Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HHB7

Protein Details
Accession A0A139HHB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-40NAASKLAITKNKKKASRHKKCSFQKCHQTLNTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-26KNKKKASRHK
Subcellular Location(s) cyto 9, nucl 8, mito 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF00646  F-box  
Amino Acid Sequences MDLSELSNAASKLAITKNKKKASRHKKCSFQKCHQTLNTTELLEAILVQLPIKDLLFAQLVCSTWKNCIEASPRLQQGLFFQLPEGDPTTDLASILLSAPWALLEDDGDTKDIRNTIVNPLLTKVFEKDELAFCHFLNWSSPTATDFQPPQPDTLEMHPSIQRPEASWRRMHLCYPKVIKINIHRDSEPFFGQLFWEHMHAMPDLIPPRQWMTEFWITSLGSGFTIPEKFTRDRGVKMIRFMLPTMRGAMGELIGLMHACENTAESESFMVTSQGEEVKDEDAWEDEEDDEEGCGPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.46
4 0.56
5 0.65
6 0.72
7 0.77
8 0.82
9 0.84
10 0.87
11 0.88
12 0.87
13 0.89
14 0.92
15 0.94
16 0.92
17 0.92
18 0.91
19 0.87
20 0.87
21 0.81
22 0.76
23 0.67
24 0.63
25 0.56
26 0.45
27 0.38
28 0.28
29 0.23
30 0.17
31 0.14
32 0.1
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.06
42 0.09
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.12
47 0.13
48 0.15
49 0.17
50 0.15
51 0.17
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.23
56 0.26
57 0.31
58 0.35
59 0.38
60 0.37
61 0.37
62 0.37
63 0.32
64 0.29
65 0.3
66 0.25
67 0.18
68 0.17
69 0.17
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.13
77 0.11
78 0.11
79 0.09
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.14
104 0.18
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.19
109 0.17
110 0.17
111 0.14
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.19
119 0.18
120 0.17
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.2
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.21
143 0.15
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.19
149 0.16
150 0.14
151 0.23
152 0.28
153 0.29
154 0.3
155 0.31
156 0.34
157 0.35
158 0.38
159 0.37
160 0.33
161 0.37
162 0.39
163 0.42
164 0.4
165 0.4
166 0.41
167 0.42
168 0.49
169 0.48
170 0.47
171 0.42
172 0.4
173 0.43
174 0.41
175 0.33
176 0.24
177 0.18
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.14
199 0.2
200 0.27
201 0.26
202 0.26
203 0.26
204 0.25
205 0.24
206 0.24
207 0.16
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.17
216 0.18
217 0.21
218 0.29
219 0.3
220 0.32
221 0.39
222 0.47
223 0.44
224 0.47
225 0.49
226 0.44
227 0.42
228 0.4
229 0.37
230 0.3
231 0.28
232 0.27
233 0.22
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.12
277 0.11