Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HZ25

Protein Details
Accession A0A139HZ25    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-79HIPAVPPSKRRMRFDRKTATPERPKKRVQEEVIHydrophilic
204-228EPSWMSEKRKKLKNMHTRSKQTNTKHydrophilic
368-388LTYKWQRRFCRWHQQQKAEAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-73SKRRMRFDRKTATPERPKKR
212-217RKKLKN
Subcellular Location(s) mito 15.5, mito_nucl 13.166, cyto_mito 9.833, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MSKSTSLRVRLATRPLLSVVNGHAHASSDDHEDGIAIQREDHKASNHIPAVPPSKRRMRFDRKTATPERPKKRVQEEVIELDASPVKQKGGKTAAEKPYPSPEHTESTRSSQNEVIMLDEEEDYNASPKASSSDIEEEKSVKAAPSEVKGTSGFQMKNVSLAKHVVQQREEPKRTFVDPRMNGALLGKRKVMNDTELDDDSDDEPSWMSEKRKKLKNMHTRSKQTNTKPKPNIFISKPSSQHSRYGKEAAMKQKIAQKQFQKSEAAALKQKAKSPPTKKFKTVEAFGYGSTASSQANSAVQMSQTSAGAELEGPEIDDSPLTEISEDEIDETETLEGVATAKCGHCGEALKRSLLEDFQDEFLRGRELTYKWQRRFCRWHQQQKAEAQWRERGYPEIDWKQLSLRMRAHDSILKDIVNDKVGSYYRDELRSKSKKSRKDIEDVITGNDSRGGASMGYYGPKGEKLMHVTSILTLTEHIIGRFTNDIRQRSKKDKLVSTSGVQGGVSGFVQVVLAPHLVELLVKEDMNLGGNDWEIRAREIIAESTQLGELLHPEEEDDKVDDIDTARVMALVDDDDDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.41
4 0.36
5 0.32
6 0.27
7 0.26
8 0.25
9 0.23
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.2
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.15
20 0.15
21 0.2
22 0.22
23 0.17
24 0.18
25 0.23
26 0.27
27 0.3
28 0.32
29 0.28
30 0.3
31 0.33
32 0.4
33 0.38
34 0.38
35 0.37
36 0.41
37 0.47
38 0.48
39 0.51
40 0.5
41 0.57
42 0.62
43 0.67
44 0.71
45 0.74
46 0.77
47 0.82
48 0.84
49 0.82
50 0.84
51 0.84
52 0.83
53 0.83
54 0.84
55 0.83
56 0.81
57 0.8
58 0.81
59 0.82
60 0.81
61 0.76
62 0.75
63 0.72
64 0.68
65 0.63
66 0.53
67 0.44
68 0.36
69 0.32
70 0.23
71 0.19
72 0.14
73 0.14
74 0.17
75 0.18
76 0.24
77 0.28
78 0.34
79 0.37
80 0.46
81 0.53
82 0.56
83 0.56
84 0.51
85 0.55
86 0.53
87 0.49
88 0.47
89 0.42
90 0.42
91 0.43
92 0.45
93 0.38
94 0.4
95 0.45
96 0.39
97 0.38
98 0.34
99 0.33
100 0.3
101 0.28
102 0.23
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.11
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.14
120 0.21
121 0.23
122 0.24
123 0.25
124 0.24
125 0.23
126 0.24
127 0.2
128 0.13
129 0.11
130 0.13
131 0.15
132 0.17
133 0.2
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.21
138 0.21
139 0.25
140 0.22
141 0.21
142 0.25
143 0.23
144 0.28
145 0.28
146 0.26
147 0.21
148 0.23
149 0.22
150 0.25
151 0.3
152 0.28
153 0.28
154 0.34
155 0.42
156 0.5
157 0.54
158 0.48
159 0.47
160 0.46
161 0.48
162 0.48
163 0.45
164 0.45
165 0.42
166 0.46
167 0.45
168 0.42
169 0.38
170 0.34
171 0.34
172 0.27
173 0.27
174 0.24
175 0.23
176 0.23
177 0.26
178 0.26
179 0.23
180 0.22
181 0.23
182 0.24
183 0.22
184 0.22
185 0.19
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.11
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.15
196 0.2
197 0.29
198 0.38
199 0.46
200 0.55
201 0.63
202 0.71
203 0.77
204 0.81
205 0.83
206 0.84
207 0.84
208 0.83
209 0.82
210 0.79
211 0.78
212 0.78
213 0.76
214 0.76
215 0.77
216 0.73
217 0.71
218 0.67
219 0.66
220 0.58
221 0.58
222 0.53
223 0.52
224 0.5
225 0.47
226 0.48
227 0.42
228 0.47
229 0.44
230 0.42
231 0.39
232 0.39
233 0.38
234 0.37
235 0.4
236 0.41
237 0.4
238 0.37
239 0.37
240 0.4
241 0.43
242 0.42
243 0.43
244 0.42
245 0.45
246 0.48
247 0.48
248 0.43
249 0.38
250 0.41
251 0.38
252 0.33
253 0.29
254 0.28
255 0.32
256 0.32
257 0.36
258 0.34
259 0.37
260 0.43
261 0.48
262 0.56
263 0.59
264 0.62
265 0.64
266 0.61
267 0.63
268 0.59
269 0.53
270 0.45
271 0.4
272 0.35
273 0.29
274 0.27
275 0.2
276 0.14
277 0.12
278 0.1
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.03
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.13
334 0.15
335 0.22
336 0.23
337 0.22
338 0.22
339 0.23
340 0.22
341 0.19
342 0.17
343 0.12
344 0.12
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.11
352 0.1
353 0.13
354 0.14
355 0.23
356 0.34
357 0.43
358 0.47
359 0.55
360 0.59
361 0.63
362 0.71
363 0.7
364 0.71
365 0.72
366 0.77
367 0.79
368 0.82
369 0.8
370 0.78
371 0.79
372 0.76
373 0.69
374 0.62
375 0.59
376 0.53
377 0.48
378 0.42
379 0.36
380 0.29
381 0.3
382 0.35
383 0.33
384 0.33
385 0.31
386 0.31
387 0.3
388 0.31
389 0.3
390 0.28
391 0.27
392 0.28
393 0.32
394 0.33
395 0.34
396 0.33
397 0.32
398 0.3
399 0.28
400 0.24
401 0.2
402 0.21
403 0.2
404 0.19
405 0.17
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.17
410 0.19
411 0.22
412 0.23
413 0.3
414 0.31
415 0.31
416 0.4
417 0.47
418 0.51
419 0.57
420 0.61
421 0.64
422 0.71
423 0.78
424 0.73
425 0.73
426 0.74
427 0.68
428 0.66
429 0.58
430 0.52
431 0.44
432 0.38
433 0.29
434 0.24
435 0.19
436 0.12
437 0.11
438 0.1
439 0.07
440 0.08
441 0.09
442 0.08
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.12
449 0.13
450 0.16
451 0.2
452 0.23
453 0.24
454 0.24
455 0.23
456 0.22
457 0.22
458 0.18
459 0.12
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.13
464 0.12
465 0.12
466 0.11
467 0.13
468 0.17
469 0.17
470 0.2
471 0.26
472 0.33
473 0.4
474 0.49
475 0.54
476 0.59
477 0.67
478 0.68
479 0.7
480 0.71
481 0.7
482 0.7
483 0.67
484 0.6
485 0.57
486 0.51
487 0.43
488 0.34
489 0.28
490 0.2
491 0.16
492 0.14
493 0.08
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.12
513 0.14
514 0.13
515 0.11
516 0.1
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.13
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.14
526 0.16
527 0.17
528 0.16
529 0.17
530 0.15
531 0.16
532 0.16
533 0.14
534 0.12
535 0.1
536 0.11
537 0.11
538 0.11
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.15
544 0.15
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.15
549 0.14
550 0.15
551 0.13
552 0.12
553 0.11
554 0.11
555 0.11
556 0.09
557 0.09
558 0.08