FuNGI

A0A139HAD4

Protein Details

Accession

A0A139HAD4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
395-419	RDGDRDRREREKQRAERKQEAKREM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
226-243	PPKHKIKKIPRGPPSPPP
385-425	GSRSRSRSGGRDGDRDRREREKQRAERKQEAKREMARKNMG

Subcellular Location(s)

mito_nucl 10.166, nucl 10, mito 10, cyto_nucl 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSLAGSRASLLSALPKPKYTGEDEELPTHTQQKGPRVVGARELESSQLVVKRSGPPPYGQRSGWRPRNVEDFGDGGAFPEVPMAQYPLDMGRKNQPSTSNALALQVDNEGKVKYDAIARRGHGEKRIVHASFKDLIPLRQRADVGDISLERPSEEEVQASKERTQKALQGLVDGTLAAQKPKNVKGTTRPEPTFVRYTPANQMGDNSKKPDRIMKIVARQQDPMEPPKHKIKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALHTADRHAREEVQQRHRMQQRLAEKEKEAQEEHLRQLAMKAREDKAAAATQRRGADRGRSRSRSVDSRSSYSSYSSRSGSRSRSRSGGRDGDRDRREREKQRAERKQEAKREMARKNMGHERKMQMMAREQNRDIGEKVALGLAKPTQSKEAMYDSRLFNQSSGFAAGFNEDQAYDKPLFADRDALNSIYRPTVGDEDDGEDGGETLEKIQGTKRFDTLGRAPKSGFKGTETAEARSGPVQFERDRGDDPFGIEAGIAAASGGSKRVADDDGGGKSKRARVDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.31
3	0.33
4	0.37
5	0.4
6	0.39
7	0.41
8	0.4
9	0.46
10	0.47
11	0.48
12	0.47
13	0.45
14	0.4
15	0.37
16	0.33
17	0.3
18	0.32
19	0.37
20	0.43
21	0.43
22	0.47
23	0.48
24	0.48
25	0.52
26	0.51
27	0.44
28	0.38
29	0.36
30	0.31
31	0.26
32	0.25
33	0.21
34	0.2
35	0.19
36	0.19
37	0.22
38	0.28
39	0.32
40	0.39
41	0.37
42	0.39
43	0.46
44	0.52
45	0.54
46	0.48
47	0.52
48	0.54
49	0.63
50	0.67
51	0.66
52	0.61
53	0.6
54	0.67
55	0.62
56	0.55
57	0.47
58	0.39
59	0.31
60	0.29
61	0.24
62	0.16
63	0.14
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.07
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.09
73	0.1
74	0.14
75	0.19
76	0.2
77	0.22
78	0.29
79	0.36
80	0.38
81	0.41
82	0.41
83	0.38
84	0.44
85	0.45
86	0.39
87	0.32
88	0.33
89	0.29
90	0.25
91	0.23
92	0.19
93	0.15
94	0.13
95	0.14
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.12
100	0.11
101	0.18
102	0.21
103	0.25
104	0.3
105	0.3
106	0.35
107	0.4
108	0.42
109	0.41
110	0.43
111	0.41
112	0.43
113	0.49
114	0.44
115	0.42
116	0.4
117	0.38
118	0.35
119	0.32
120	0.32
121	0.26
122	0.29
123	0.34
124	0.37
125	0.35
126	0.34
127	0.34
128	0.29
129	0.32
130	0.28
131	0.22
132	0.2
133	0.19
134	0.16
135	0.17
136	0.16
137	0.11
138	0.11
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.14
143	0.14
144	0.19
145	0.22
146	0.23
147	0.26
148	0.28
149	0.3
150	0.31
151	0.32
152	0.32
153	0.34
154	0.38
155	0.33
156	0.29
157	0.28
158	0.25
159	0.23
160	0.17
161	0.12
162	0.1
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.13
167	0.18
168	0.23
169	0.31
170	0.3
171	0.34
172	0.42
173	0.5
174	0.56
175	0.6
176	0.55
177	0.52
178	0.53
179	0.54
180	0.5
181	0.41
182	0.36
183	0.28
184	0.3
185	0.33
186	0.35
187	0.31
188	0.26
189	0.28
190	0.3
191	0.35
192	0.35
193	0.33
194	0.31
195	0.32
196	0.33
197	0.38
198	0.35
199	0.35
200	0.4
201	0.42
202	0.47
203	0.5
204	0.55
205	0.5
206	0.47
207	0.42
208	0.4
209	0.37
210	0.35
211	0.35
212	0.31
213	0.33
214	0.42
215	0.49
216	0.46
217	0.52
218	0.57
219	0.62
220	0.7
221	0.76
222	0.74
223	0.75
224	0.76
225	0.76
226	0.73
227	0.69
228	0.63
229	0.55
230	0.51
231	0.49
232	0.49
233	0.49
234	0.49
235	0.47
236	0.48
237	0.51
238	0.46
239	0.42
240	0.42
241	0.41
242	0.4
243	0.36
244	0.34
245	0.32
246	0.32
247	0.3
248	0.28
249	0.21
250	0.16
251	0.18
252	0.19
253	0.28
254	0.3
255	0.38
256	0.42
257	0.47
258	0.52
259	0.49
260	0.49
261	0.42
262	0.41
263	0.37
264	0.4
265	0.38
266	0.38
267	0.39
268	0.35
269	0.33
270	0.32
271	0.28
272	0.19
273	0.17
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.14
278	0.11
279	0.12
280	0.12
281	0.15
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.12
286	0.13
287	0.11
288	0.11
289	0.06
290	0.06
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.12
298	0.13
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.17
303	0.26
304	0.34
305	0.4
306	0.46
307	0.46
308	0.53
309	0.58
310	0.57
311	0.49
312	0.47
313	0.47
314	0.49
315	0.52
316	0.46
317	0.42
318	0.44
319	0.46
320	0.42
321	0.34
322	0.29
323	0.31
324	0.31
325	0.32
326	0.29
327	0.25
328	0.22
329	0.24
330	0.27
331	0.24
332	0.24
333	0.27
334	0.25
335	0.27
336	0.28
337	0.25
338	0.21
339	0.23
340	0.21
341	0.21
342	0.21
343	0.24
344	0.27
345	0.27
346	0.26
347	0.24
348	0.31
349	0.36
350	0.44
351	0.49
352	0.5
353	0.51
354	0.55
355	0.58
356	0.56
357	0.53
358	0.52
359	0.47
360	0.47
361	0.47
362	0.44
363	0.4
364	0.35
365	0.31
366	0.26
367	0.24
368	0.23
369	0.22
370	0.24
371	0.28
372	0.33
373	0.4
374	0.42
375	0.42
376	0.47
377	0.49
378	0.5
379	0.53
380	0.53
381	0.48
382	0.52
383	0.54
384	0.57
385	0.59
386	0.59
387	0.56
388	0.56
389	0.61
390	0.62
391	0.68
392	0.69
393	0.73
394	0.79
395	0.85
396	0.85
397	0.85
398	0.85
399	0.84
400	0.82
401	0.78
402	0.75
403	0.73
404	0.74
405	0.68
406	0.68
407	0.67
408	0.59
409	0.6
410	0.63
411	0.6
412	0.54
413	0.57
414	0.51
415	0.49
416	0.53
417	0.48
418	0.41
419	0.43
420	0.48
421	0.48
422	0.5
423	0.44
424	0.45
425	0.44
426	0.42
427	0.35
428	0.29
429	0.23
430	0.17
431	0.17
432	0.14
433	0.13
434	0.1
435	0.11
436	0.1
437	0.14
438	0.15
439	0.16
440	0.17
441	0.18
442	0.19
443	0.2
444	0.27
445	0.26
446	0.27
447	0.31
448	0.3
449	0.34
450	0.36
451	0.34
452	0.27
453	0.25
454	0.23
455	0.2
456	0.2
457	0.14
458	0.11
459	0.11
460	0.13
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.08
465	0.1
466	0.1
467	0.14
468	0.13
469	0.13
470	0.14
471	0.18
472	0.2
473	0.18
474	0.24
475	0.21
476	0.25
477	0.26
478	0.26
479	0.23
480	0.22
481	0.23
482	0.17
483	0.17
484	0.13
485	0.14
486	0.17
487	0.17
488	0.17
489	0.17
490	0.18
491	0.18
492	0.18
493	0.15
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.08
498	0.05
499	0.06
500	0.08
501	0.08
502	0.09
503	0.14
504	0.2
505	0.25
506	0.28
507	0.29
508	0.3
509	0.32
510	0.38
511	0.42
512	0.46
513	0.45
514	0.45
515	0.44
516	0.47
517	0.52
518	0.5
519	0.43
520	0.36
521	0.36
522	0.36
523	0.45
524	0.4
525	0.37
526	0.34
527	0.33
528	0.31
529	0.29
530	0.28
531	0.21
532	0.22
533	0.25
534	0.24
535	0.28
536	0.31
537	0.32
538	0.33
539	0.34
540	0.36
541	0.32
542	0.32
543	0.29
544	0.24
545	0.21
546	0.18
547	0.15
548	0.1
549	0.08
550	0.06
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.08
559	0.1
560	0.12
561	0.12
562	0.16
563	0.2
564	0.25
565	0.3
566	0.3
567	0.3
568	0.34
569	0.38
570	0.4

A0A139HAD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer