Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139H6U2

Protein Details
Accession A0A139H6U2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-33SERDSKISKSRVERRKTPNRTTHRGRSVEHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-19RRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MRLSERDSKISKSRVERRKTPNRTTHRGRSVEHPLGNPKHHSHLIDAMGSYPERHSQPGPSTDGDYHTESSEEEAEEEEAGSMNEQYELQLYYAIVCDDAVIASMVRTGHSSNDVDVFRKGFESWIYQESGRLGIQKYDILRTETIATTEQHPTYHEGSASREAVRRALNVIDRWHAGHEPNLCLGIRMHTSRPAERLNESIGLHGTTQSTLLSPDMTPCQRRLVREQVLGVKEDVRVKNQFYKRNMGLRKKAHELAMLCKVQVYLVVQRRGQFYVYTSHEHHGWPPSQEQIDQSYPLPRKVTAQCPEMLTPRNLPRGRFAPKTHNKNGSLRTASVLLDYRGVNFEEYTKID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.75
3 0.78
4 0.81
5 0.85
6 0.87
7 0.87
8 0.88
9 0.87
10 0.89
11 0.88
12 0.88
13 0.87
14 0.82
15 0.74
16 0.72
17 0.72
18 0.7
19 0.64
20 0.58
21 0.58
22 0.58
23 0.6
24 0.58
25 0.51
26 0.5
27 0.5
28 0.47
29 0.41
30 0.41
31 0.39
32 0.35
33 0.32
34 0.26
35 0.24
36 0.22
37 0.2
38 0.15
39 0.17
40 0.17
41 0.2
42 0.21
43 0.25
44 0.3
45 0.34
46 0.37
47 0.34
48 0.36
49 0.34
50 0.35
51 0.33
52 0.3
53 0.26
54 0.22
55 0.21
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.11
109 0.11
110 0.14
111 0.15
112 0.17
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.18
118 0.14
119 0.14
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.17
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.17
137 0.16
138 0.14
139 0.15
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.16
144 0.14
145 0.16
146 0.19
147 0.2
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.19
152 0.19
153 0.17
154 0.15
155 0.16
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.14
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.17
178 0.2
179 0.21
180 0.24
181 0.25
182 0.25
183 0.24
184 0.25
185 0.21
186 0.22
187 0.21
188 0.18
189 0.15
190 0.14
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.08
203 0.12
204 0.15
205 0.16
206 0.17
207 0.25
208 0.27
209 0.3
210 0.35
211 0.4
212 0.42
213 0.43
214 0.45
215 0.43
216 0.41
217 0.4
218 0.34
219 0.25
220 0.22
221 0.27
222 0.25
223 0.23
224 0.24
225 0.26
226 0.35
227 0.41
228 0.46
229 0.44
230 0.51
231 0.51
232 0.58
233 0.64
234 0.64
235 0.66
236 0.66
237 0.67
238 0.66
239 0.64
240 0.56
241 0.52
242 0.45
243 0.41
244 0.42
245 0.37
246 0.3
247 0.28
248 0.26
249 0.21
250 0.2
251 0.17
252 0.18
253 0.25
254 0.29
255 0.3
256 0.33
257 0.36
258 0.36
259 0.34
260 0.27
261 0.21
262 0.24
263 0.26
264 0.27
265 0.28
266 0.28
267 0.29
268 0.29
269 0.31
270 0.3
271 0.29
272 0.27
273 0.27
274 0.3
275 0.3
276 0.3
277 0.29
278 0.29
279 0.28
280 0.27
281 0.27
282 0.3
283 0.31
284 0.34
285 0.33
286 0.28
287 0.33
288 0.38
289 0.46
290 0.44
291 0.45
292 0.44
293 0.46
294 0.48
295 0.47
296 0.44
297 0.38
298 0.39
299 0.42
300 0.5
301 0.48
302 0.47
303 0.49
304 0.53
305 0.57
306 0.57
307 0.56
308 0.57
309 0.65
310 0.73
311 0.75
312 0.76
313 0.74
314 0.74
315 0.75
316 0.73
317 0.67
318 0.58
319 0.52
320 0.45
321 0.4
322 0.36
323 0.32
324 0.24
325 0.23
326 0.22
327 0.2
328 0.21
329 0.21
330 0.19
331 0.17
332 0.18