Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HMK6

Protein Details
Accession A0A139HMK6    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-52LARSYATRRRRDENERGSKQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 11, nucl 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MPSCHSAIRTLLRKCASQSPANHTKWHLRQQHLARSYATRRRRDENERGSKQGLSSLDAESPYLDLILGPRENDAVTQNNQPAQDHAEQIAEEAEAEAEHHTYTYRDSSVPSSTARMPRRARASTPQPYGLNTDHTFTSDLPTTGDAGRHAHFSQQSARQLDWDWHSHICMLIEHVKDVRSKSDAGELPPLTIAPEAIDELDRVIEELDKLEQVTLGCLRQIINPNLWPYALLWLLHHDPDRSLNFLLATFGHGHQQEICIRHSLKYLAWLYSSQVNISAIDKLVEVAFALSEADVRFQHHKYHGRWYIPIIPYCSKETRVRFFEDLTDISKVYKVHWFTWLPFVRPFARDNQIDLALSAILEANAAGAPWDSRAFRGECAILLRSSIRQTGGLRACISIVNALVRIGLSLDNGLANIIMLNAVEAGDLKTAFSIYHSLVDHGLQADAYTYAILLKGCKANLDDAEMLNATIRDALSRIDVHKEGVLSTEILHCLALYHTKNNSERAFETVADAYAQLHDLGPLREIGLMPSKLSHIESSSEARPMPTCRGMYIMIATYLENTFPSEDADVKGAHALYQRFKSAAEAGKEPFVSLAAVDYTFNAFLCTFIKFKRGLLYAAELVKDMQGKNRPKDAEIPFCQPTVYTWSIFVDGFTRHGQMQLAEQVLNYMRTKGIEPNRVTYNTLVKGYAKEQDAEGMIDALRRMEADGNTWDEWTVKGTKRLRDKAALNEEFKRQRQAQALDFTADLRSGLEQRLSKAKMEEVREIRGGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.51
4 0.5
5 0.53
6 0.55
7 0.62
8 0.62
9 0.62
10 0.58
11 0.62
12 0.64
13 0.67
14 0.67
15 0.62
16 0.69
17 0.74
18 0.79
19 0.73
20 0.67
21 0.6
22 0.6
23 0.63
24 0.63
25 0.64
26 0.62
27 0.63
28 0.69
29 0.75
30 0.77
31 0.78
32 0.8
33 0.82
34 0.78
35 0.78
36 0.72
37 0.64
38 0.55
39 0.49
40 0.4
41 0.31
42 0.28
43 0.24
44 0.24
45 0.23
46 0.22
47 0.17
48 0.16
49 0.13
50 0.1
51 0.08
52 0.06
53 0.07
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.2
64 0.25
65 0.28
66 0.31
67 0.32
68 0.31
69 0.29
70 0.31
71 0.3
72 0.27
73 0.24
74 0.22
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.13
79 0.1
80 0.08
81 0.07
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.1
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.17
95 0.2
96 0.23
97 0.24
98 0.23
99 0.24
100 0.28
101 0.36
102 0.39
103 0.45
104 0.47
105 0.52
106 0.6
107 0.6
108 0.59
109 0.6
110 0.65
111 0.66
112 0.66
113 0.64
114 0.57
115 0.54
116 0.53
117 0.45
118 0.42
119 0.33
120 0.3
121 0.24
122 0.25
123 0.25
124 0.2
125 0.22
126 0.18
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.16
136 0.19
137 0.18
138 0.21
139 0.22
140 0.24
141 0.29
142 0.33
143 0.39
144 0.38
145 0.38
146 0.34
147 0.34
148 0.36
149 0.33
150 0.29
151 0.26
152 0.24
153 0.25
154 0.23
155 0.23
156 0.19
157 0.15
158 0.15
159 0.18
160 0.18
161 0.19
162 0.2
163 0.21
164 0.23
165 0.24
166 0.23
167 0.2
168 0.2
169 0.2
170 0.27
171 0.27
172 0.27
173 0.33
174 0.3
175 0.28
176 0.27
177 0.26
178 0.18
179 0.16
180 0.13
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.14
208 0.22
209 0.22
210 0.24
211 0.26
212 0.28
213 0.28
214 0.27
215 0.23
216 0.16
217 0.17
218 0.15
219 0.12
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.17
224 0.18
225 0.15
226 0.15
227 0.19
228 0.2
229 0.19
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.15
235 0.1
236 0.11
237 0.1
238 0.1
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.16
244 0.18
245 0.18
246 0.19
247 0.2
248 0.21
249 0.22
250 0.23
251 0.22
252 0.18
253 0.24
254 0.24
255 0.2
256 0.21
257 0.2
258 0.19
259 0.22
260 0.21
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.12
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.03
277 0.04
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.06
282 0.06
283 0.09
284 0.13
285 0.14
286 0.19
287 0.25
288 0.33
289 0.33
290 0.43
291 0.47
292 0.45
293 0.45
294 0.45
295 0.46
296 0.42
297 0.42
298 0.36
299 0.32
300 0.32
301 0.35
302 0.33
303 0.29
304 0.32
305 0.35
306 0.38
307 0.39
308 0.41
309 0.38
310 0.37
311 0.35
312 0.31
313 0.27
314 0.22
315 0.19
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.13
320 0.12
321 0.16
322 0.17
323 0.17
324 0.22
325 0.23
326 0.22
327 0.32
328 0.33
329 0.3
330 0.28
331 0.3
332 0.27
333 0.27
334 0.28
335 0.23
336 0.27
337 0.25
338 0.26
339 0.25
340 0.23
341 0.21
342 0.2
343 0.15
344 0.09
345 0.08
346 0.07
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.02
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.11
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.09
370 0.09
371 0.1
372 0.09
373 0.1
374 0.11
375 0.09
376 0.11
377 0.11
378 0.18
379 0.2
380 0.2
381 0.19
382 0.19
383 0.19
384 0.17
385 0.16
386 0.09
387 0.08
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.02
410 0.02
411 0.02
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.07
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.12
448 0.13
449 0.16
450 0.15
451 0.13
452 0.14
453 0.13
454 0.12
455 0.1
456 0.09
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.07
464 0.09
465 0.1
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.15
470 0.14
471 0.12
472 0.12
473 0.12
474 0.09
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.06
482 0.07
483 0.12
484 0.12
485 0.16
486 0.18
487 0.24
488 0.26
489 0.31
490 0.32
491 0.3
492 0.29
493 0.29
494 0.3
495 0.24
496 0.24
497 0.19
498 0.17
499 0.14
500 0.13
501 0.1
502 0.08
503 0.08
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.16
522 0.15
523 0.1
524 0.12
525 0.14
526 0.18
527 0.18
528 0.19
529 0.18
530 0.18
531 0.19
532 0.2
533 0.23
534 0.24
535 0.23
536 0.22
537 0.24
538 0.24
539 0.22
540 0.21
541 0.17
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.12
560 0.11
561 0.12
562 0.15
563 0.17
564 0.2
565 0.22
566 0.23
567 0.22
568 0.23
569 0.23
570 0.25
571 0.28
572 0.26
573 0.27
574 0.27
575 0.29
576 0.29
577 0.27
578 0.21
579 0.15
580 0.12
581 0.09
582 0.09
583 0.06
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.08
592 0.08
593 0.09
594 0.11
595 0.12
596 0.13
597 0.17
598 0.17
599 0.19
600 0.25
601 0.25
602 0.25
603 0.25
604 0.29
605 0.28
606 0.29
607 0.28
608 0.21
609 0.19
610 0.2
611 0.21
612 0.16
613 0.19
614 0.27
615 0.35
616 0.4
617 0.48
618 0.47
619 0.46
620 0.55
621 0.56
622 0.57
623 0.53
624 0.54
625 0.48
626 0.46
627 0.44
628 0.35
629 0.29
630 0.27
631 0.25
632 0.19
633 0.19
634 0.2
635 0.22
636 0.21
637 0.2
638 0.15
639 0.13
640 0.16
641 0.16
642 0.17
643 0.15
644 0.17
645 0.17
646 0.16
647 0.18
648 0.2
649 0.2
650 0.18
651 0.17
652 0.18
653 0.19
654 0.22
655 0.19
656 0.15
657 0.15
658 0.16
659 0.18
660 0.25
661 0.32
662 0.38
663 0.4
664 0.44
665 0.49
666 0.5
667 0.5
668 0.45
669 0.44
670 0.38
671 0.37
672 0.33
673 0.29
674 0.3
675 0.31
676 0.34
677 0.28
678 0.25
679 0.24
680 0.25
681 0.24
682 0.22
683 0.2
684 0.15
685 0.13
686 0.13
687 0.13
688 0.1
689 0.09
690 0.08
691 0.09
692 0.13
693 0.13
694 0.16
695 0.19
696 0.23
697 0.24
698 0.24
699 0.23
700 0.19
701 0.19
702 0.19
703 0.22
704 0.22
705 0.31
706 0.37
707 0.44
708 0.55
709 0.62
710 0.65
711 0.67
712 0.68
713 0.69
714 0.74
715 0.73
716 0.67
717 0.64
718 0.66
719 0.66
720 0.63
721 0.62
722 0.54
723 0.54
724 0.58
725 0.59
726 0.57
727 0.56
728 0.56
729 0.49
730 0.46
731 0.4
732 0.32
733 0.26
734 0.19
735 0.12
736 0.13
737 0.13
738 0.16
739 0.21
740 0.22
741 0.26
742 0.35
743 0.36
744 0.37
745 0.37
746 0.42
747 0.43
748 0.46
749 0.52
750 0.47
751 0.51