FuNGI

A0A139HPV6

Protein Details

Accession

A0A139HPV6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MSQARRKKPSCSHDNCGSRRF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 12, nucl 6.5, cyto_nucl 5.5, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033599 TAF1B/Rrn7 IPR021752 TF_Rrn7_Zf
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF11781 zf-RRN7

Amino Acid Sequences

MSQARRKKPSCSHDNCGSRRFHVGDDGFTYCEQGHQQSEAGLLISADTGELVITGRTTRVKVESDAESTTTKITGFSGPKAFEHYLLCVQLVLRKQLRWLIDVQKLPEELEGLVKDLWALRLQKLQNKVSYDSDAETDAQSSRIFSSQSEGDSGTDNEATTMRRNQTRQKVPGPNMLELLSLVHIGIMLLKIPITVADMVTWCNEGGLLFYRAVKEVPMSMRDRLPGHYQDVLEQQSLIEPEKLHRKVLELLTNLNSDFGMEAPTLNEPLVLYRWVKQLALPLEIYVTTQRLARLLEINFAYNVVAKARANMSMRFPEIRLMALIVIATKLLFPFDDKKRYPKNTEDLAAMRLDWDIWCKVLAQQHDHDKRKGQARGGPDQLSFRDAFSMNEADSLSLADERLDQYLDWYESNIASEEVRERGRAGREADFRRTLFEMFPTTVNNQKSTQRAQTEISKAGKTSAEKIVQAQAALRARRIVPETEPDDIPRVGTSYTQYKAVEDLSGATREFYQGAAQLAGFSLHGIVRAVCMMEHKLFKLERAWTKNAHED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.81
3	0.78
4	0.71
5	0.63
6	0.62
7	0.56
8	0.47
9	0.46
10	0.42
11	0.39
12	0.39
13	0.38
14	0.32
15	0.3
16	0.29
17	0.2
18	0.21
19	0.19
20	0.19
21	0.19
22	0.19
23	0.2
24	0.19
25	0.2
26	0.18
27	0.16
28	0.12
29	0.09
30	0.08
31	0.07
32	0.06
33	0.05
34	0.04
35	0.04
36	0.03
37	0.04
38	0.04
39	0.04
40	0.05
41	0.06
42	0.09
43	0.11
44	0.13
45	0.16
46	0.19
47	0.22
48	0.24
49	0.28
50	0.3
51	0.3
52	0.31
53	0.3
54	0.27
55	0.25
56	0.23
57	0.19
58	0.15
59	0.12
60	0.12
61	0.17
62	0.19
63	0.23
64	0.28
65	0.29
66	0.29
67	0.35
68	0.34
69	0.3
70	0.29
71	0.28
72	0.26
73	0.25
74	0.25
75	0.19
76	0.18
77	0.2
78	0.21
79	0.25
80	0.25
81	0.25
82	0.27
83	0.32
84	0.33
85	0.31
86	0.34
87	0.34
88	0.38
89	0.41
90	0.4
91	0.39
92	0.37
93	0.35
94	0.3
95	0.23
96	0.16
97	0.17
98	0.15
99	0.13
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.11
104	0.12
105	0.13
106	0.15
107	0.15
108	0.23
109	0.26
110	0.32
111	0.38
112	0.42
113	0.43
114	0.44
115	0.46
116	0.42
117	0.41
118	0.37
119	0.31
120	0.27
121	0.23
122	0.2
123	0.17
124	0.15
125	0.12
126	0.12
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.1
133	0.14
134	0.14
135	0.15
136	0.16
137	0.15
138	0.14
139	0.16
140	0.16
141	0.14
142	0.12
143	0.11
144	0.1
145	0.11
146	0.12
147	0.13
148	0.18
149	0.21
150	0.27
151	0.31
152	0.4
153	0.49
154	0.57
155	0.61
156	0.65
157	0.69
158	0.67
159	0.71
160	0.66
161	0.57
162	0.49
163	0.42
164	0.32
165	0.23
166	0.2
167	0.12
168	0.08
169	0.07
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.08
188	0.08
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.06
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.1
202	0.08
203	0.1
204	0.12
205	0.15
206	0.17
207	0.19
208	0.2
209	0.22
210	0.23
211	0.23
212	0.26
213	0.23
214	0.24
215	0.25
216	0.24
217	0.23
218	0.25
219	0.24
220	0.19
221	0.17
222	0.14
223	0.12
224	0.13
225	0.12
226	0.09
227	0.08
228	0.11
229	0.2
230	0.21
231	0.21
232	0.21
233	0.22
234	0.26
235	0.29
236	0.32
237	0.23
238	0.24
239	0.25
240	0.26
241	0.23
242	0.18
243	0.14
244	0.09
245	0.08
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.04
256	0.05
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.09
261	0.12
262	0.12
263	0.13
264	0.13
265	0.17
266	0.17
267	0.18
268	0.16
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.08
274	0.07
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.09
281	0.13
282	0.12
283	0.15
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.13
288	0.12
289	0.09
290	0.09
291	0.06
292	0.08
293	0.07
294	0.09
295	0.09
296	0.14
297	0.15
298	0.16
299	0.19
300	0.2
301	0.21
302	0.21
303	0.2
304	0.19
305	0.17
306	0.16
307	0.13
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.07
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.04
320	0.06
321	0.13
322	0.19
323	0.28
324	0.29
325	0.38
326	0.47
327	0.54
328	0.57
329	0.57
330	0.59
331	0.55
332	0.55
333	0.5
334	0.42
335	0.37
336	0.31
337	0.24
338	0.17
339	0.12
340	0.11
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.11
348	0.15
349	0.18
350	0.2
351	0.24
352	0.34
353	0.44
354	0.48
355	0.48
356	0.49
357	0.52
358	0.56
359	0.55
360	0.5
361	0.45
362	0.46
363	0.51
364	0.51
365	0.47
366	0.4
367	0.38
368	0.34
369	0.32
370	0.27
371	0.19
372	0.17
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.16
377	0.13
378	0.14
379	0.14
380	0.11
381	0.1
382	0.1
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.05
387	0.07
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.13
394	0.14
395	0.12
396	0.13
397	0.13
398	0.12
399	0.13
400	0.12
401	0.09
402	0.08
403	0.09
404	0.11
405	0.13
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.19
410	0.23
411	0.26
412	0.28
413	0.32
414	0.4
415	0.44
416	0.49
417	0.49
418	0.46
419	0.44
420	0.42
421	0.36
422	0.29
423	0.27
424	0.24
425	0.21
426	0.22
427	0.21
428	0.22
429	0.27
430	0.28
431	0.28
432	0.27
433	0.31
434	0.36
435	0.39
436	0.44
437	0.41
438	0.42
439	0.43
440	0.48
441	0.48
442	0.49
443	0.47
444	0.41
445	0.37
446	0.37
447	0.37
448	0.31
449	0.31
450	0.32
451	0.31
452	0.31
453	0.33
454	0.36
455	0.33
456	0.31
457	0.27
458	0.26
459	0.3
460	0.3
461	0.29
462	0.27
463	0.27
464	0.31
465	0.33
466	0.29
467	0.26
468	0.33
469	0.35
470	0.36
471	0.36
472	0.33
473	0.34
474	0.31
475	0.28
476	0.2
477	0.18
478	0.15
479	0.16
480	0.18
481	0.21
482	0.22
483	0.26
484	0.25
485	0.25
486	0.26
487	0.26
488	0.22
489	0.16
490	0.17
491	0.16
492	0.18
493	0.17
494	0.16
495	0.15
496	0.16
497	0.16
498	0.13
499	0.12
500	0.12
501	0.14
502	0.14
503	0.13
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.1
508	0.08
509	0.08
510	0.07
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.1
516	0.1
517	0.09
518	0.12
519	0.15
520	0.2
521	0.23
522	0.23
523	0.29
524	0.3
525	0.32
526	0.35
527	0.4
528	0.45
529	0.49
530	0.53
531	0.52

A0A139HPV6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer