0.15
178 0.17
179 0.14
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.18
203 0.18
204 0.24
205 0.26
206 0.25
207 0.27
208 0.33
209 0.36
210 0.32
211 0.34
212 0.27
213 0.28
214 0.31
215 0.3
216 0.25
217 0.3
218 0.39
219 0.45
220 0.53
221 0.6
222 0.64
223 0.71
224 0.79
225 0.83
226 0.83
227 0.81
228 0.78
229 0.71
230 0.61
231 0.51
232 0.41
233 0.32
234 0.21
235 0.15
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.14
246 0.16
247 0.19
248 0.24
249 0.33
250 0.4
251 0.47
252 0.56
253 0.63
254 0.7
255 0.77
256 0.82
257 0.82
258 0.83
259 0.81
260 0.8
261 0.77
262 0.78
263 0.75
264 0.73
265 0.69
266 0.66
267 0.67
268 0.67
269 0.68
270 0.69
271 0.7
272 0.71
273 0.74
274 0.79
275 0.84
276 0.85
277 0.85
278 0.83
279 0.84
280 0.82
281 0.82
282 0.79
283 0.71
284 0.63
285 0.55
286 0.48
287 0.43
288 0.38
289 0.36
290 0.37
291 0.42
292 0.46
293 0.5
294 0.5
295 0.48
296 0.49
297 0.51
298 0.52
299 0.5
300 0.5
301 0.51
302 0.54
303 0.56
304 0.58
305 0.58
306 0.58
307 0.59
308 0.62
309 0.63
310 0.65
311 0.69
312 0.7
313 0.71
314 0.69
315 0.68
316 0.67
317 0.69
318 0.68
319 0.61
320 0.55
321 0.48
322 0.44
323 0.41
324 0.34
325 0.32
326 0.31
327 0.38
328 0.43
329 0.44
330 0.45
331 0.46
332 0.52
333 0.54
334 0.55
335 0.53
336 0.54
337 0.59
338 0.6
339 0.59
340 0.54
341 0.52
342 0.48
343 0.44
344 0.47
345 0.42
346 0.44
347 0.46
348 0.48
349 0.49
350 0.5
351 0.5
352 0.47
353 0.54
354 0.54