Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HDI4

Protein Details
Accession A0A139HDI4    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-78DTLIGRFRKNEKSRQQNVYNHLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PF13812  PPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MNLHIRFLLAIPPTVHISRIAGTALKSFTHGYAQTVVAASQSSYAAQNTSAVPLADTLIGRFRKNEKSRQQNVYNHLEGSRQASTAATVRPDTAHHRDSGLEKYFDAWQKHQRNEGTESTWHFQFARRLEWKPAAQAVVPVQVQEVADVEHVAEAKESTTPVLKRSYTTTALDDFSKAFLHNEAAEARALKQVDEAIAEEIAKAKEESEDGLTIRAKSPSVVDSEAFSEPDSSSPATIFTPTESFSSADSAEATDIHTERLLELAKNKQYADIPAAFQEMLRDGVQKPSQAAYRALLNSALEVSQGSHLRIPRALEVYSDMLRRKVIPDALTYGMLIDLLAARASESMAMKKALDARLTRYGGLEQAGNFMFRSSQAEHSMLMEDRSLSMALKMFERARETTESLPSAACASLVIASAEQGRIEDMTRVYEYMESKFLEPQSSIYSPMITAFGGLRDLRNAVEVYEGYKELAIKNNAGENAIVRVDNQVYAALIKAYGSADRLKGGLKFLANIQAGIVDEKELETLREVIALDALLPLALRDTTYRDAFDLAGSLNGRALTQALSTISSTAADGNNLEISTQAFDTLARHSGDLVEPSMALLAMHVRNANVEAAEPFWRVLEAAPVSVAFIEPTTMRAVALIGIGQAERGLRQSRRMFARLREATPESQQIEVAQHVDEAIELMGTFMLKNQAMLASEASVEVLRMMIENGSLVSPVAEHLVARFGPEHIARLSQADLEFLLRVQSTMILEESPADIAGPARFGCLVENVVSRSVMPSAETETLLEKTLINIDRAELSRLWNNYRYPQTPAFQPTSFTPVVPFQAPALFEDTYDPYANRTDVKGSNVVNELLERPHGRRMNEALAKFRNMRRVGRIPRMFTYGKLIEAAAKENNLTLARDVLEMAKQDVPFDGRYRVVRFGWQQILDHMVAGCLNLGRRDLASKYHQDMIDMGFAPSANTFGLYITTLKENTKTFDEASEAVKIFLRAKAEGVEPSSFLYNALIGKLGKARRIDDCLFYFAEMRNLGIRPTSVTYGTIVNALCRVSDDKFAEEIFEEMEACSNYKPRPAPYHSLMQFFLTTKRDRSKVLAYYERMRSKGIQPTVHTYKLLIDTHATLEPVNMAAAEALLDEMKVAGVQPEAVHYASLIHAKGCVLHDIEAAKDLFDSVIAEGKVQPLPCMYQAVLESLNANHRSAECESLLHHMAARGVDFTPYVANALIHGWTLEKNITKAKQAFDRVPISRREPSTYEAMVRAYLAAEDRDNAKAVVREALSRGYPSAVAGKIAELVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.2
4 0.21
5 0.19
6 0.2
7 0.19
8 0.16
9 0.17
10 0.21
11 0.21
12 0.19
13 0.2
14 0.2
15 0.2
16 0.23
17 0.23
18 0.21
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.2
24 0.15
25 0.15
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.14
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.12
45 0.19
46 0.21
47 0.22
48 0.26
49 0.32
50 0.4
51 0.48
52 0.58
53 0.6
54 0.69
55 0.77
56 0.82
57 0.85
58 0.82
59 0.82
60 0.8
61 0.72
62 0.62
63 0.54
64 0.46
65 0.38
66 0.35
67 0.3
68 0.21
69 0.19
70 0.17
71 0.19
72 0.21
73 0.22
74 0.2
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.24
79 0.29
80 0.33
81 0.33
82 0.31
83 0.32
84 0.34
85 0.36
86 0.41
87 0.39
88 0.32
89 0.29
90 0.3
91 0.36
92 0.4
93 0.41
94 0.4
95 0.44
96 0.52
97 0.57
98 0.63
99 0.6
100 0.59
101 0.6
102 0.58
103 0.52
104 0.48
105 0.49
106 0.45
107 0.41
108 0.38
109 0.32
110 0.32
111 0.35
112 0.33
113 0.37
114 0.39
115 0.42
116 0.48
117 0.54
118 0.52
119 0.5
120 0.5
121 0.42
122 0.37
123 0.37
124 0.32
125 0.31
126 0.28
127 0.23
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.15
132 0.13
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.16
147 0.17
148 0.19
149 0.25
150 0.26
151 0.27
152 0.32
153 0.36
154 0.34
155 0.36
156 0.36
157 0.32
158 0.33
159 0.32
160 0.28
161 0.22
162 0.19
163 0.18
164 0.15
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.17
176 0.17
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.14
198 0.18
199 0.19
200 0.19
201 0.2
202 0.2
203 0.17
204 0.16
205 0.18
206 0.17
207 0.19
208 0.19
209 0.18
210 0.18
211 0.21
212 0.21
213 0.19
214 0.17
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.15
231 0.15
232 0.14
233 0.16
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.13
248 0.13
249 0.12
250 0.16
251 0.23
252 0.27
253 0.29
254 0.29
255 0.3
256 0.3
257 0.31
258 0.32
259 0.26
260 0.23
261 0.22
262 0.23
263 0.2
264 0.18
265 0.17
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.13
270 0.12
271 0.19
272 0.21
273 0.21
274 0.22
275 0.23
276 0.25
277 0.26
278 0.27
279 0.21
280 0.25
281 0.25
282 0.24
283 0.22
284 0.18
285 0.16
286 0.15
287 0.13
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.15
295 0.17
296 0.19
297 0.21
298 0.21
299 0.21
300 0.22
301 0.21
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.22
306 0.24
307 0.21
308 0.2
309 0.21
310 0.21
311 0.2
312 0.21
313 0.23
314 0.21
315 0.22
316 0.25
317 0.25
318 0.25
319 0.23
320 0.18
321 0.14
322 0.12
323 0.09
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.14
339 0.19
340 0.2
341 0.23
342 0.23
343 0.26
344 0.34
345 0.35
346 0.33
347 0.29
348 0.27
349 0.24
350 0.23
351 0.19
352 0.11
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.13
361 0.13
362 0.16
363 0.19
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.22
368 0.18
369 0.16
370 0.13
371 0.1
372 0.09
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.08
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.13
381 0.14
382 0.16
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.23
387 0.25
388 0.25
389 0.27
390 0.26
391 0.23
392 0.21
393 0.18
394 0.15
395 0.13
396 0.1
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.11
416 0.11
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.16
421 0.14
422 0.15
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.16
427 0.15
428 0.18
429 0.18
430 0.19
431 0.16
432 0.16
433 0.14
434 0.15
435 0.14
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.15
459 0.15
460 0.15
461 0.16
462 0.18
463 0.18
464 0.17
465 0.16
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.1
470 0.08
471 0.09
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.11
495 0.12
496 0.12
497 0.18
498 0.17
499 0.16
500 0.15
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.12
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.07
516 0.06
517 0.07
518 0.06
519 0.05
520 0.05
521 0.04
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.08
530 0.11
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.13
535 0.13
536 0.13
537 0.1
538 0.07
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.05
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.07
574 0.1
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.1
579 0.11
580 0.1
581 0.1
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.05
587 0.04
588 0.03
589 0.05
590 0.05
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.08
596 0.08
597 0.05
598 0.06
599 0.05
600 0.06
601 0.08
602 0.08
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.08
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.03
617 0.03
618 0.04
619 0.04
620 0.05
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.05
627 0.05
628 0.04
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.03
635 0.03
636 0.06
637 0.09
638 0.1
639 0.17
640 0.2
641 0.25
642 0.3
643 0.33
644 0.34
645 0.34
646 0.44
647 0.4
648 0.38
649 0.37
650 0.35
651 0.33
652 0.32
653 0.33
654 0.24
655 0.2
656 0.19
657 0.16
658 0.14
659 0.13
660 0.11
661 0.07
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.04
667 0.04
668 0.03
669 0.02
670 0.03
671 0.03
672 0.03
673 0.03
674 0.03
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.06
680 0.07
681 0.08
682 0.07
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.05
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.03
692 0.03
693 0.03
694 0.03
695 0.03
696 0.03
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.03
701 0.03
702 0.03
703 0.03
704 0.04
705 0.04
706 0.04
707 0.04
708 0.06
709 0.06
710 0.06
711 0.07
712 0.06
713 0.09
714 0.09
715 0.11
716 0.09
717 0.1
718 0.1
719 0.11
720 0.11
721 0.1
722 0.1
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.07
727 0.06
728 0.07
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.06
733 0.05
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.05
741 0.05
742 0.04
743 0.04
744 0.05
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.06
751 0.06
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.09
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.1
766 0.11
767 0.11
768 0.1
769 0.11
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.09
774 0.08
775 0.13
776 0.14
777 0.13
778 0.12
779 0.12
780 0.15
781 0.15
782 0.17
783 0.13
784 0.14
785 0.17
786 0.19
787 0.22
788 0.24
789 0.25
790 0.29
791 0.34
792 0.33
793 0.34
794 0.36
795 0.35
796 0.35
797 0.38
798 0.36
799 0.31
800 0.31
801 0.27
802 0.29
803 0.27
804 0.22
805 0.19
806 0.17
807 0.18
808 0.17
809 0.16
810 0.11
811 0.12
812 0.13
813 0.12
814 0.14
815 0.12
816 0.11
817 0.13
818 0.14
819 0.14
820 0.15
821 0.14
822 0.12
823 0.13
824 0.14
825 0.13
826 0.13
827 0.15
828 0.16
829 0.19
830 0.22
831 0.21
832 0.23
833 0.23
834 0.22
835 0.18
836 0.17
837 0.15
838 0.12
839 0.14
840 0.13
841 0.13
842 0.21
843 0.25
844 0.25
845 0.28
846 0.32
847 0.38
848 0.41
849 0.41
850 0.39
851 0.38
852 0.41
853 0.41
854 0.4
855 0.4
856 0.38
857 0.4
858 0.41
859 0.49
860 0.53
861 0.59
862 0.62
863 0.57
864 0.55
865 0.58
866 0.5
867 0.41
868 0.41
869 0.31
870 0.27
871 0.23
872 0.21
873 0.18
874 0.18
875 0.2
876 0.13
877 0.13
878 0.12
879 0.12
880 0.14
881 0.12
882 0.12
883 0.1
884 0.1
885 0.1
886 0.1
887 0.11
888 0.09
889 0.1
890 0.1
891 0.12
892 0.14
893 0.13
894 0.14
895 0.14
896 0.15
897 0.16
898 0.17
899 0.17
900 0.17
901 0.21
902 0.23
903 0.26
904 0.24
905 0.28
906 0.29
907 0.33
908 0.35
909 0.33
910 0.3
911 0.28
912 0.3
913 0.25
914 0.22
915 0.16
916 0.11
917 0.09
918 0.09
919 0.08
920 0.06
921 0.07
922 0.07
923 0.08
924 0.08
925 0.09
926 0.12
927 0.12
928 0.17
929 0.22
930 0.26
931 0.29
932 0.34
933 0.33
934 0.31
935 0.31
936 0.28
937 0.26
938 0.21
939 0.18
940 0.13
941 0.13
942 0.12
943 0.11
944 0.1
945 0.06
946 0.06
947 0.06
948 0.06
949 0.06
950 0.07
951 0.08
952 0.08
953 0.11
954 0.12
955 0.13
956 0.16
957 0.17
958 0.19
959 0.22
960 0.22
961 0.21
962 0.21
963 0.22
964 0.2
965 0.21
966 0.22
967 0.19
968 0.17
969 0.17
970 0.18
971 0.17
972 0.17
973 0.18
974 0.14
975 0.15
976 0.16
977 0.17
978 0.18
979 0.19
980 0.17
981 0.16
982 0.16
983 0.16
984 0.14
985 0.13
986 0.11
987 0.1
988 0.09
989 0.09
990 0.1
991 0.09
992 0.11
993 0.16
994 0.18
995 0.21
996 0.23
997 0.26
998 0.28
999 0.35
1000 0.36
1001 0.36
1002 0.36
1003 0.35
1004 0.32
1005 0.3
1006 0.28
1007 0.22
1008 0.24
1009 0.18
1010 0.17
1011 0.17
1012 0.16
1013 0.16
1014 0.15
1015 0.15
1016 0.14
1017 0.16
1018 0.17
1019 0.15
1020 0.15
1021 0.16
1022 0.16
1023 0.16
1024 0.16
1025 0.14
1026 0.12
1027 0.13
1028 0.12
1029 0.11
1030 0.11
1031 0.14
1032 0.13
1033 0.19
1034 0.21
1035 0.22
1036 0.23
1037 0.23
1038 0.22
1039 0.2
1040 0.18
1041 0.12
1042 0.11
1043 0.09
1044 0.07
1045 0.1
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.1
1049 0.14
1050 0.15
1051 0.21
1052 0.24
1053 0.28
1054 0.37
1055 0.43
1056 0.49
1057 0.49
1058 0.59
1059 0.55
1060 0.56
1061 0.5
1062 0.43
1063 0.38
1064 0.32
1065 0.33
1066 0.27
1067 0.27
1068 0.31
1069 0.37
1070 0.38
1071 0.39
1072 0.43
1073 0.46
1074 0.48
1075 0.53
1076 0.55
1077 0.52
1078 0.57
1079 0.63
1080 0.62
1081 0.55
1082 0.51
1083 0.47
1084 0.46
1085 0.5
1086 0.49
1087 0.46
1088 0.45
1089 0.53
1090 0.56
1091 0.55
1092 0.48
1093 0.4
1094 0.37
1095 0.38
1096 0.35
1097 0.27
1098 0.23
1099 0.22
1100 0.24
1101 0.25
1102 0.21
1103 0.15
1104 0.14
1105 0.13
1106 0.12
1107 0.1
1108 0.07
1109 0.06
1110 0.05
1111 0.05
1112 0.05
1113 0.04
1114 0.04
1115 0.04
1116 0.04
1117 0.04
1118 0.04
1119 0.04
1120 0.04
1121 0.04
1122 0.05
1123 0.05
1124 0.06
1125 0.06
1126 0.08
1127 0.11
1128 0.11
1129 0.11
1130 0.1
1131 0.1
1132 0.11
1133 0.15
1134 0.13
1135 0.11
1136 0.12
1137 0.12
1138 0.15
1139 0.15
1140 0.17
1141 0.15
1142 0.16
1143 0.18
1144 0.18
1145 0.19
1146 0.19
1147 0.18
1148 0.15
1149 0.13
1150 0.12
1151 0.1
1152 0.09
1153 0.09
1154 0.06
1155 0.12
1156 0.11
1157 0.12
1158 0.13
1159 0.16
1160 0.19
1161 0.18
1162 0.18
1163 0.15
1164 0.18
1165 0.18
1166 0.21
1167 0.18
1168 0.19
1169 0.19
1170 0.21
1171 0.2
1172 0.18
1173 0.18
1174 0.16
1175 0.24
1176 0.22
1177 0.22
1178 0.21
1179 0.2
1180 0.25
1181 0.26
1182 0.28
1183 0.21
1184 0.2
1185 0.21
1186 0.25
1187 0.26
1188 0.22
1189 0.21
1190 0.18
1191 0.19
1192 0.19
1193 0.19
1194 0.15
1195 0.13
1196 0.14
1197 0.13
1198 0.12
1199 0.12
1200 0.11
1201 0.11
1202 0.1
1203 0.1
1204 0.1
1205 0.11
1206 0.11
1207 0.09
1208 0.09
1209 0.09
1210 0.1
1211 0.12
1212 0.16
1213 0.18
1214 0.2
1215 0.28
1216 0.31
1217 0.38
1218 0.42
1219 0.45
1220 0.5
1221 0.54
1222 0.55
1223 0.55
1224 0.6
1225 0.57
1226 0.58
1227 0.58
1228 0.56
1229 0.57
1230 0.56
1231 0.55
1232 0.5
1233 0.48
1234 0.5
1235 0.47
1236 0.43
1237 0.37
1238 0.35
1239 0.29
1240 0.26
1241 0.23
1242 0.16
1243 0.14
1244 0.13
1245 0.13
1246 0.12
1247 0.14
1248 0.16
1249 0.18
1250 0.19
1251 0.18
1252 0.19
1253 0.2
1254 0.21
1255 0.25
1256 0.23
1257 0.24
1258 0.25
1259 0.29
1260 0.27
1261 0.26
1262 0.26
1263 0.21
1264 0.2
1265 0.19
1266 0.23
1267 0.19
1268 0.19
1269 0.18
1270 0.17