Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HU17

Protein Details
Accession A0A139HU17    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-337VEKFNKMKSKDREKLIERKRKKEGQKEKRRMPNARRIPAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-337AAKRAKNEEDREKLERKVGSMENRLKAKESKEREQEILRRHRKEERERVEQGKNPYYLKKKDIKEKALVEKFNKMKSKDREKLIERKRKKEGQKEKRRMPNARRIPAG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MTAQRQRNARPQPEDISDHGEESAMDSTGEEDVEMDGIEEGSQSDAEESGSDASEAQADSKQTLSDVVQNSGLSFDALQTAFKHAANAQSRKRKRGSDTSPDQEDKLQALRERLRQIKDQKTASSTSRKTPKSNAKDFQDEHEETSDSDSDSAPSEEGAPSRASKHAPAAQSSKFQVSRKRQVVDVPKRVVRDPRFDALHQKSAHPGNSEKAYSFLNDYQKDEIKELKEAAKRAKNEEDREKLERKVGSMENRLKAKESKEREQEILRRHRKEERERVEQGKNPYYLKKKDIKEKALVEKFNKMKSKDREKLIERKRKKEGQKEKRRMPNARRIPAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.58
3 0.55
4 0.46
5 0.4
6 0.34
7 0.28
8 0.22
9 0.19
10 0.18
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.07
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.06
30 0.05
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.1
50 0.12
51 0.12
52 0.16
53 0.17
54 0.18
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.14
72 0.23
73 0.3
74 0.37
75 0.42
76 0.51
77 0.56
78 0.62
79 0.67
80 0.65
81 0.64
82 0.67
83 0.67
84 0.67
85 0.71
86 0.7
87 0.71
88 0.65
89 0.59
90 0.49
91 0.42
92 0.33
93 0.27
94 0.23
95 0.19
96 0.24
97 0.28
98 0.32
99 0.38
100 0.42
101 0.43
102 0.47
103 0.54
104 0.58
105 0.6
106 0.57
107 0.52
108 0.49
109 0.49
110 0.46
111 0.46
112 0.39
113 0.4
114 0.46
115 0.47
116 0.47
117 0.53
118 0.59
119 0.59
120 0.66
121 0.65
122 0.61
123 0.64
124 0.62
125 0.57
126 0.54
127 0.45
128 0.38
129 0.33
130 0.28
131 0.21
132 0.22
133 0.18
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.1
149 0.11
150 0.11
151 0.12
152 0.16
153 0.19
154 0.19
155 0.22
156 0.25
157 0.24
158 0.26
159 0.26
160 0.26
161 0.25
162 0.27
163 0.33
164 0.37
165 0.45
166 0.48
167 0.48
168 0.45
169 0.48
170 0.57
171 0.57
172 0.57
173 0.52
174 0.49
175 0.49
176 0.5
177 0.52
178 0.45
179 0.43
180 0.39
181 0.39
182 0.39
183 0.39
184 0.46
185 0.42
186 0.45
187 0.38
188 0.35
189 0.35
190 0.35
191 0.36
192 0.3
193 0.27
194 0.23
195 0.26
196 0.26
197 0.21
198 0.19
199 0.18
200 0.16
201 0.18
202 0.19
203 0.23
204 0.24
205 0.26
206 0.28
207 0.31
208 0.31
209 0.29
210 0.29
211 0.23
212 0.24
213 0.24
214 0.27
215 0.28
216 0.3
217 0.37
218 0.39
219 0.39
220 0.43
221 0.5
222 0.51
223 0.55
224 0.61
225 0.59
226 0.59
227 0.63
228 0.61
229 0.53
230 0.51
231 0.45
232 0.37
233 0.36
234 0.36
235 0.37
236 0.42
237 0.47
238 0.48
239 0.5
240 0.5
241 0.47
242 0.46
243 0.46
244 0.46
245 0.46
246 0.49
247 0.55
248 0.59
249 0.59
250 0.62
251 0.62
252 0.63
253 0.66
254 0.66
255 0.62
256 0.63
257 0.67
258 0.7
259 0.74
260 0.75
261 0.73
262 0.72
263 0.74
264 0.77
265 0.76
266 0.71
267 0.68
268 0.65
269 0.6
270 0.54
271 0.56
272 0.58
273 0.56
274 0.58
275 0.59
276 0.6
277 0.67
278 0.73
279 0.72
280 0.72
281 0.75
282 0.77
283 0.76
284 0.76
285 0.68
286 0.68
287 0.66
288 0.66
289 0.65
290 0.59
291 0.6
292 0.64
293 0.72
294 0.7
295 0.73
296 0.75
297 0.75
298 0.81
299 0.82
300 0.83
301 0.81
302 0.82
303 0.84
304 0.84
305 0.87
306 0.87
307 0.88
308 0.88
309 0.9
310 0.92
311 0.93
312 0.94
313 0.93
314 0.93
315 0.91
316 0.91
317 0.9