Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HST5

Protein Details
Accession A0A139HST5    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
439-464RQAEKERLKKREARKRKAENTANETPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-246RKRELAARK
439-455RQAEKERLKKREARKRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAYQMSPPAQQPLKPPPQPYAPYQGAGSPGAQSPFPQPPAKRPRLSPDPRSPVGGSPMYAQSPMQYSNPYGPQSASPMPYSPQSYAGSPQNSFNTPQPYSPPVQWSAPQQQPQQRPPQISPPPPPSTNSMPPPPRPNKEDKDERMGVEDIGDSLFGSGINLKDEENYLHSTWNNRHSQNESFHTTQTTSFGSSTMSPNNSFNLLTQGTSFGSAGQDGAFAGTMGQPRSQEEIENEQKRKRELAARKRAERDQFHLNNQFLQTNCLRHRMHQRAAQESVRLNVEGVYVRNPEPDRVQTMVNANGSEGIVAAKPEAMIEQGSVYEHILTLVSLASAERLRGLVDEAYGLARARRYGDHGRVVPPDFADIATGEGQQSQETVIPDSVTGSQWDKRQENGTDTVNGTSHINGETSTPTPQPQPTISFQGTLNQRLRDLAERERQAEKERLKKREARKRKAENTANETPAATPVEEKFAEPLATAAPVKVSKKEQSKKAKEALASTEAQAFNQSNQTAAMMALGGKKNRYSWMSGGAANMPTNRFAKPSSGTATPKAAEPAKAPVDAVKKDEEKKKLPTWGDWREDDVHGKGIQLRDWILVLERDGREKKALQKAVNKLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.54
4 0.61
5 0.62
6 0.59
7 0.58
8 0.51
9 0.47
10 0.45
11 0.41
12 0.34
13 0.32
14 0.27
15 0.2
16 0.19
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.21
21 0.26
22 0.31
23 0.36
24 0.36
25 0.45
26 0.56
27 0.64
28 0.65
29 0.63
30 0.68
31 0.72
32 0.78
33 0.78
34 0.78
35 0.77
36 0.73
37 0.72
38 0.64
39 0.57
40 0.54
41 0.46
42 0.35
43 0.3
44 0.32
45 0.28
46 0.26
47 0.23
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.2
54 0.25
55 0.31
56 0.3
57 0.28
58 0.27
59 0.27
60 0.31
61 0.33
62 0.29
63 0.26
64 0.25
65 0.26
66 0.29
67 0.31
68 0.26
69 0.27
70 0.26
71 0.26
72 0.29
73 0.34
74 0.34
75 0.32
76 0.35
77 0.34
78 0.34
79 0.35
80 0.36
81 0.36
82 0.33
83 0.34
84 0.35
85 0.35
86 0.37
87 0.37
88 0.37
89 0.33
90 0.34
91 0.35
92 0.38
93 0.42
94 0.45
95 0.49
96 0.51
97 0.56
98 0.63
99 0.67
100 0.7
101 0.67
102 0.66
103 0.63
104 0.66
105 0.66
106 0.65
107 0.65
108 0.63
109 0.64
110 0.6
111 0.58
112 0.54
113 0.52
114 0.52
115 0.5
116 0.51
117 0.51
118 0.55
119 0.63
120 0.66
121 0.65
122 0.64
123 0.68
124 0.66
125 0.69
126 0.74
127 0.68
128 0.69
129 0.65
130 0.6
131 0.54
132 0.47
133 0.38
134 0.28
135 0.23
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.13
153 0.16
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.22
158 0.26
159 0.33
160 0.37
161 0.34
162 0.38
163 0.4
164 0.45
165 0.46
166 0.47
167 0.44
168 0.4
169 0.39
170 0.37
171 0.34
172 0.28
173 0.24
174 0.2
175 0.16
176 0.14
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.17
182 0.18
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.2
187 0.18
188 0.16
189 0.17
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.24
219 0.32
220 0.39
221 0.4
222 0.4
223 0.42
224 0.43
225 0.42
226 0.37
227 0.38
228 0.41
229 0.49
230 0.57
231 0.62
232 0.67
233 0.7
234 0.72
235 0.7
236 0.63
237 0.56
238 0.56
239 0.51
240 0.51
241 0.52
242 0.47
243 0.41
244 0.38
245 0.36
246 0.26
247 0.26
248 0.22
249 0.22
250 0.23
251 0.29
252 0.28
253 0.31
254 0.41
255 0.45
256 0.48
257 0.47
258 0.49
259 0.46
260 0.5
261 0.46
262 0.38
263 0.31
264 0.27
265 0.23
266 0.2
267 0.15
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.18
283 0.16
284 0.18
285 0.2
286 0.18
287 0.16
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.08
339 0.14
340 0.21
341 0.25
342 0.3
343 0.32
344 0.34
345 0.35
346 0.36
347 0.31
348 0.25
349 0.21
350 0.15
351 0.13
352 0.11
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.06
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.08
372 0.09
373 0.11
374 0.14
375 0.17
376 0.24
377 0.23
378 0.25
379 0.3
380 0.3
381 0.32
382 0.32
383 0.31
384 0.27
385 0.27
386 0.25
387 0.2
388 0.19
389 0.15
390 0.12
391 0.11
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.08
396 0.1
397 0.11
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.16
402 0.17
403 0.19
404 0.19
405 0.23
406 0.23
407 0.29
408 0.28
409 0.27
410 0.26
411 0.3
412 0.31
413 0.33
414 0.34
415 0.29
416 0.28
417 0.28
418 0.3
419 0.29
420 0.3
421 0.31
422 0.35
423 0.36
424 0.4
425 0.42
426 0.42
427 0.41
428 0.45
429 0.45
430 0.47
431 0.53
432 0.55
433 0.59
434 0.65
435 0.71
436 0.74
437 0.78
438 0.79
439 0.81
440 0.86
441 0.88
442 0.9
443 0.88
444 0.85
445 0.83
446 0.79
447 0.7
448 0.6
449 0.51
450 0.41
451 0.34
452 0.27
453 0.19
454 0.13
455 0.12
456 0.16
457 0.16
458 0.16
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.13
463 0.13
464 0.09
465 0.11
466 0.11
467 0.09
468 0.1
469 0.14
470 0.16
471 0.2
472 0.24
473 0.3
474 0.4
475 0.49
476 0.56
477 0.63
478 0.71
479 0.75
480 0.77
481 0.74
482 0.66
483 0.62
484 0.58
485 0.51
486 0.43
487 0.36
488 0.35
489 0.3
490 0.27
491 0.27
492 0.22
493 0.19
494 0.22
495 0.21
496 0.16
497 0.16
498 0.16
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.06
503 0.07
504 0.12
505 0.15
506 0.17
507 0.18
508 0.2
509 0.22
510 0.27
511 0.29
512 0.29
513 0.28
514 0.33
515 0.34
516 0.34
517 0.33
518 0.31
519 0.3
520 0.27
521 0.26
522 0.2
523 0.21
524 0.22
525 0.21
526 0.2
527 0.2
528 0.23
529 0.25
530 0.29
531 0.3
532 0.35
533 0.38
534 0.39
535 0.43
536 0.38
537 0.36
538 0.36
539 0.34
540 0.3
541 0.28
542 0.32
543 0.3
544 0.3
545 0.29
546 0.29
547 0.34
548 0.34
549 0.35
550 0.34
551 0.38
552 0.45
553 0.53
554 0.56
555 0.55
556 0.61
557 0.65
558 0.67
559 0.65
560 0.66
561 0.68
562 0.69
563 0.69
564 0.63
565 0.61
566 0.56
567 0.55
568 0.5
569 0.42
570 0.37
571 0.3
572 0.3
573 0.3
574 0.28
575 0.27
576 0.26
577 0.25
578 0.22
579 0.22
580 0.21
581 0.19
582 0.19
583 0.18
584 0.23
585 0.23
586 0.3
587 0.32
588 0.35
589 0.37
590 0.41
591 0.48
592 0.51
593 0.58
594 0.57
595 0.64