Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HNS1

Protein Details
Accession A0A139HNS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-206RGPPKGRKSRELHVNRKDTRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
484-491RSGRGGRR
791-794PRRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSTNAWPTSASEPGAGPVQPVDSDAPNSSTHQQASNTEGRESIREGKKAARDTVNATTTDSPGFAQQNGSNGPPQTNGAPQLSRKRSRDGTQLPVSQNSGNGDEPSHDDILLHRYIQRDLLHGAAMNDQSERSRDLLLAKEREKEFYVTEVVQRRRTDPGSIYGYGFAGYGNGTTNAKSQIVYSTNRGPPKGRKSRELHVNRKDTRQQAEQHEELVPIRLDIELDKLRLRDTFTWNLHEKCISQDLFTDYLLEDLKVPPENLQEVSRQVKAEFQDQLQNFYPHIIVEDGALDPGRPYHDHKDDEMRIQIKLNITIGRITLVDQFEWDINNPLNSPEEFARQMASENALSGEFTTAIAHSIREQSQLYTKALYLTNHPFDGRIIEDPEVRDGFLPAPIHSAFRPPQTQKDFTPYMYEMSEAELERTETSMMREHRAQKRQLNRRGGPAIPDLREKPRTVRSLLVHSVLPGAVETFETTGILKTRRSGRGGRRGGRVTDGDIDSDDLDSEESGAESPAPAALPTAGTARTRGMRGAAAAAQINMRAGYGRSQTPDSQILSAPVPEPRSSARPSRLREEADADEETLIVKLHISRAKYKKWWDDFQTKKRAKEFPLSGYASGPAHLAPGTPGRGATSTPSMTPRSLPPRGTPQPNGSHSRAHSSVRQQSNVTYDSKGAVTVDRWPAPESEPPPPPWLDSALAQLKEAHPDGDFTPLMRSYVINVETGEITKGSFAVGDPVPEGRKFQWLPRIKCNDCPGKLYTAIPDKVIDHFGVHLKNRNHIAAVEDRLAGRPRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.16
4 0.14
5 0.15
6 0.13
7 0.15
8 0.16
9 0.15
10 0.18
11 0.19
12 0.21
13 0.21
14 0.25
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.28
19 0.3
20 0.3
21 0.35
22 0.38
23 0.37
24 0.33
25 0.34
26 0.31
27 0.31
28 0.33
29 0.36
30 0.36
31 0.37
32 0.39
33 0.44
34 0.5
35 0.53
36 0.55
37 0.52
38 0.48
39 0.51
40 0.57
41 0.53
42 0.45
43 0.43
44 0.38
45 0.33
46 0.31
47 0.26
48 0.18
49 0.2
50 0.21
51 0.18
52 0.2
53 0.2
54 0.25
55 0.26
56 0.28
57 0.27
58 0.26
59 0.27
60 0.24
61 0.25
62 0.22
63 0.24
64 0.26
65 0.26
66 0.29
67 0.34
68 0.43
69 0.51
70 0.57
71 0.57
72 0.61
73 0.64
74 0.65
75 0.7
76 0.66
77 0.66
78 0.65
79 0.69
80 0.63
81 0.59
82 0.56
83 0.46
84 0.41
85 0.35
86 0.29
87 0.24
88 0.22
89 0.19
90 0.18
91 0.21
92 0.23
93 0.21
94 0.18
95 0.17
96 0.17
97 0.22
98 0.21
99 0.18
100 0.16
101 0.18
102 0.19
103 0.24
104 0.23
105 0.21
106 0.21
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.19
111 0.18
112 0.18
113 0.15
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.14
120 0.14
121 0.15
122 0.17
123 0.24
124 0.31
125 0.36
126 0.37
127 0.43
128 0.43
129 0.45
130 0.44
131 0.39
132 0.32
133 0.27
134 0.28
135 0.22
136 0.28
137 0.33
138 0.36
139 0.4
140 0.41
141 0.4
142 0.43
143 0.44
144 0.42
145 0.36
146 0.39
147 0.38
148 0.38
149 0.36
150 0.3
151 0.28
152 0.24
153 0.21
154 0.13
155 0.08
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.11
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.17
168 0.21
169 0.23
170 0.25
171 0.31
172 0.36
173 0.39
174 0.41
175 0.41
176 0.46
177 0.55
178 0.61
179 0.58
180 0.61
181 0.64
182 0.71
183 0.76
184 0.77
185 0.77
186 0.76
187 0.81
188 0.75
189 0.77
190 0.76
191 0.71
192 0.66
193 0.63
194 0.6
195 0.58
196 0.62
197 0.54
198 0.49
199 0.44
200 0.39
201 0.33
202 0.28
203 0.2
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.16
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.22
217 0.22
218 0.26
219 0.33
220 0.34
221 0.39
222 0.44
223 0.44
224 0.41
225 0.37
226 0.31
227 0.26
228 0.3
229 0.24
230 0.19
231 0.2
232 0.22
233 0.22
234 0.21
235 0.19
236 0.13
237 0.14
238 0.13
239 0.11
240 0.09
241 0.08
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.19
252 0.22
253 0.22
254 0.21
255 0.19
256 0.22
257 0.22
258 0.24
259 0.22
260 0.2
261 0.26
262 0.25
263 0.3
264 0.29
265 0.28
266 0.24
267 0.23
268 0.22
269 0.14
270 0.15
271 0.1
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.08
283 0.13
284 0.2
285 0.26
286 0.29
287 0.31
288 0.39
289 0.39
290 0.4
291 0.4
292 0.34
293 0.29
294 0.28
295 0.28
296 0.21
297 0.2
298 0.19
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.1
321 0.12
322 0.1
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.04
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.09
347 0.09
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.16
352 0.19
353 0.18
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.2
361 0.21
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.16
366 0.17
367 0.14
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.14
374 0.13
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.08
382 0.11
383 0.11
384 0.12
385 0.11
386 0.15
387 0.14
388 0.17
389 0.22
390 0.21
391 0.29
392 0.34
393 0.37
394 0.34
395 0.39
396 0.37
397 0.32
398 0.34
399 0.27
400 0.22
401 0.2
402 0.19
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.06
414 0.08
415 0.12
416 0.14
417 0.16
418 0.2
419 0.28
420 0.36
421 0.43
422 0.48
423 0.49
424 0.58
425 0.66
426 0.7
427 0.72
428 0.65
429 0.65
430 0.62
431 0.56
432 0.49
433 0.45
434 0.4
435 0.32
436 0.33
437 0.29
438 0.3
439 0.33
440 0.31
441 0.3
442 0.33
443 0.35
444 0.34
445 0.37
446 0.34
447 0.37
448 0.38
449 0.35
450 0.27
451 0.24
452 0.23
453 0.17
454 0.14
455 0.08
456 0.06
457 0.04
458 0.05
459 0.05
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.08
466 0.1
467 0.1
468 0.14
469 0.21
470 0.25
471 0.29
472 0.36
473 0.43
474 0.52
475 0.6
476 0.62
477 0.61
478 0.6
479 0.57
480 0.53
481 0.45
482 0.36
483 0.32
484 0.27
485 0.2
486 0.17
487 0.17
488 0.13
489 0.12
490 0.1
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.09
513 0.11
514 0.13
515 0.14
516 0.14
517 0.14
518 0.13
519 0.13
520 0.14
521 0.13
522 0.12
523 0.11
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.09
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.09
533 0.12
534 0.13
535 0.16
536 0.19
537 0.2
538 0.23
539 0.26
540 0.24
541 0.23
542 0.21
543 0.21
544 0.18
545 0.18
546 0.15
547 0.14
548 0.15
549 0.14
550 0.16
551 0.17
552 0.21
553 0.24
554 0.3
555 0.36
556 0.42
557 0.46
558 0.5
559 0.53
560 0.51
561 0.5
562 0.48
563 0.41
564 0.37
565 0.34
566 0.28
567 0.22
568 0.19
569 0.17
570 0.12
571 0.09
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.12
576 0.15
577 0.17
578 0.27
579 0.34
580 0.41
581 0.48
582 0.55
583 0.6
584 0.64
585 0.69
586 0.68
587 0.72
588 0.74
589 0.77
590 0.8
591 0.75
592 0.73
593 0.73
594 0.71
595 0.65
596 0.65
597 0.6
598 0.55
599 0.58
600 0.54
601 0.48
602 0.42
603 0.39
604 0.3
605 0.25
606 0.19
607 0.11
608 0.09
609 0.09
610 0.08
611 0.08
612 0.11
613 0.13
614 0.13
615 0.13
616 0.13
617 0.14
618 0.15
619 0.16
620 0.18
621 0.17
622 0.19
623 0.23
624 0.24
625 0.24
626 0.26
627 0.3
628 0.33
629 0.38
630 0.39
631 0.4
632 0.47
633 0.54
634 0.59
635 0.57
636 0.56
637 0.59
638 0.62
639 0.64
640 0.57
641 0.55
642 0.5
643 0.52
644 0.47
645 0.42
646 0.42
647 0.45
648 0.52
649 0.51
650 0.53
651 0.47
652 0.46
653 0.48
654 0.44
655 0.38
656 0.29
657 0.24
658 0.23
659 0.22
660 0.2
661 0.15
662 0.14
663 0.13
664 0.19
665 0.24
666 0.25
667 0.26
668 0.27
669 0.27
670 0.29
671 0.35
672 0.33
673 0.34
674 0.37
675 0.38
676 0.41
677 0.4
678 0.39
679 0.33
680 0.32
681 0.27
682 0.23
683 0.28
684 0.31
685 0.3
686 0.29
687 0.29
688 0.27
689 0.3
690 0.29
691 0.22
692 0.16
693 0.18
694 0.18
695 0.21
696 0.2
697 0.16
698 0.19
699 0.19
700 0.19
701 0.18
702 0.17
703 0.14
704 0.21
705 0.21
706 0.18
707 0.18
708 0.19
709 0.19
710 0.2
711 0.18
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.09
716 0.08
717 0.07
718 0.07
719 0.11
720 0.11
721 0.12
722 0.13
723 0.17
724 0.2
725 0.2
726 0.23
727 0.19
728 0.28
729 0.29
730 0.35
731 0.42
732 0.49
733 0.55
734 0.62
735 0.71
736 0.65
737 0.71
738 0.74
739 0.74
740 0.66
741 0.65
742 0.57
743 0.52
744 0.52
745 0.46
746 0.44
747 0.43
748 0.41
749 0.38
750 0.36
751 0.32
752 0.33
753 0.34
754 0.26
755 0.18
756 0.2
757 0.24
758 0.29
759 0.31
760 0.37
761 0.37
762 0.43
763 0.47
764 0.46
765 0.43
766 0.37
767 0.38
768 0.36
769 0.38
770 0.34
771 0.3
772 0.29
773 0.32
774 0.37