FuNGI

A0A139HVW0

Protein Details

Accession

A0A139HVW0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
679-704	GPDNNPQPKKQKEDRGGRRNKGGDRD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-460	RSRSPDRGGR
686-699	PKKQKEDRGGRRNK

Subcellular Location(s)

mito 7, cyto 7, cyto_mito 7, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR008942 ENTH_VHS IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR045154 PCF11-like IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50102 RRM
CDD	cd16984 CID_Nrd1_like

Amino Acid Sequences

MATPGVNDLDGLLASLNQLKPPGASKNKIATITTMCVNNIQAESTIVQSFYRALKKAPATHKLGALYVIDSVVRQWIEKAKSLGQELQFEGRGESGTYPAAVKRVTELMPALFDDITKALPADQKPKLENMITIWERGSTFPVKLLQDFKVKLGGAPAVNGSTAATTAPVQAPVKTSGEKFMAPIPSRPVQTPVGYPPQYLYDQGLLPGKAAPHMNGNASASNSAQVSVDPRQQHQQQFQQPQQMPQPPQSAAQPAVAAPPADVNSILAALSRAAPAAPTPSFPSQAQPAVTAPPPGQLPPNLAALFQQQQHQQHAPPSQPIAVPQQHYPYLGSPSAPPLAHPAYQAPPPPFPGYPPQPPPSIPQAYSVAPPPQQPPPAADALAPLRGILPPNILNDNQKLVPALQLLQDLQKDGITPDKWGPVLKAFEEQFQPASPAYNAQNDYVRGRGRSRSPDRGGRGGRGSPVYGSYDADAAKRQGEEHRDQRGGRGRYRQRSPIRNSPGPGSFGGRGMQPKYIAYDNTLPPDHIKVLSRTLFVGGANGTQQEIQELFERFGRVQTCIANRDKRHAFVKMTTRQYALAAKQGMEDLQNRNDRETMNIARQTKWGVGFGPRECCDYQRGESTIPIHKLTEADMKWLLTAEYGGTGGKQVEGGMVLEEPDIEIGAGVSSKAMSKRVGPDNNPQPKKQKEDRGGRRNKGGDRDQGYAGYSGVTGGPPAMDYGYARPEPVAVATPPAVPGFGFSLLPPGNGQTFR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.12
3	0.13
4	0.13
5	0.15
6	0.15
7	0.17
8	0.22
9	0.31
10	0.34
11	0.38
12	0.44
13	0.51
14	0.56
15	0.57
16	0.54
17	0.48
18	0.45
19	0.43
20	0.4
21	0.33
22	0.28
23	0.27
24	0.27
25	0.26
26	0.21
27	0.18
28	0.15
29	0.15
30	0.16
31	0.17
32	0.16
33	0.14
34	0.13
35	0.13
36	0.15
37	0.2
38	0.25
39	0.24
40	0.25
41	0.32
42	0.39
43	0.47
44	0.53
45	0.55
46	0.57
47	0.59
48	0.61
49	0.54
50	0.48
51	0.41
52	0.33
53	0.25
54	0.19
55	0.16
56	0.12
57	0.1
58	0.1
59	0.12
60	0.11
61	0.11
62	0.14
63	0.21
64	0.24
65	0.29
66	0.33
67	0.34
68	0.37
69	0.41
70	0.44
71	0.4
72	0.41
73	0.38
74	0.38
75	0.35
76	0.31
77	0.28
78	0.22
79	0.2
80	0.17
81	0.15
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.15
88	0.14
89	0.13
90	0.14
91	0.18
92	0.18
93	0.19
94	0.2
95	0.17
96	0.18
97	0.18
98	0.17
99	0.13
100	0.12
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.09
105	0.09
106	0.09
107	0.15
108	0.19
109	0.26
110	0.3
111	0.35
112	0.36
113	0.39
114	0.41
115	0.37
116	0.35
117	0.29
118	0.34
119	0.3
120	0.29
121	0.26
122	0.24
123	0.23
124	0.22
125	0.24
126	0.17
127	0.16
128	0.18
129	0.23
130	0.23
131	0.25
132	0.29
133	0.28
134	0.34
135	0.34
136	0.32
137	0.32
138	0.31
139	0.28
140	0.26
141	0.26
142	0.18
143	0.18
144	0.18
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.11
149	0.07
150	0.07
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.08
155	0.09
156	0.13
157	0.13
158	0.14
159	0.17
160	0.19
161	0.21
162	0.21
163	0.21
164	0.22
165	0.23
166	0.23
167	0.21
168	0.23
169	0.28
170	0.27
171	0.29
172	0.31
173	0.33
174	0.34
175	0.34
176	0.33
177	0.29
178	0.29
179	0.29
180	0.29
181	0.34
182	0.33
183	0.32
184	0.29
185	0.29
186	0.28
187	0.26
188	0.23
189	0.16
190	0.16
191	0.17
192	0.2
193	0.16
194	0.15
195	0.16
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.13
200	0.15
201	0.16
202	0.17
203	0.17
204	0.18
205	0.17
206	0.17
207	0.17
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.08
214	0.11
215	0.13
216	0.19
217	0.19
218	0.21
219	0.28
220	0.34
221	0.39
222	0.42
223	0.48
224	0.52
225	0.58
226	0.6
227	0.63
228	0.58
229	0.56
230	0.56
231	0.55
232	0.48
233	0.45
234	0.45
235	0.37
236	0.37
237	0.35
238	0.3
239	0.25
240	0.23
241	0.18
242	0.14
243	0.15
244	0.14
245	0.12
246	0.09
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.13
268	0.15
269	0.18
270	0.18
271	0.2
272	0.19
273	0.21
274	0.21
275	0.18
276	0.17
277	0.17
278	0.17
279	0.16
280	0.13
281	0.13
282	0.13
283	0.12
284	0.13
285	0.11
286	0.14
287	0.14
288	0.18
289	0.16
290	0.15
291	0.15
292	0.17
293	0.18
294	0.17
295	0.18
296	0.18
297	0.21
298	0.25
299	0.26
300	0.25
301	0.27
302	0.29
303	0.28
304	0.25
305	0.24
306	0.22
307	0.2
308	0.2
309	0.22
310	0.22
311	0.22
312	0.22
313	0.24
314	0.23
315	0.23
316	0.22
317	0.17
318	0.17
319	0.16
320	0.15
321	0.12
322	0.14
323	0.16
324	0.15
325	0.13
326	0.15
327	0.17
328	0.17
329	0.17
330	0.17
331	0.16
332	0.19
333	0.22
334	0.2
335	0.18
336	0.2
337	0.22
338	0.2
339	0.2
340	0.24
341	0.26
342	0.3
343	0.34
344	0.34
345	0.33
346	0.34
347	0.35
348	0.35
349	0.33
350	0.28
351	0.25
352	0.26
353	0.25
354	0.25
355	0.23
356	0.18
357	0.17
358	0.18
359	0.17
360	0.18
361	0.2
362	0.19
363	0.19
364	0.2
365	0.2
366	0.18
367	0.16
368	0.14
369	0.13
370	0.14
371	0.11
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.1
380	0.12
381	0.13
382	0.14
383	0.15
384	0.17
385	0.15
386	0.13
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.12
403	0.1
404	0.12
405	0.13
406	0.15
407	0.15
408	0.15
409	0.16
410	0.15
411	0.16
412	0.15
413	0.18
414	0.17
415	0.19
416	0.2
417	0.2
418	0.16
419	0.15
420	0.15
421	0.11
422	0.12
423	0.09
424	0.11
425	0.12
426	0.16
427	0.17
428	0.16
429	0.19
430	0.19
431	0.2
432	0.21
433	0.21
434	0.18
435	0.2
436	0.23
437	0.26
438	0.35
439	0.41
440	0.47
441	0.5
442	0.56
443	0.57
444	0.61
445	0.58
446	0.51
447	0.47
448	0.39
449	0.37
450	0.3
451	0.26
452	0.19
453	0.18
454	0.17
455	0.14
456	0.13
457	0.11
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.12
462	0.1
463	0.11
464	0.11
465	0.12
466	0.15
467	0.21
468	0.27
469	0.32
470	0.38
471	0.41
472	0.4
473	0.46
474	0.5
475	0.49
476	0.47
477	0.51
478	0.53
479	0.58
480	0.64
481	0.67
482	0.67
483	0.72
484	0.74
485	0.74
486	0.74
487	0.7
488	0.66
489	0.61
490	0.55
491	0.47
492	0.41
493	0.34
494	0.26
495	0.22
496	0.21
497	0.19
498	0.2
499	0.19
500	0.2
501	0.17
502	0.16
503	0.18
504	0.2
505	0.18
506	0.18
507	0.23
508	0.22
509	0.26
510	0.26
511	0.23
512	0.22
513	0.24
514	0.22
515	0.18
516	0.19
517	0.17
518	0.23
519	0.24
520	0.24
521	0.22
522	0.21
523	0.2
524	0.17
525	0.17
526	0.11
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.12
537	0.13
538	0.13
539	0.15
540	0.17
541	0.15
542	0.19
543	0.19
544	0.17
545	0.18
546	0.22
547	0.24
548	0.29
549	0.36
550	0.4
551	0.4
552	0.47
553	0.49
554	0.48
555	0.49
556	0.48
557	0.44
558	0.43
559	0.52
560	0.51
561	0.54
562	0.52
563	0.49
564	0.44
565	0.43
566	0.4
567	0.32
568	0.3
569	0.25
570	0.23
571	0.23
572	0.22
573	0.2
574	0.18
575	0.21
576	0.19
577	0.25
578	0.31
579	0.31
580	0.32
581	0.34
582	0.31
583	0.31
584	0.33
585	0.31
586	0.32
587	0.38
588	0.38
589	0.38
590	0.39
591	0.38
592	0.34
593	0.31
594	0.25
595	0.21
596	0.24
597	0.29
598	0.31
599	0.36
600	0.33
601	0.36
602	0.35
603	0.35
604	0.34
605	0.32
606	0.32
607	0.31
608	0.33
609	0.29
610	0.32
611	0.34
612	0.38
613	0.36
614	0.34
615	0.28
616	0.27
617	0.26
618	0.26
619	0.3
620	0.23
621	0.24
622	0.24
623	0.24
624	0.23
625	0.23
626	0.2
627	0.11
628	0.11
629	0.08
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.06
634	0.08
635	0.08
636	0.08
637	0.07
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.07
647	0.06
648	0.05
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.05
658	0.08
659	0.1
660	0.13
661	0.14
662	0.19
663	0.27
664	0.37
665	0.44
666	0.46
667	0.55
668	0.63
669	0.72
670	0.73
671	0.7
672	0.7
673	0.7
674	0.75
675	0.74
676	0.74
677	0.73
678	0.8
679	0.85
680	0.87
681	0.9
682	0.87
683	0.87
684	0.84
685	0.8
686	0.78
687	0.74
688	0.73
689	0.67
690	0.64
691	0.57
692	0.5
693	0.45
694	0.36
695	0.29
696	0.2
697	0.14
698	0.11
699	0.1
700	0.09
701	0.07
702	0.06
703	0.07
704	0.06
705	0.07
706	0.07
707	0.07
708	0.09
709	0.12
710	0.19
711	0.19
712	0.19
713	0.19
714	0.19
715	0.19
716	0.19
717	0.2
718	0.14
719	0.17
720	0.18
721	0.18
722	0.19
723	0.19
724	0.17
725	0.13
726	0.14
727	0.13
728	0.13
729	0.13
730	0.12
731	0.19
732	0.19
733	0.2
734	0.19
735	0.19

A0A139HVW0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer