FuNGI

A0A139HGC6

Protein Details

Accession

A0A139HGC6

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
45-77	AHAARPQTPKKDQHQEARGKRHQRQFNDLVRRY	Hydrophilic
850-879	EEMTEKERQRARRRAERHIRRQRKEAAASQ	Basic
928-948	QVVPGRFGGRPPPKKKRKSGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
856-873	ERQRARRRAERHIRRQRK
935-947	GGRPPPKKKRKSG

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MADGKSKRDLPYGHFGRAGYIPDDEIWRFERAPVSHTSIHPFENAHAARPQTPKKDQHQEARGKRHQRQFNDLVRRYPDLHGTASVALPFLRVSEAIEEAVHCHDPNVGSLIQKTSFRSETTHRMIPVVASVAGEAGELLHISQVHLQRQGWEEDKELYFEVPILHGDEVTWDAQLGPIQQICFAKPIERGECLLAVRYLTKVLLVRPTSRRGIASNVSESGISTELLYAVERAGLPHADVAFNPWFGLQIAVINQAGYWNVIEFDSRKMKRVAKSWATSGPINSSSKEQALYDGWARIAWVMNSETILVCVRRSIKLFRIDESEAVLQKTMDLELLGDTDWILDFQQDGNHQDCCYILTSTYLILLQFRKTLQGELNVRVKARVRHYRNPEDLSMRLHAFAADQDAWILVSSRRAEISFAYRFSHTDSDHISAAPPVQLELPIALCEVLDLRIEPVNKVQPRPASSSQDQFDGALYFSAFVLRRDSSMLSTSLLSSSDGRKSLGRRPSQSSWTSKLSATATRLRGDNFIVDEAEEMTPFLQPTMPTARRARRQEQQRGPDQGSRDLERVASALRHPIHGLHPVDQVLESADATIAQRRESPLQSLHTVASLATAEIGIADVQQSSDLLEELGVGVPRAIEPVADIDSQLESSQRWKLDHMSLAAVIELEEDLAGRDLQTVYNRLVTQWITPLPEETSGWIRLAKVSIARSIAAEITLASRTLRLERDPGKDDIAEAPTEHATGNSYSIPVRSQPSSIPWAAKHSVPPTPSPTATPSVTTASSHYSSLAAPELYRLGKYINFSKPSPMVLPKPLTKVLSHWDVGADPNDYDWLSTSKDITRQEEEEGQNEEMTEKERQRARRRAERHIRRQRKEAAASQAQQLASSQAPEILSASQPVAFKVESQPAHAAGSSQSQGLGLSASNIASQVVPGRFGGRPPPKKKRKSGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.45
3	0.41
4	0.41
5	0.37
6	0.28
7	0.24
8	0.21
9	0.2
10	0.24
11	0.21
12	0.22
13	0.21
14	0.23
15	0.22
16	0.24
17	0.3
18	0.27
19	0.3
20	0.32
21	0.36
22	0.38
23	0.39
24	0.43
25	0.39
26	0.39
27	0.37
28	0.33
29	0.28
30	0.32
31	0.31
32	0.28
33	0.29
34	0.3
35	0.35
36	0.43
37	0.5
38	0.49
39	0.58
40	0.63
41	0.69
42	0.77
43	0.78
44	0.8
45	0.82
46	0.83
47	0.84
48	0.86
49	0.85
50	0.85
51	0.86
52	0.85
53	0.84
54	0.8
55	0.8
56	0.79
57	0.8
58	0.81
59	0.76
60	0.72
61	0.68
62	0.65
63	0.59
64	0.52
65	0.48
66	0.4
67	0.38
68	0.33
69	0.3
70	0.28
71	0.25
72	0.22
73	0.16
74	0.13
75	0.11
76	0.1
77	0.09
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.1
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.15
88	0.15
89	0.13
90	0.12
91	0.14
92	0.14
93	0.15
94	0.17
95	0.15
96	0.16
97	0.18
98	0.21
99	0.21
100	0.23
101	0.24
102	0.26
103	0.28
104	0.27
105	0.3
106	0.33
107	0.4
108	0.44
109	0.46
110	0.4
111	0.39
112	0.38
113	0.34
114	0.3
115	0.23
116	0.16
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.09
121	0.08
122	0.06
123	0.04
124	0.04
125	0.04
126	0.04
127	0.05
128	0.05
129	0.06
130	0.12
131	0.16
132	0.19
133	0.23
134	0.24
135	0.26
136	0.29
137	0.34
138	0.32
139	0.3
140	0.28
141	0.29
142	0.29
143	0.27
144	0.25
145	0.2
146	0.16
147	0.15
148	0.14
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.1
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.12
167	0.15
168	0.16
169	0.16
170	0.18
171	0.18
172	0.18
173	0.21
174	0.27
175	0.27
176	0.27
177	0.28
178	0.27
179	0.29
180	0.26
181	0.24
182	0.18
183	0.16
184	0.15
185	0.14
186	0.13
187	0.1
188	0.12
189	0.12
190	0.14
191	0.21
192	0.22
193	0.28
194	0.32
195	0.38
196	0.39
197	0.39
198	0.39
199	0.33
200	0.36
201	0.35
202	0.35
203	0.32
204	0.3
205	0.29
206	0.26
207	0.25
208	0.2
209	0.15
210	0.11
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.08
216	0.06
217	0.05
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.09
228	0.14
229	0.14
230	0.14
231	0.13
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.07
251	0.08
252	0.13
253	0.23
254	0.23
255	0.27
256	0.32
257	0.38
258	0.42
259	0.47
260	0.52
261	0.5
262	0.53
263	0.53
264	0.52
265	0.5
266	0.45
267	0.4
268	0.34
269	0.3
270	0.28
271	0.25
272	0.23
273	0.22
274	0.22
275	0.22
276	0.18
277	0.16
278	0.16
279	0.17
280	0.16
281	0.15
282	0.14
283	0.13
284	0.13
285	0.11
286	0.11
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.08
297	0.07
298	0.1
299	0.12
300	0.14
301	0.17
302	0.2
303	0.25
304	0.34
305	0.36
306	0.34
307	0.38
308	0.37
309	0.34
310	0.33
311	0.3
312	0.22
313	0.21
314	0.19
315	0.13
316	0.12
317	0.12
318	0.09
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.03
332	0.04
333	0.04
334	0.07
335	0.08
336	0.11
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.1
345	0.08
346	0.08
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.07
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.14
358	0.14
359	0.16
360	0.16
361	0.22
362	0.24
363	0.27
364	0.33
365	0.3
366	0.3
367	0.3
368	0.31
369	0.29
370	0.34
371	0.4
372	0.42
373	0.5
374	0.59
375	0.66
376	0.68
377	0.66
378	0.61
379	0.54
380	0.47
381	0.41
382	0.35
383	0.26
384	0.21
385	0.18
386	0.15
387	0.12
388	0.1
389	0.11
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.08
397	0.05
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.17
406	0.16
407	0.16
408	0.18
409	0.17
410	0.18
411	0.2
412	0.22
413	0.17
414	0.17
415	0.18
416	0.18
417	0.18
418	0.18
419	0.15
420	0.12
421	0.12
422	0.1
423	0.08
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.07
441	0.08
442	0.08
443	0.11
444	0.17
445	0.19
446	0.2
447	0.22
448	0.24
449	0.27
450	0.34
451	0.35
452	0.35
453	0.35
454	0.39
455	0.36
456	0.34
457	0.31
458	0.24
459	0.2
460	0.14
461	0.12
462	0.07
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.12
474	0.11
475	0.12
476	0.12
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.08
484	0.1
485	0.11
486	0.11
487	0.12
488	0.15
489	0.17
490	0.24
491	0.31
492	0.34
493	0.36
494	0.42
495	0.45
496	0.49
497	0.51
498	0.49
499	0.45
500	0.43
501	0.41
502	0.34
503	0.33
504	0.28
505	0.26
506	0.25
507	0.27
508	0.25
509	0.25
510	0.26
511	0.24
512	0.23
513	0.21
514	0.19
515	0.13
516	0.12
517	0.1
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.08
531	0.17
532	0.18
533	0.22
534	0.29
535	0.36
536	0.43
537	0.5
538	0.53
539	0.53
540	0.61
541	0.67
542	0.7
543	0.7
544	0.69
545	0.67
546	0.65
547	0.6
548	0.52
549	0.47
550	0.41
551	0.36
552	0.3
553	0.25
554	0.22
555	0.19
556	0.17
557	0.12
558	0.1
559	0.08
560	0.14
561	0.14
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.17
566	0.22
567	0.23
568	0.2
569	0.21
570	0.2
571	0.2
572	0.18
573	0.16
574	0.1
575	0.09
576	0.07
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.09
582	0.09
583	0.09
584	0.11
585	0.13
586	0.17
587	0.18
588	0.21
589	0.21
590	0.23
591	0.24
592	0.24
593	0.22
594	0.18
595	0.17
596	0.14
597	0.11
598	0.08
599	0.06
600	0.05
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.04
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.04
628	0.04
629	0.06
630	0.08
631	0.08
632	0.08
633	0.08
634	0.09
635	0.09
636	0.09
637	0.08
638	0.06
639	0.09
640	0.13
641	0.15
642	0.15
643	0.17
644	0.21
645	0.24
646	0.27
647	0.26
648	0.23
649	0.21
650	0.2
651	0.18
652	0.14
653	0.1
654	0.07
655	0.05
656	0.04
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.06
664	0.06
665	0.08
666	0.1
667	0.12
668	0.13
669	0.17
670	0.17
671	0.16
672	0.18
673	0.17
674	0.16
675	0.18
676	0.18
677	0.16
678	0.17
679	0.18
680	0.16
681	0.17
682	0.16
683	0.15
684	0.17
685	0.16
686	0.16
687	0.16
688	0.15
689	0.15
690	0.16
691	0.15
692	0.15
693	0.16
694	0.18
695	0.18
696	0.18
697	0.17
698	0.17
699	0.15
700	0.12
701	0.1
702	0.07
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.07
707	0.08
708	0.09
709	0.12
710	0.15
711	0.15
712	0.22
713	0.28
714	0.34
715	0.37
716	0.38
717	0.37
718	0.35
719	0.34
720	0.3
721	0.26
722	0.2
723	0.16
724	0.17
725	0.14
726	0.15
727	0.13
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.12
732	0.1
733	0.11
734	0.11
735	0.12
736	0.13
737	0.14
738	0.17
739	0.17
740	0.18
741	0.19
742	0.23
743	0.28
744	0.29
745	0.29
746	0.26
747	0.31
748	0.32
749	0.32
750	0.33
751	0.3
752	0.33
753	0.32
754	0.34
755	0.34
756	0.37
757	0.36
758	0.33
759	0.34
760	0.33
761	0.32
762	0.3
763	0.26
764	0.24
765	0.24
766	0.23
767	0.2
768	0.21
769	0.21
770	0.2
771	0.18
772	0.16
773	0.15
774	0.16
775	0.17
776	0.12
777	0.11
778	0.12
779	0.14
780	0.14
781	0.14
782	0.13
783	0.13
784	0.15
785	0.19
786	0.26
787	0.31
788	0.34
789	0.35
790	0.4
791	0.4
792	0.41
793	0.41
794	0.4
795	0.36
796	0.4
797	0.45
798	0.43
799	0.47
800	0.48
801	0.45
802	0.4
803	0.38
804	0.37
805	0.37
806	0.33
807	0.28
808	0.25
809	0.24
810	0.25
811	0.24
812	0.19
813	0.13
814	0.13
815	0.14
816	0.13
817	0.13
818	0.12
819	0.12
820	0.13
821	0.14
822	0.16
823	0.18
824	0.24
825	0.29
826	0.33
827	0.36
828	0.35
829	0.38
830	0.44
831	0.42
832	0.4
833	0.39
834	0.35
835	0.3
836	0.28
837	0.24
838	0.17
839	0.18
840	0.22
841	0.2
842	0.27
843	0.33
844	0.43
845	0.53
846	0.62
847	0.69
848	0.72
849	0.77
850	0.81
851	0.86
852	0.87
853	0.88
854	0.9
855	0.91
856	0.87
857	0.89
858	0.88
859	0.86
860	0.82
861	0.78
862	0.76
863	0.74
864	0.69
865	0.64
866	0.59
867	0.49
868	0.42
869	0.35
870	0.28
871	0.2
872	0.19
873	0.15
874	0.13
875	0.13
876	0.14
877	0.14
878	0.13
879	0.13
880	0.13
881	0.14
882	0.15
883	0.15
884	0.15
885	0.17
886	0.15
887	0.17
888	0.21
889	0.28
890	0.26
891	0.3
892	0.32
893	0.3
894	0.31
895	0.29
896	0.25
897	0.18
898	0.23
899	0.2
900	0.17
901	0.16
902	0.14
903	0.14
904	0.13
905	0.12
906	0.07
907	0.08
908	0.09
909	0.09
910	0.09
911	0.09
912	0.09
913	0.08
914	0.09
915	0.14
916	0.14
917	0.15
918	0.16
919	0.2
920	0.2
921	0.22
922	0.32
923	0.37
924	0.47
925	0.56
926	0.66
927	0.74
928	0.83

A0A139HGC6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer