Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HPP7

Protein Details
Accession A0A139HPP7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1016-1036QDLFSLKSRTRRKLSLRFLAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, pero 6, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR030843  PAN2  
IPR028881  PAN2_UCH_dom  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR028889  USP_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004535  F:poly(A)-specific ribonuclease activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PF13423  UCH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
CDD cd06143  PAN2_exo  
Amino Acid Sequences MEADWNEVARLRLPGPAPNAPPSQLTTLAFDSLQELLWTGNEYGRITSFHGAELQRYTSYRGHVSTAPRGAPGNAHVQQLLFCEKGVVSVSARSIHLSSRRGLAQWHVAQPGMSDLQCMSFTSRDATELVVAGCQAHMYRIDVEKGTILEILTPQTPAMYKMMKLAGHFICAATADGAIHLLDSKTLALVHSWKAYAGSVNSMDARGDYLLTCGWAQMQYQGLSLERLVRVYDLKAQRPAPPVSFPIGAAFVRMHPKLTSTCIVVSQNGLIHSVDIQNPDMPTMRYVQSYEDKFLGVELMPSGKGLALQDSNDQVVLYGSPSKLHFTEYSTPTEFADPMDSHKSLDWSDHVPFNTIGMPYYREALLSSWPNSLLHQVGMPPPRIEMDGSFRPFEYGRVGLNSKTGRRYEAPDIKAQQKSADIMVGPKFLSEKPRDEGANGDAGRRMSEDLLNAMTKMKLEGKAATDTRLLYRVVEIKYSRFGVEDFDFRYFNKTNFAGLETHIVNSYANPLLQILRFTNTARNLALSHTARDCSSEDCLFCELGFLIDMLEKAQGLNCQATNFLKSLSRQPDAQAQNVLESTASKASLTTMVQNLNRYLLQKLEDNFKFAAPSHLNHFHYAFGTTGLDFTRCAHCSYESRNDRVWFTHDLVYPPRNAKHRGSSNMRTFFSQVLKASIERQNSHRGWCLRCNGYKAMTSHRAIHALPAVLMLNAAVTTPDAKQLWDTPGFLPREIGVIVNNGRFFCYEGQDLQLHLQRGQYSITVYQLVGVINDVKPEETENPHLVASIDVGLADSDPAQSGNWHLFNDFLVHKLPTDEALRFNSQWKLPSVITYQIKLMSHKIDNSWKHEMDTSILYDSPTQPALSPDYCFRALSDDDSLPNESSHVAIDAEFVRLLREEIDVGADGTRTMTRPARLGLARVSVLRGDGIDQELPFIDDYIAVDEPIDDYLTQYSGLRTGDLNPETTQFQLVSLKQTYKKLWILLNLGCKFIGHGLSSDFRTINIHVPESQVIDTQDLFSLKSRTRRKLSLRFLAWVILKADIQANSDMGHDSIEDARTALRLWRKYLEYDSAGVLEQMMDEIYNKGRSMDFKPPSDRKQPDTPTASAPGTPSRVAVRMATPARSDFGSPQKRMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.38
4 0.39
5 0.42
6 0.44
7 0.4
8 0.41
9 0.38
10 0.36
11 0.33
12 0.3
13 0.29
14 0.28
15 0.28
16 0.25
17 0.22
18 0.2
19 0.16
20 0.15
21 0.11
22 0.1
23 0.08
24 0.09
25 0.11
26 0.1
27 0.12
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.23
35 0.21
36 0.2
37 0.25
38 0.24
39 0.26
40 0.28
41 0.27
42 0.26
43 0.26
44 0.3
45 0.27
46 0.31
47 0.32
48 0.3
49 0.32
50 0.34
51 0.39
52 0.43
53 0.45
54 0.41
55 0.39
56 0.38
57 0.35
58 0.33
59 0.3
60 0.31
61 0.28
62 0.29
63 0.27
64 0.26
65 0.27
66 0.27
67 0.29
68 0.19
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.16
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.23
83 0.29
84 0.29
85 0.29
86 0.31
87 0.33
88 0.32
89 0.33
90 0.32
91 0.35
92 0.37
93 0.4
94 0.36
95 0.34
96 0.33
97 0.32
98 0.3
99 0.24
100 0.18
101 0.14
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.15
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.11
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.14
127 0.17
128 0.2
129 0.2
130 0.2
131 0.21
132 0.2
133 0.19
134 0.16
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.16
146 0.16
147 0.15
148 0.2
149 0.24
150 0.24
151 0.24
152 0.3
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.21
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.1
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.11
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.16
191 0.13
192 0.13
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.15
219 0.23
220 0.25
221 0.29
222 0.35
223 0.36
224 0.41
225 0.45
226 0.47
227 0.41
228 0.38
229 0.36
230 0.34
231 0.33
232 0.27
233 0.23
234 0.22
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.14
239 0.19
240 0.19
241 0.19
242 0.17
243 0.2
244 0.21
245 0.25
246 0.24
247 0.2
248 0.21
249 0.22
250 0.24
251 0.22
252 0.2
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.16
257 0.12
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.16
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.16
274 0.19
275 0.25
276 0.26
277 0.28
278 0.25
279 0.24
280 0.22
281 0.21
282 0.18
283 0.11
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.14
310 0.14
311 0.17
312 0.17
313 0.19
314 0.27
315 0.28
316 0.33
317 0.32
318 0.33
319 0.3
320 0.31
321 0.25
322 0.18
323 0.19
324 0.14
325 0.16
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.2
330 0.21
331 0.17
332 0.18
333 0.17
334 0.15
335 0.17
336 0.2
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.19
341 0.19
342 0.15
343 0.14
344 0.11
345 0.13
346 0.12
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.17
359 0.18
360 0.14
361 0.11
362 0.1
363 0.11
364 0.15
365 0.18
366 0.19
367 0.17
368 0.17
369 0.17
370 0.18
371 0.17
372 0.13
373 0.17
374 0.22
375 0.24
376 0.24
377 0.23
378 0.24
379 0.23
380 0.23
381 0.19
382 0.14
383 0.13
384 0.16
385 0.17
386 0.16
387 0.21
388 0.24
389 0.23
390 0.27
391 0.27
392 0.27
393 0.28
394 0.33
395 0.37
396 0.43
397 0.42
398 0.43
399 0.47
400 0.49
401 0.49
402 0.44
403 0.36
404 0.29
405 0.27
406 0.22
407 0.19
408 0.12
409 0.13
410 0.14
411 0.14
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.12
416 0.19
417 0.2
418 0.22
419 0.24
420 0.27
421 0.28
422 0.27
423 0.28
424 0.22
425 0.26
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.18
430 0.18
431 0.16
432 0.15
433 0.09
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.08
443 0.09
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.14
448 0.16
449 0.21
450 0.21
451 0.22
452 0.2
453 0.19
454 0.19
455 0.19
456 0.17
457 0.12
458 0.13
459 0.17
460 0.16
461 0.19
462 0.19
463 0.18
464 0.2
465 0.21
466 0.19
467 0.15
468 0.14
469 0.14
470 0.15
471 0.16
472 0.15
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.21
477 0.18
478 0.17
479 0.19
480 0.18
481 0.17
482 0.17
483 0.19
484 0.14
485 0.14
486 0.17
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.11
491 0.1
492 0.09
493 0.11
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.1
501 0.08
502 0.09
503 0.11
504 0.11
505 0.16
506 0.16
507 0.17
508 0.16
509 0.16
510 0.15
511 0.15
512 0.2
513 0.16
514 0.16
515 0.16
516 0.16
517 0.15
518 0.17
519 0.17
520 0.12
521 0.14
522 0.14
523 0.13
524 0.14
525 0.15
526 0.13
527 0.12
528 0.11
529 0.08
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.06
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.18
554 0.21
555 0.22
556 0.21
557 0.22
558 0.3
559 0.3
560 0.31
561 0.26
562 0.21
563 0.2
564 0.2
565 0.18
566 0.1
567 0.08
568 0.08
569 0.06
570 0.06
571 0.05
572 0.05
573 0.06
574 0.08
575 0.08
576 0.09
577 0.1
578 0.13
579 0.15
580 0.16
581 0.16
582 0.15
583 0.16
584 0.15
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.14
589 0.15
590 0.22
591 0.21
592 0.23
593 0.23
594 0.21
595 0.21
596 0.18
597 0.23
598 0.16
599 0.17
600 0.2
601 0.26
602 0.27
603 0.28
604 0.28
605 0.22
606 0.21
607 0.21
608 0.16
609 0.1
610 0.09
611 0.07
612 0.08
613 0.07
614 0.07
615 0.06
616 0.08
617 0.12
618 0.12
619 0.14
620 0.14
621 0.16
622 0.19
623 0.24
624 0.33
625 0.32
626 0.35
627 0.37
628 0.38
629 0.37
630 0.35
631 0.33
632 0.26
633 0.25
634 0.26
635 0.24
636 0.24
637 0.27
638 0.27
639 0.26
640 0.26
641 0.27
642 0.27
643 0.3
644 0.31
645 0.37
646 0.42
647 0.47
648 0.52
649 0.56
650 0.6
651 0.61
652 0.58
653 0.51
654 0.46
655 0.41
656 0.35
657 0.3
658 0.22
659 0.18
660 0.18
661 0.18
662 0.21
663 0.23
664 0.24
665 0.23
666 0.25
667 0.32
668 0.33
669 0.35
670 0.36
671 0.36
672 0.37
673 0.4
674 0.43
675 0.4
676 0.42
677 0.43
678 0.39
679 0.37
680 0.38
681 0.34
682 0.35
683 0.35
684 0.34
685 0.34
686 0.32
687 0.32
688 0.28
689 0.28
690 0.23
691 0.17
692 0.15
693 0.12
694 0.11
695 0.09
696 0.09
697 0.06
698 0.04
699 0.04
700 0.04
701 0.03
702 0.03
703 0.04
704 0.05
705 0.08
706 0.08
707 0.09
708 0.1
709 0.13
710 0.16
711 0.17
712 0.18
713 0.16
714 0.22
715 0.23
716 0.22
717 0.2
718 0.16
719 0.16
720 0.15
721 0.14
722 0.08
723 0.1
724 0.12
725 0.13
726 0.14
727 0.13
728 0.13
729 0.13
730 0.15
731 0.13
732 0.14
733 0.14
734 0.13
735 0.16
736 0.16
737 0.17
738 0.18
739 0.2
740 0.18
741 0.17
742 0.19
743 0.16
744 0.16
745 0.17
746 0.14
747 0.13
748 0.12
749 0.13
750 0.12
751 0.11
752 0.11
753 0.11
754 0.1
755 0.08
756 0.08
757 0.09
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.08
762 0.08
763 0.1
764 0.13
765 0.14
766 0.19
767 0.19
768 0.21
769 0.2
770 0.2
771 0.18
772 0.15
773 0.12
774 0.08
775 0.07
776 0.05
777 0.05
778 0.05
779 0.05
780 0.05
781 0.04
782 0.04
783 0.04
784 0.05
785 0.05
786 0.05
787 0.07
788 0.11
789 0.12
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.12
794 0.16
795 0.14
796 0.12
797 0.12
798 0.12
799 0.12
800 0.13
801 0.13
802 0.12
803 0.15
804 0.15
805 0.16
806 0.2
807 0.22
808 0.22
809 0.25
810 0.27
811 0.26
812 0.28
813 0.27
814 0.27
815 0.24
816 0.27
817 0.26
818 0.3
819 0.3
820 0.28
821 0.27
822 0.27
823 0.27
824 0.26
825 0.26
826 0.23
827 0.24
828 0.25
829 0.28
830 0.33
831 0.36
832 0.41
833 0.45
834 0.41
835 0.4
836 0.4
837 0.36
838 0.3
839 0.28
840 0.22
841 0.17
842 0.16
843 0.15
844 0.15
845 0.16
846 0.15
847 0.14
848 0.13
849 0.12
850 0.13
851 0.18
852 0.17
853 0.18
854 0.18
855 0.22
856 0.23
857 0.22
858 0.2
859 0.2
860 0.2
861 0.21
862 0.23
863 0.19
864 0.19
865 0.21
866 0.23
867 0.19
868 0.18
869 0.16
870 0.12
871 0.11
872 0.11
873 0.09
874 0.08
875 0.07
876 0.09
877 0.09
878 0.1
879 0.1
880 0.09
881 0.09
882 0.09
883 0.1
884 0.08
885 0.08
886 0.08
887 0.08
888 0.09
889 0.09
890 0.09
891 0.09
892 0.08
893 0.07
894 0.08
895 0.09
896 0.08
897 0.12
898 0.16
899 0.17
900 0.19
901 0.21
902 0.26
903 0.26
904 0.28
905 0.27
906 0.26
907 0.26
908 0.24
909 0.24
910 0.17
911 0.17
912 0.15
913 0.12
914 0.1
915 0.1
916 0.12
917 0.12
918 0.12
919 0.12
920 0.12
921 0.13
922 0.12
923 0.11
924 0.08
925 0.07
926 0.08
927 0.1
928 0.1
929 0.09
930 0.09
931 0.08
932 0.08
933 0.09
934 0.09
935 0.06
936 0.07
937 0.08
938 0.08
939 0.09
940 0.09
941 0.09
942 0.11
943 0.11
944 0.11
945 0.11
946 0.14
947 0.21
948 0.22
949 0.24
950 0.22
951 0.24
952 0.24
953 0.24
954 0.22
955 0.14
956 0.15
957 0.17
958 0.18
959 0.22
960 0.24
961 0.3
962 0.33
963 0.38
964 0.39
965 0.41
966 0.44
967 0.43
968 0.43
969 0.42
970 0.43
971 0.42
972 0.49
973 0.43
974 0.4
975 0.36
976 0.32
977 0.27
978 0.24
979 0.22
980 0.13
981 0.13
982 0.16
983 0.19
984 0.21
985 0.22
986 0.2
987 0.18
988 0.2
989 0.21
990 0.25
991 0.24
992 0.25
993 0.23
994 0.26
995 0.27
996 0.27
997 0.26
998 0.21
999 0.19
1000 0.18
1001 0.18
1002 0.16
1003 0.17
1004 0.15
1005 0.15
1006 0.16
1007 0.21
1008 0.23
1009 0.33
1010 0.41
1011 0.48
1012 0.55
1013 0.63
1014 0.7
1015 0.76
1016 0.81
1017 0.81
1018 0.76
1019 0.71
1020 0.64
1021 0.6
1022 0.51
1023 0.44
1024 0.35
1025 0.27
1026 0.23
1027 0.2
1028 0.23
1029 0.19
1030 0.2
1031 0.17
1032 0.17
1033 0.15
1034 0.16
1035 0.16
1036 0.12
1037 0.11
1038 0.09
1039 0.1
1040 0.12
1041 0.12
1042 0.12
1043 0.11
1044 0.12
1045 0.12
1046 0.13
1047 0.17
1048 0.23
1049 0.26
1050 0.3
1051 0.36
1052 0.38
1053 0.42
1054 0.47
1055 0.47
1056 0.42
1057 0.4
1058 0.37
1059 0.31
1060 0.29
1061 0.24
1062 0.19
1063 0.12
1064 0.09
1065 0.07
1066 0.06
1067 0.05
1068 0.06
1069 0.08
1070 0.12
1071 0.15
1072 0.15
1073 0.16
1074 0.19
1075 0.23
1076 0.28
1077 0.36
1078 0.39
1079 0.44
1080 0.54
1081 0.61
1082 0.67
1083 0.73
1084 0.73
1085 0.69
1086 0.73
1087 0.73
1088 0.73
1089 0.7
1090 0.65
1091 0.59
1092 0.59
1093 0.53
1094 0.44
1095 0.4
1096 0.36
1097 0.34
1098 0.31
1099 0.28
1100 0.26
1101 0.28
1102 0.28
1103 0.28
1104 0.24
1105 0.3
1106 0.33
1107 0.34
1108 0.33
1109 0.32
1110 0.32
1111 0.31
1112 0.31
1113 0.29
1114 0.36
1115 0.42