Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HDT9

Protein Details
Accession A0A139HDT9    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-202DLTIENKKLKRKLKKYEKLHDSHLKDBasic
552-575IDTPDRRSPRKRPKLSHRNSGKSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-191KKLKRKLKK
557-571RRSPRKRPKLSHRNS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018554  FRQ  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007623  P:circadian rhythm  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09421  FRQ  
Amino Acid Sequences MATHRPTPMIVMTPPAQPGASSSPPPRRPPAHRSVSLVHSPRRKTSPPGRDQSDSSSDDQGRTNSKGATDGKNSDGSPSSLQPLGRDSSGESSNAEKWFEKSNNEVRDSAPFADNDPPFFMRHSSSSETPPEAQQQQMRNLLANSNNASGSLPLRTGLLHLGTDGSSTEDYRGVIDDLTIENKKLKRKLKKYEKLHDSHLKDDKLFEVRIHGLPAAKKRELEETLRKFTASLGSDSFPASGYEGIVPALPTLATHKTGTSSQASLQNADSAYASMSASGQGSSAAQSGGETSNKRSAPNAALRRQNIHTYLHHIPEGLLPQPSPANMTERMKKKLVVRRLEQVFAGKGAVGGHHHPQQQQEVSQSAARADRAASEGAGRRSRQEGTREARIMRGRDGKETVVQTHNNVSPDDSSPDEQQTTVTGKRPADAISRQNSSVEQRPTRPLDLDPHRAQVPTDNILYMRHLGFSPPDPESLEAAAEGHGWVYLNLLINMAQLHTINVTADFVRKAISEYSSKFELSHDERKVRWKGGSSVTRGSSSGGTSSNSRADIDTPDRRSPRKRPKLSHRNSGKSGAPAVENNKWMYTPLFFHKDSTDDAEDSSEEEDDSMSSSWPAPAAGDSSGMTSSGGMRTSSSKRHKRDDGPIIFYNNARFCTDLSGDRSSKGNNAPPYVAATAQPIGMPQSSTNTYRFEKRGPLAEASELPEPMDLGDNPIPESMELGFPAQSPLSSEQKRAVKPVELEVTGIGGVWPTDNFSIAVESRHARLDQEQAPSVSHEKPPRSLPARFARILDEDGAARRTRAAVHKEVIVKERKELPPSQLPAALSYMPFSEDSNGDDSDVDDDVSVTPASPGEFPPATAPQPVQLHYASSEDEDDGYESSDDGSLDLLAAAREIDPDAVREQEREYEANMAERLAEEIPAGSSAATAGGGSGFASPASQMNREDYEKAVKNARSRQSLNRSQTTDSMKVNTAKVPAEQCSSEDEDKDEEMDDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.26
3 0.23
4 0.18
5 0.22
6 0.24
7 0.26
8 0.29
9 0.36
10 0.45
11 0.53
12 0.59
13 0.64
14 0.65
15 0.69
16 0.73
17 0.75
18 0.75
19 0.72
20 0.72
21 0.69
22 0.67
23 0.68
24 0.65
25 0.63
26 0.61
27 0.61
28 0.62
29 0.65
30 0.62
31 0.63
32 0.67
33 0.7
34 0.71
35 0.76
36 0.76
37 0.72
38 0.71
39 0.68
40 0.64
41 0.57
42 0.5
43 0.48
44 0.43
45 0.41
46 0.4
47 0.37
48 0.35
49 0.35
50 0.35
51 0.29
52 0.28
53 0.33
54 0.35
55 0.38
56 0.39
57 0.39
58 0.4
59 0.42
60 0.42
61 0.38
62 0.35
63 0.31
64 0.28
65 0.27
66 0.27
67 0.26
68 0.26
69 0.24
70 0.25
71 0.25
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.22
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.21
80 0.25
81 0.26
82 0.26
83 0.23
84 0.23
85 0.31
86 0.33
87 0.33
88 0.37
89 0.44
90 0.49
91 0.51
92 0.5
93 0.43
94 0.45
95 0.45
96 0.4
97 0.33
98 0.26
99 0.25
100 0.32
101 0.31
102 0.28
103 0.28
104 0.26
105 0.25
106 0.26
107 0.26
108 0.21
109 0.23
110 0.26
111 0.29
112 0.3
113 0.34
114 0.37
115 0.39
116 0.37
117 0.37
118 0.39
119 0.35
120 0.37
121 0.38
122 0.4
123 0.42
124 0.46
125 0.44
126 0.4
127 0.38
128 0.38
129 0.35
130 0.34
131 0.3
132 0.26
133 0.25
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.17
138 0.14
139 0.12
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.2
169 0.24
170 0.32
171 0.39
172 0.47
173 0.54
174 0.63
175 0.74
176 0.79
177 0.86
178 0.89
179 0.91
180 0.91
181 0.84
182 0.83
183 0.82
184 0.74
185 0.72
186 0.7
187 0.61
188 0.52
189 0.49
190 0.43
191 0.38
192 0.35
193 0.27
194 0.24
195 0.25
196 0.26
197 0.26
198 0.23
199 0.22
200 0.26
201 0.33
202 0.35
203 0.33
204 0.33
205 0.34
206 0.4
207 0.4
208 0.43
209 0.46
210 0.47
211 0.51
212 0.5
213 0.48
214 0.41
215 0.38
216 0.37
217 0.29
218 0.24
219 0.2
220 0.2
221 0.21
222 0.22
223 0.2
224 0.14
225 0.12
226 0.11
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.16
244 0.17
245 0.21
246 0.2
247 0.18
248 0.19
249 0.25
250 0.25
251 0.25
252 0.24
253 0.23
254 0.2
255 0.19
256 0.16
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.07
275 0.09
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.22
280 0.23
281 0.24
282 0.24
283 0.25
284 0.29
285 0.37
286 0.42
287 0.42
288 0.48
289 0.49
290 0.53
291 0.51
292 0.49
293 0.42
294 0.38
295 0.33
296 0.33
297 0.35
298 0.33
299 0.3
300 0.26
301 0.24
302 0.22
303 0.22
304 0.17
305 0.14
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.13
313 0.17
314 0.22
315 0.28
316 0.33
317 0.38
318 0.38
319 0.41
320 0.45
321 0.49
322 0.54
323 0.54
324 0.52
325 0.57
326 0.58
327 0.55
328 0.48
329 0.42
330 0.33
331 0.26
332 0.22
333 0.13
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.1
339 0.13
340 0.17
341 0.2
342 0.21
343 0.23
344 0.27
345 0.27
346 0.27
347 0.25
348 0.21
349 0.2
350 0.2
351 0.18
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.11
362 0.14
363 0.18
364 0.22
365 0.21
366 0.21
367 0.24
368 0.27
369 0.28
370 0.29
371 0.33
372 0.34
373 0.41
374 0.42
375 0.4
376 0.43
377 0.43
378 0.39
379 0.37
380 0.4
381 0.34
382 0.34
383 0.36
384 0.31
385 0.31
386 0.31
387 0.29
388 0.25
389 0.25
390 0.23
391 0.25
392 0.26
393 0.23
394 0.22
395 0.19
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.16
404 0.14
405 0.13
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.16
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.2
414 0.2
415 0.22
416 0.24
417 0.27
418 0.27
419 0.29
420 0.29
421 0.29
422 0.28
423 0.27
424 0.29
425 0.29
426 0.27
427 0.28
428 0.33
429 0.35
430 0.35
431 0.33
432 0.28
433 0.31
434 0.34
435 0.39
436 0.35
437 0.35
438 0.34
439 0.33
440 0.31
441 0.27
442 0.24
443 0.18
444 0.17
445 0.15
446 0.14
447 0.15
448 0.16
449 0.13
450 0.1
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.1
464 0.08
465 0.07
466 0.06
467 0.06
468 0.05
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.04
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.1
499 0.12
500 0.13
501 0.16
502 0.17
503 0.17
504 0.16
505 0.16
506 0.19
507 0.22
508 0.28
509 0.29
510 0.3
511 0.32
512 0.39
513 0.42
514 0.39
515 0.35
516 0.3
517 0.31
518 0.36
519 0.41
520 0.37
521 0.37
522 0.36
523 0.35
524 0.32
525 0.29
526 0.21
527 0.16
528 0.13
529 0.1
530 0.1
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.12
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.15
539 0.2
540 0.24
541 0.27
542 0.32
543 0.35
544 0.39
545 0.45
546 0.52
547 0.58
548 0.62
549 0.67
550 0.71
551 0.79
552 0.86
553 0.86
554 0.86
555 0.84
556 0.8
557 0.74
558 0.69
559 0.59
560 0.49
561 0.44
562 0.34
563 0.26
564 0.21
565 0.22
566 0.21
567 0.21
568 0.2
569 0.19
570 0.18
571 0.17
572 0.16
573 0.13
574 0.12
575 0.15
576 0.2
577 0.2
578 0.21
579 0.21
580 0.22
581 0.22
582 0.24
583 0.21
584 0.16
585 0.16
586 0.15
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.08
591 0.06
592 0.06
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.06
597 0.05
598 0.06
599 0.06
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.07
608 0.07
609 0.08
610 0.08
611 0.08
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.07
617 0.07
618 0.08
619 0.12
620 0.16
621 0.25
622 0.34
623 0.42
624 0.47
625 0.55
626 0.62
627 0.64
628 0.71
629 0.72
630 0.68
631 0.65
632 0.62
633 0.57
634 0.5
635 0.44
636 0.39
637 0.3
638 0.26
639 0.2
640 0.18
641 0.16
642 0.19
643 0.2
644 0.19
645 0.21
646 0.25
647 0.25
648 0.26
649 0.27
650 0.24
651 0.26
652 0.26
653 0.28
654 0.26
655 0.28
656 0.27
657 0.26
658 0.29
659 0.26
660 0.22
661 0.16
662 0.15
663 0.13
664 0.12
665 0.12
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.07
671 0.11
672 0.14
673 0.16
674 0.18
675 0.21
676 0.23
677 0.28
678 0.3
679 0.3
680 0.34
681 0.34
682 0.39
683 0.38
684 0.38
685 0.34
686 0.33
687 0.31
688 0.27
689 0.26
690 0.19
691 0.16
692 0.13
693 0.12
694 0.1
695 0.11
696 0.08
697 0.11
698 0.13
699 0.13
700 0.14
701 0.14
702 0.14
703 0.12
704 0.13
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.1
712 0.08
713 0.07
714 0.1
715 0.14
716 0.22
717 0.23
718 0.24
719 0.3
720 0.37
721 0.39
722 0.4
723 0.39
724 0.36
725 0.36
726 0.4
727 0.38
728 0.31
729 0.3
730 0.25
731 0.23
732 0.17
733 0.15
734 0.09
735 0.05
736 0.04
737 0.04
738 0.04
739 0.06
740 0.06
741 0.07
742 0.07
743 0.08
744 0.1
745 0.1
746 0.12
747 0.12
748 0.14
749 0.14
750 0.17
751 0.17
752 0.16
753 0.18
754 0.24
755 0.26
756 0.29
757 0.3
758 0.29
759 0.29
760 0.3
761 0.31
762 0.27
763 0.28
764 0.3
765 0.31
766 0.34
767 0.37
768 0.44
769 0.46
770 0.46
771 0.49
772 0.52
773 0.56
774 0.54
775 0.51
776 0.45
777 0.42
778 0.41
779 0.33
780 0.24
781 0.19
782 0.19
783 0.21
784 0.18
785 0.15
786 0.14
787 0.14
788 0.17
789 0.24
790 0.28
791 0.32
792 0.33
793 0.39
794 0.43
795 0.45
796 0.48
797 0.48
798 0.42
799 0.41
800 0.48
801 0.47
802 0.47
803 0.48
804 0.48
805 0.49
806 0.51
807 0.49
808 0.43
809 0.4
810 0.36
811 0.35
812 0.29
813 0.2
814 0.17
815 0.15
816 0.13
817 0.13
818 0.12
819 0.12
820 0.12
821 0.14
822 0.16
823 0.15
824 0.15
825 0.14
826 0.14
827 0.13
828 0.13
829 0.11
830 0.08
831 0.08
832 0.08
833 0.09
834 0.09
835 0.07
836 0.07
837 0.07
838 0.09
839 0.09
840 0.1
841 0.14
842 0.15
843 0.15
844 0.19
845 0.22
846 0.23
847 0.24
848 0.23
849 0.24
850 0.27
851 0.28
852 0.27
853 0.24
854 0.24
855 0.23
856 0.24
857 0.18
858 0.17
859 0.17
860 0.14
861 0.14
862 0.13
863 0.12
864 0.11
865 0.11
866 0.1
867 0.09
868 0.09
869 0.09
870 0.09
871 0.08
872 0.08
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.06
880 0.05
881 0.06
882 0.07
883 0.09
884 0.09
885 0.11
886 0.13
887 0.16
888 0.17
889 0.18
890 0.19
891 0.22
892 0.25
893 0.25
894 0.24
895 0.25
896 0.25
897 0.27
898 0.26
899 0.2
900 0.17
901 0.16
902 0.17
903 0.12
904 0.12
905 0.08
906 0.09
907 0.09
908 0.09
909 0.09
910 0.07
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.06
915 0.05
916 0.04
917 0.04
918 0.04
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.06
925 0.1
926 0.14
927 0.16
928 0.18
929 0.22
930 0.27
931 0.3
932 0.31
933 0.31
934 0.37
935 0.39
936 0.41
937 0.45
938 0.45
939 0.5
940 0.58
941 0.63
942 0.62
943 0.62
944 0.69
945 0.71
946 0.76
947 0.76
948 0.75
949 0.71
950 0.65
951 0.67
952 0.65
953 0.6
954 0.53
955 0.49
956 0.46
957 0.46
958 0.45
959 0.42
960 0.38
961 0.34
962 0.36
963 0.36
964 0.34
965 0.35
966 0.33
967 0.31
968 0.33
969 0.37
970 0.35
971 0.32
972 0.31
973 0.29
974 0.29
975 0.28