Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BV80

Protein Details
Accession Q6BV80    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
553-584QKPITKPKPSVNKVIKKNRKPKFSSTKVVKPDHydrophilic
597-624WLPMKVRSYYKPSKKELKKKSGGHQGAVHydrophilic
634-654VSNATNTSSNKNKKKKKKGKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
558-574KPKPSVNKVIKKNRKPK
608-616PSKKELKKK
644-654KNKKKKKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG dha:DEHA2C04664g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MSNSIVQAFKSLNVSSAHSVSEHETIYDVSYQYLSNIKHFNDLISFHNCLVALINLDRYYKAFELIKQVPEDVHTEFVLEKAYIYYKTGNSKLLLDIYNNDDFSNNPILSRALNHIVAQDYYRNGNSAKALELYVQLIQSNKEMDNSLDLSCNERAIIHQQNLMDLVDVSSLTNSSIEESYDLLFNDSLVHLSRGEYATALVLLDKAEQKCQDQSDLLHEDVLLELAPIKLTTAYILQITNKTDEALKILKELELEPINDLIVKLILSNNHYSITGKSNDNVNFMHRELNYQYNLHHLQQKLTKPQYHVLIKNHLLLSFFSGSLSNKSSYLNSKSIDQWLEDFPGDYTPVMYKVLTQLSIDINDLSNSLNHKQICKKLFKFVSNNKVDQQVIAATLLLVFINSKQNRFDQSMIALEKISNDQFDNEKILPGLIGVLIKLYEELNLTKNLEILFNNLVEKFVSTDHNVIQDDVNYYNFVKIIGFKLLILQNENSSKLFNLLNQINPDDELVSTVLNNSSNSNLSPISKLTSSTQPIDELLATSIETLIPIKEQQKPITKPKPSVNKVIKKNRKPKFSSTKVVKPDAEFNADSLDKERWLPMKVRSYYKPSKKELKKKSGGHQGAVETPAVASSSVSNATNTSSNKNKKKKKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.26
4 0.24
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.24
9 0.2
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.15
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.14
20 0.2
21 0.19
22 0.22
23 0.27
24 0.27
25 0.31
26 0.32
27 0.32
28 0.29
29 0.3
30 0.29
31 0.29
32 0.3
33 0.25
34 0.26
35 0.24
36 0.21
37 0.2
38 0.17
39 0.14
40 0.14
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.22
47 0.19
48 0.22
49 0.21
50 0.23
51 0.31
52 0.35
53 0.38
54 0.35
55 0.35
56 0.31
57 0.3
58 0.31
59 0.23
60 0.21
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.13
70 0.12
71 0.15
72 0.18
73 0.21
74 0.28
75 0.3
76 0.32
77 0.31
78 0.32
79 0.32
80 0.32
81 0.29
82 0.24
83 0.24
84 0.25
85 0.27
86 0.26
87 0.23
88 0.19
89 0.19
90 0.21
91 0.25
92 0.2
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.2
98 0.21
99 0.18
100 0.2
101 0.2
102 0.21
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.19
107 0.16
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.19
113 0.19
114 0.18
115 0.18
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.15
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.17
136 0.17
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.15
141 0.13
142 0.14
143 0.18
144 0.25
145 0.22
146 0.25
147 0.24
148 0.25
149 0.26
150 0.24
151 0.18
152 0.11
153 0.1
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.11
193 0.12
194 0.15
195 0.16
196 0.18
197 0.21
198 0.23
199 0.23
200 0.2
201 0.2
202 0.23
203 0.25
204 0.23
205 0.2
206 0.18
207 0.16
208 0.15
209 0.14
210 0.07
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.05
253 0.07
254 0.09
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.16
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.22
266 0.23
267 0.24
268 0.23
269 0.21
270 0.21
271 0.21
272 0.24
273 0.17
274 0.19
275 0.19
276 0.23
277 0.22
278 0.2
279 0.19
280 0.21
281 0.23
282 0.22
283 0.25
284 0.21
285 0.24
286 0.29
287 0.33
288 0.36
289 0.39
290 0.4
291 0.38
292 0.41
293 0.45
294 0.44
295 0.45
296 0.4
297 0.42
298 0.4
299 0.41
300 0.37
301 0.3
302 0.25
303 0.2
304 0.2
305 0.15
306 0.13
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.14
312 0.11
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.15
317 0.2
318 0.21
319 0.19
320 0.21
321 0.22
322 0.24
323 0.23
324 0.2
325 0.17
326 0.15
327 0.16
328 0.14
329 0.13
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.09
355 0.1
356 0.14
357 0.15
358 0.18
359 0.23
360 0.3
361 0.34
362 0.41
363 0.41
364 0.46
365 0.5
366 0.53
367 0.57
368 0.59
369 0.63
370 0.59
371 0.59
372 0.52
373 0.5
374 0.43
375 0.34
376 0.27
377 0.17
378 0.13
379 0.11
380 0.09
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.13
389 0.14
390 0.16
391 0.17
392 0.2
393 0.24
394 0.27
395 0.27
396 0.2
397 0.21
398 0.24
399 0.23
400 0.21
401 0.18
402 0.15
403 0.14
404 0.15
405 0.13
406 0.1
407 0.09
408 0.11
409 0.12
410 0.13
411 0.16
412 0.14
413 0.14
414 0.13
415 0.13
416 0.11
417 0.09
418 0.09
419 0.05
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.07
430 0.09
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.13
439 0.13
440 0.13
441 0.14
442 0.12
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.09
447 0.09
448 0.11
449 0.12
450 0.14
451 0.15
452 0.19
453 0.19
454 0.18
455 0.17
456 0.16
457 0.16
458 0.15
459 0.14
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.11
464 0.1
465 0.09
466 0.1
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.11
471 0.16
472 0.18
473 0.19
474 0.2
475 0.19
476 0.2
477 0.22
478 0.24
479 0.2
480 0.18
481 0.17
482 0.17
483 0.17
484 0.14
485 0.19
486 0.2
487 0.23
488 0.25
489 0.25
490 0.23
491 0.23
492 0.22
493 0.16
494 0.13
495 0.11
496 0.09
497 0.08
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.11
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.15
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.17
514 0.18
515 0.2
516 0.26
517 0.28
518 0.29
519 0.29
520 0.27
521 0.27
522 0.27
523 0.23
524 0.16
525 0.13
526 0.11
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.07
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.11
536 0.16
537 0.23
538 0.28
539 0.35
540 0.44
541 0.51
542 0.6
543 0.66
544 0.68
545 0.68
546 0.72
547 0.76
548 0.71
549 0.75
550 0.75
551 0.75
552 0.79
553 0.83
554 0.85
555 0.85
556 0.9
557 0.88
558 0.88
559 0.85
560 0.86
561 0.85
562 0.83
563 0.83
564 0.82
565 0.83
566 0.8
567 0.8
568 0.72
569 0.64
570 0.63
571 0.57
572 0.54
573 0.44
574 0.37
575 0.36
576 0.33
577 0.3
578 0.25
579 0.23
580 0.18
581 0.19
582 0.24
583 0.22
584 0.25
585 0.29
586 0.35
587 0.43
588 0.48
589 0.54
590 0.56
591 0.62
592 0.69
593 0.74
594 0.75
595 0.73
596 0.78
597 0.82
598 0.86
599 0.88
600 0.88
601 0.88
602 0.87
603 0.88
604 0.89
605 0.83
606 0.76
607 0.7
608 0.62
609 0.56
610 0.5
611 0.4
612 0.28
613 0.23
614 0.19
615 0.15
616 0.11
617 0.08
618 0.07
619 0.1
620 0.12
621 0.13
622 0.13
623 0.13
624 0.16
625 0.22
626 0.23
627 0.28
628 0.36
629 0.46
630 0.56
631 0.66
632 0.74
633 0.8
634 0.89