Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HJC4

Protein Details
Accession A0A139HJC4    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
329-350QEEERHRREKEERKRKLAALSKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
177-226HKPVERLTKKERMRLREEAKQKGGGKGGKAAAADRSRSGTPSDPKAAAKR
261-266PKKDPK
333-359RHRREKEERKRKLAALSKTAAAAKKRY
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MTGFNFNNLLNSIGKPGSSPSPKPTTSLSKPPPGAPSTAKPQAVTNGVKPRPVPANVAAGVKRKSEDQSSGPQAKVVRTEVKVPVRPGQNGQVASTKPAASASTATAASYKGTSRPLTTSQPAKAAAKPAAAAPKPAGNATAANAAPAAPKGFAAILAQAKAAQEASKAATMNTIKHKPVERLTKKERMRLREEAKQKGGGKGGKAAAADRSRSGTPSDPKAAAKRAPDTGYKGTMKKAVVAPPTTSYTGTMKKAVPGAAPKKDPKKGLGQDKYGGYASWSDLSAAEDEDEEGYDSYESDDMEAGFDDVEGEEQLALKSARKEDLEALQEEERHRREKEERKRKLAALSKTAAAAKKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.19
4 0.26
5 0.31
6 0.34
7 0.37
8 0.45
9 0.45
10 0.47
11 0.5
12 0.51
13 0.51
14 0.58
15 0.57
16 0.59
17 0.61
18 0.62
19 0.62
20 0.54
21 0.52
22 0.47
23 0.46
24 0.45
25 0.5
26 0.47
27 0.42
28 0.42
29 0.42
30 0.43
31 0.41
32 0.4
33 0.43
34 0.43
35 0.45
36 0.43
37 0.43
38 0.43
39 0.42
40 0.39
41 0.32
42 0.37
43 0.36
44 0.4
45 0.38
46 0.37
47 0.37
48 0.34
49 0.32
50 0.28
51 0.3
52 0.3
53 0.32
54 0.3
55 0.37
56 0.44
57 0.48
58 0.45
59 0.44
60 0.41
61 0.38
62 0.37
63 0.33
64 0.3
65 0.27
66 0.32
67 0.37
68 0.43
69 0.46
70 0.45
71 0.48
72 0.46
73 0.47
74 0.45
75 0.44
76 0.42
77 0.38
78 0.37
79 0.35
80 0.31
81 0.31
82 0.3
83 0.23
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.2
103 0.23
104 0.27
105 0.32
106 0.34
107 0.32
108 0.34
109 0.35
110 0.33
111 0.31
112 0.3
113 0.27
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.25
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.18
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.15
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.05
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.12
158 0.13
159 0.16
160 0.21
161 0.23
162 0.22
163 0.26
164 0.28
165 0.27
166 0.33
167 0.41
168 0.41
169 0.46
170 0.52
171 0.58
172 0.59
173 0.63
174 0.62
175 0.57
176 0.58
177 0.58
178 0.57
179 0.55
180 0.59
181 0.58
182 0.55
183 0.55
184 0.5
185 0.44
186 0.43
187 0.37
188 0.31
189 0.29
190 0.28
191 0.23
192 0.22
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.21
197 0.17
198 0.19
199 0.17
200 0.18
201 0.2
202 0.2
203 0.22
204 0.26
205 0.29
206 0.28
207 0.3
208 0.32
209 0.35
210 0.32
211 0.32
212 0.3
213 0.3
214 0.31
215 0.32
216 0.33
217 0.32
218 0.34
219 0.34
220 0.33
221 0.31
222 0.33
223 0.3
224 0.29
225 0.3
226 0.29
227 0.3
228 0.31
229 0.3
230 0.29
231 0.32
232 0.29
233 0.25
234 0.22
235 0.22
236 0.25
237 0.25
238 0.26
239 0.23
240 0.24
241 0.26
242 0.25
243 0.24
244 0.28
245 0.33
246 0.36
247 0.41
248 0.46
249 0.52
250 0.56
251 0.56
252 0.51
253 0.54
254 0.57
255 0.62
256 0.62
257 0.58
258 0.58
259 0.56
260 0.55
261 0.45
262 0.36
263 0.26
264 0.2
265 0.17
266 0.14
267 0.13
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.16
306 0.19
307 0.23
308 0.24
309 0.27
310 0.28
311 0.35
312 0.36
313 0.33
314 0.34
315 0.32
316 0.34
317 0.35
318 0.39
319 0.37
320 0.38
321 0.38
322 0.41
323 0.49
324 0.57
325 0.65
326 0.68
327 0.74
328 0.77
329 0.83
330 0.8
331 0.8
332 0.78
333 0.75
334 0.73
335 0.66
336 0.59
337 0.55
338 0.55
339 0.5