Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HIV7

Protein Details
Accession A0A139HIV7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-300LSQMHVLTKGRKKRHRRAKLRVYSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-297KGRKKRHRRAKLR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012942  SRR1-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF07985  SRR1  
Amino Acid Sequences MDLRDSVPFAAHHNCTTGCTEMGDHVLEEDIGTVLDFEECEHAVRERQYLSILEEGDDYFEDYKNLVLQNYHHQRSTWLKSKCREQLFKRLTRLPINSRSGKITKAVAMGLNLLGFGGRGIQCFGGRDPEVAQLVIFLDIVHLLEKRLGKDIQLYAQEPNFRPIDEAFLAELGVRILHIPEAEDMCEDDMFFFLPFCPWPMVDLINQKFEHQPAWMIGASQDFIQTMSTARHLLPSKSSPEPTRFQYRMSNYTTFNIQKGCKLSCVGDSPGDFLSVLSQMHVLTKGRKKRHRRAKLRVYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.28
4 0.26
5 0.2
6 0.19
7 0.19
8 0.17
9 0.19
10 0.17
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.1
15 0.09
16 0.08
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.05
24 0.05
25 0.07
26 0.08
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.16
31 0.18
32 0.21
33 0.2
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.22
38 0.21
39 0.2
40 0.17
41 0.17
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.11
55 0.13
56 0.24
57 0.32
58 0.34
59 0.33
60 0.32
61 0.36
62 0.44
63 0.5
64 0.48
65 0.46
66 0.51
67 0.55
68 0.64
69 0.68
70 0.68
71 0.69
72 0.66
73 0.7
74 0.72
75 0.74
76 0.71
77 0.68
78 0.64
79 0.62
80 0.62
81 0.59
82 0.58
83 0.58
84 0.55
85 0.51
86 0.52
87 0.46
88 0.41
89 0.36
90 0.29
91 0.24
92 0.21
93 0.21
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.12
98 0.1
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.03
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.06
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.13
135 0.13
136 0.12
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.16
143 0.18
144 0.22
145 0.19
146 0.21
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.15
151 0.17
152 0.13
153 0.14
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.14
190 0.23
191 0.23
192 0.28
193 0.28
194 0.29
195 0.29
196 0.28
197 0.26
198 0.18
199 0.18
200 0.13
201 0.16
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.17
219 0.19
220 0.2
221 0.24
222 0.27
223 0.31
224 0.34
225 0.39
226 0.37
227 0.4
228 0.43
229 0.44
230 0.5
231 0.46
232 0.45
233 0.49
234 0.5
235 0.51
236 0.53
237 0.51
238 0.43
239 0.44
240 0.47
241 0.41
242 0.37
243 0.36
244 0.31
245 0.32
246 0.35
247 0.34
248 0.3
249 0.31
250 0.3
251 0.29
252 0.32
253 0.3
254 0.3
255 0.28
256 0.28
257 0.26
258 0.25
259 0.2
260 0.16
261 0.15
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.15
269 0.16
270 0.23
271 0.32
272 0.41
273 0.51
274 0.61
275 0.7
276 0.78
277 0.87
278 0.89
279 0.91
280 0.93