FuNGI

A0A139GXC0

Protein Details

Accession

A0A139GXC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-48	GGDRRDRRRDGGHRSRSPHHRRRDGPEIDS	Basic
83-109	SARRDARRDDDRDNRRRDRRGDRDDLF	Basic
144-163	QTARKSASPPPKKPREPTPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-41	RRDHDGGDRRDRRRDGGHRSRSPHHRRR
75-127	RGWGRDRGSARRDARRDDDRDNRRRDRRGDRDDLFADRRGPRRDDRGPDRRGE
147-157	RKSASPPPKKP

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR006529 U2AF_lg
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12231 RRM2_U2AF65 cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MSDRRLQSSRDDRRRDHDGGDRRDRRRDGGHRSRSPHHRRRDGPEIDSYSSSRNYREREREERYGRGDRDGGDDRGWGRDRGSARRDARRDDDRDNRRRDRRGDRDDLFADRRGPRRDDRGPDRRGEDRDRGQDRDDMRQLERQTARKSASPPPKKPREPTPDLTDVVSILERKRRLTQWDIKPPGYENVTAEQAKLSGMFPLPGAPRQQPMDPQKLQAFMNQPGNQASSTALKPSSARQSKRLLIHNIPAAATDDDIVDFFNLQLNGLNVTRGQDPCVSAQISKENGYALVEFKTPEDATNAMAFDGINMMPDAMDTNGDSNGTAKGLQIKRPKDYIVPNVTDETENPSGILSGVVPDTQNKISITNLPTFLGEDQIQELLNSFGELRNFVLVKDSSTEQSRGIAFCEYKDPSVTKTAVESLNGMELGDAAMKVKLASIGIQQVPGEMSVNAMSLMAGTQAENTDKGRVLCLMNMITPEELMDADEAAEILEDVKEEVAKYGPLLDVKMPRPTGGSRQNNGIGKIYLKYESPDSAAKALAALAGRKFADRTVVVTYFGEEYFDVNAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.71
3	0.66
4	0.64
5	0.64
6	0.65
7	0.72
8	0.74
9	0.72
10	0.77
11	0.75
12	0.71
13	0.71
14	0.71
15	0.71
16	0.72
17	0.78
18	0.77
19	0.8
20	0.83
21	0.84
22	0.86
23	0.84
24	0.84
25	0.83
26	0.82
27	0.85
28	0.86
29	0.82
30	0.75
31	0.75
32	0.69
33	0.62
34	0.57
35	0.5
36	0.43
37	0.41
38	0.39
39	0.35
40	0.36
41	0.39
42	0.46
43	0.55
44	0.6
45	0.64
46	0.71
47	0.75
48	0.74
49	0.75
50	0.73
51	0.72
52	0.65
53	0.6
54	0.54
55	0.45
56	0.47
57	0.45
58	0.4
59	0.31
60	0.32
61	0.28
62	0.33
63	0.34
64	0.27
65	0.23
66	0.27
67	0.3
68	0.36
69	0.4
70	0.43
71	0.48
72	0.57
73	0.61
74	0.62
75	0.65
76	0.66
77	0.67
78	0.66
79	0.69
80	0.7
81	0.75
82	0.78
83	0.8
84	0.8
85	0.82
86	0.82
87	0.83
88	0.83
89	0.83
90	0.83
91	0.75
92	0.73
93	0.67
94	0.64
95	0.57
96	0.49
97	0.45
98	0.42
99	0.46
100	0.45
101	0.48
102	0.47
103	0.53
104	0.59
105	0.63
106	0.67
107	0.69
108	0.69
109	0.69
110	0.68
111	0.65
112	0.63
113	0.6
114	0.58
115	0.56
116	0.61
117	0.61
118	0.58
119	0.54
120	0.53
121	0.49
122	0.49
123	0.46
124	0.4
125	0.37
126	0.41
127	0.39
128	0.43
129	0.46
130	0.44
131	0.43
132	0.45
133	0.45
134	0.44
135	0.47
136	0.48
137	0.54
138	0.57
139	0.63
140	0.68
141	0.76
142	0.78
143	0.79
144	0.8
145	0.79
146	0.77
147	0.73
148	0.7
149	0.65
150	0.59
151	0.54
152	0.43
153	0.33
154	0.26
155	0.21
156	0.15
157	0.12
158	0.17
159	0.18
160	0.21
161	0.26
162	0.29
163	0.34
164	0.42
165	0.5
166	0.54
167	0.64
168	0.66
169	0.62
170	0.59
171	0.55
172	0.49
173	0.42
174	0.33
175	0.23
176	0.2
177	0.24
178	0.23
179	0.21
180	0.17
181	0.14
182	0.13
183	0.12
184	0.1
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.11
190	0.12
191	0.13
192	0.16
193	0.16
194	0.19
195	0.21
196	0.22
197	0.26
198	0.31
199	0.38
200	0.36
201	0.38
202	0.37
203	0.38
204	0.37
205	0.33
206	0.31
207	0.26
208	0.33
209	0.31
210	0.3
211	0.29
212	0.3
213	0.25
214	0.21
215	0.18
216	0.13
217	0.12
218	0.13
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.16
223	0.25
224	0.29
225	0.31
226	0.35
227	0.41
228	0.46
229	0.5
230	0.53
231	0.49
232	0.44
233	0.46
234	0.43
235	0.37
236	0.32
237	0.27
238	0.22
239	0.16
240	0.13
241	0.09
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.06
258	0.08
259	0.11
260	0.1
261	0.12
262	0.11
263	0.13
264	0.13
265	0.15
266	0.14
267	0.12
268	0.13
269	0.15
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.1
286	0.09
287	0.1
288	0.11
289	0.1
290	0.08
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.07
295	0.05
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.05
302	0.03
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.14
315	0.16
316	0.23
317	0.3
318	0.33
319	0.36
320	0.38
321	0.39
322	0.36
323	0.39
324	0.41
325	0.39
326	0.38
327	0.36
328	0.35
329	0.35
330	0.3
331	0.25
332	0.23
333	0.18
334	0.16
335	0.14
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.05
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.09
347	0.1
348	0.12
349	0.12
350	0.12
351	0.13
352	0.18
353	0.2
354	0.2
355	0.21
356	0.19
357	0.19
358	0.19
359	0.18
360	0.15
361	0.13
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.1
366	0.09
367	0.09
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.08
375	0.08
376	0.1
377	0.1
378	0.1
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.15
383	0.16
384	0.16
385	0.19
386	0.2
387	0.16
388	0.18
389	0.19
390	0.17
391	0.17
392	0.18
393	0.15
394	0.15
395	0.2
396	0.19
397	0.19
398	0.21
399	0.21
400	0.19
401	0.24
402	0.24
403	0.19
404	0.19
405	0.22
406	0.21
407	0.2
408	0.19
409	0.14
410	0.15
411	0.14
412	0.12
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.09
427	0.14
428	0.15
429	0.16
430	0.15
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.07
436	0.08
437	0.07
438	0.08
439	0.07
440	0.07
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.05
448	0.07
449	0.08
450	0.1
451	0.11
452	0.13
453	0.15
454	0.16
455	0.16
456	0.18
457	0.18
458	0.17
459	0.2
460	0.18
461	0.17
462	0.18
463	0.18
464	0.15
465	0.14
466	0.13
467	0.1
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.15
493	0.18
494	0.24
495	0.27
496	0.34
497	0.33
498	0.31
499	0.34
500	0.36
501	0.4
502	0.44
503	0.5
504	0.46
505	0.52
506	0.59
507	0.59
508	0.58
509	0.51
510	0.42
511	0.35
512	0.34
513	0.3
514	0.25
515	0.22
516	0.23
517	0.23
518	0.23
519	0.24
520	0.26
521	0.26
522	0.26
523	0.25
524	0.22
525	0.19
526	0.17
527	0.16
528	0.14
529	0.14
530	0.13
531	0.17
532	0.18
533	0.19
534	0.2
535	0.18
536	0.23
537	0.21
538	0.23
539	0.26
540	0.27
541	0.27
542	0.27
543	0.28
544	0.23
545	0.22
546	0.21
547	0.14
548	0.14

A0A139GXC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer