FuNGI

A0A139GWN4

Protein Details

Accession

A0A139GWN4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
334-354	SLAAGRKKKRKGAKTSTTNYS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
338-347	GRKKKRKGAK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, mito 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKFIDKKNATHFQLVHRAQNDPLIHDENAPSMVFAEVEKPRRATEDDYAYSSTGSVYSSYRSKKTKERGDLEEEFGLAVRKNEGEAAEHGVFFDDTQYDYMQHMRDLGSGEGAVTWVEAKPAGPEKGKGKQRLEDALRNMDLDDGRSVGQSSMTSSVARSLLPEEVLPSEFVTKRSYQDQQDVPDEIAGFQPDMDPRLREVLEALDDEEYVDDEEDIFGELTKDGYEVERDEWERLGEQDLFGDEDDGWESDDTIKAPASPREMPPQLHLPEGEEAPPPEDPHAVPTADPTGGDWLDEFKKFKKAEKNDNIERSGMPAVSSMLESSAALSSLAAGRKKKRKGAKTSTTNYSMTSSSLARTDPLTTLDDRFDKMEAAYSLAEFPEEEEDEYNADVGSLASGMTGLSKASKTSKYSAMSGMSRASGVSTYSRADDEEAPKLVRSDFNGIMDDFLGSYSTSGKHKQRVKRGGPMTGMAQLDEIRSGLGPARFTSRAKSSAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.67
3	0.67
4	0.62
5	0.59
6	0.52
7	0.5
8	0.43
9	0.47
10	0.41
11	0.33
12	0.35
13	0.32
14	0.3
15	0.3
16	0.3
17	0.24
18	0.25
19	0.22
20	0.16
21	0.12
22	0.12
23	0.1
24	0.09
25	0.15
26	0.2
27	0.26
28	0.29
29	0.3
30	0.31
31	0.35
32	0.38
33	0.37
34	0.38
35	0.42
36	0.41
37	0.42
38	0.43
39	0.39
40	0.35
41	0.3
42	0.22
43	0.14
44	0.12
45	0.09
46	0.09
47	0.13
48	0.2
49	0.25
50	0.32
51	0.37
52	0.42
53	0.51
54	0.6
55	0.67
56	0.7
57	0.72
58	0.72
59	0.74
60	0.72
61	0.67
62	0.57
63	0.46
64	0.36
65	0.29
66	0.24
67	0.16
68	0.13
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.12
73	0.12
74	0.13
75	0.14
76	0.21
77	0.2
78	0.19
79	0.19
80	0.18
81	0.17
82	0.14
83	0.14
84	0.08
85	0.08
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.14
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.13
95	0.14
96	0.15
97	0.14
98	0.12
99	0.11
100	0.11
101	0.09
102	0.09
103	0.07
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.05
108	0.05
109	0.05
110	0.09
111	0.14
112	0.18
113	0.19
114	0.23
115	0.28
116	0.37
117	0.45
118	0.5
119	0.49
120	0.51
121	0.54
122	0.59
123	0.6
124	0.57
125	0.54
126	0.51
127	0.47
128	0.42
129	0.37
130	0.3
131	0.24
132	0.19
133	0.15
134	0.1
135	0.1
136	0.1
137	0.11
138	0.08
139	0.09
140	0.08
141	0.09
142	0.1
143	0.11
144	0.11
145	0.1
146	0.13
147	0.12
148	0.12
149	0.11
150	0.1
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.09
155	0.1
156	0.11
157	0.1
158	0.09
159	0.12
160	0.13
161	0.14
162	0.17
163	0.17
164	0.18
165	0.23
166	0.28
167	0.27
168	0.33
169	0.35
170	0.35
171	0.37
172	0.36
173	0.31
174	0.26
175	0.23
176	0.17
177	0.14
178	0.11
179	0.07
180	0.06
181	0.07
182	0.07
183	0.09
184	0.09
185	0.09
186	0.1
187	0.14
188	0.14
189	0.12
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.08
196	0.07
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.05
201	0.05
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.1
220	0.11
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.09
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.07
247	0.08
248	0.1
249	0.14
250	0.16
251	0.18
252	0.24
253	0.26
254	0.26
255	0.27
256	0.32
257	0.29
258	0.27
259	0.25
260	0.2
261	0.19
262	0.19
263	0.17
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.12
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.11
273	0.13
274	0.11
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.11
280	0.09
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.09
286	0.11
287	0.13
288	0.15
289	0.14
290	0.22
291	0.23
292	0.29
293	0.36
294	0.42
295	0.52
296	0.6
297	0.67
298	0.68
299	0.72
300	0.67
301	0.59
302	0.51
303	0.42
304	0.33
305	0.24
306	0.16
307	0.11
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.08
322	0.11
323	0.14
324	0.18
325	0.27
326	0.36
327	0.42
328	0.5
329	0.57
330	0.63
331	0.71
332	0.77
333	0.79
334	0.81
335	0.81
336	0.79
337	0.74
338	0.65
339	0.55
340	0.47
341	0.36
342	0.27
343	0.23
344	0.17
345	0.14
346	0.14
347	0.13
348	0.12
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.14
353	0.15
354	0.15
355	0.17
356	0.19
357	0.2
358	0.19
359	0.19
360	0.17
361	0.16
362	0.14
363	0.17
364	0.14
365	0.14
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.12
379	0.12
380	0.11
381	0.08
382	0.07
383	0.06
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.06
395	0.07
396	0.09
397	0.14
398	0.2
399	0.23
400	0.27
401	0.34
402	0.35
403	0.37
404	0.39
405	0.39
406	0.36
407	0.34
408	0.31
409	0.24
410	0.21
411	0.19
412	0.16
413	0.11
414	0.11
415	0.12
416	0.12
417	0.13
418	0.15
419	0.15
420	0.15
421	0.18
422	0.22
423	0.24
424	0.27
425	0.28
426	0.28
427	0.28
428	0.28
429	0.27
430	0.24
431	0.24
432	0.25
433	0.25
434	0.27
435	0.28
436	0.27
437	0.26
438	0.23
439	0.2
440	0.13
441	0.1
442	0.09
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.11
447	0.15
448	0.23
449	0.3
450	0.38
451	0.47
452	0.56
453	0.65
454	0.74
455	0.77
456	0.8
457	0.79
458	0.77
459	0.72
460	0.65
461	0.57
462	0.52
463	0.44
464	0.34
465	0.29
466	0.22
467	0.19
468	0.17
469	0.14
470	0.09
471	0.09
472	0.1
473	0.13
474	0.15
475	0.16
476	0.17
477	0.24
478	0.27
479	0.28
480	0.34
481	0.35

A0A139GWN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer