Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139H066

Protein Details
Accession A0A139H066    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-75QEVQVKKKRQPIPKLDENRLHydrophilic
82-101PKLRKITKSRLKFRGKGHEFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-97PKLRKITKSRLKFRGK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MPSAVSPNPRAGSAQPDELDRLLDYDAAVDDFLNDIPVRGNEQNAATEEQPRDEDQEVQVKKKRQPIPKLDENRLLSEAGIPKLRKITKSRLKFRGKGHEFSDISRLLNTYQLWLDDLYPRAKFRDALTMVEKVGHSKRMQVMRRAWLDGTKPNRRLSPEPEAERDPDFDAMMSGANGDAYETERQNSMPGEGAAGQHTTEQASKHDGDAPDDDELDALLAESGPTSAPVARQRKAGPFQDDSDDELDALLSENHPAQSGAKPAKEAGSFEEGPDEDELDALMNEQGPTHAPGAAASTAGYTRAQTLDDFADDEEAMASMGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.31
4 0.33
5 0.31
6 0.3
7 0.22
8 0.19
9 0.14
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.1
24 0.11
25 0.16
26 0.16
27 0.18
28 0.18
29 0.2
30 0.22
31 0.23
32 0.25
33 0.2
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.25
38 0.23
39 0.25
40 0.23
41 0.25
42 0.22
43 0.3
44 0.31
45 0.36
46 0.41
47 0.44
48 0.48
49 0.56
50 0.61
51 0.61
52 0.69
53 0.73
54 0.76
55 0.79
56 0.82
57 0.78
58 0.78
59 0.71
60 0.64
61 0.55
62 0.46
63 0.35
64 0.32
65 0.29
66 0.23
67 0.25
68 0.22
69 0.23
70 0.3
71 0.33
72 0.34
73 0.37
74 0.46
75 0.5
76 0.61
77 0.69
78 0.71
79 0.77
80 0.78
81 0.8
82 0.8
83 0.76
84 0.7
85 0.63
86 0.62
87 0.54
88 0.48
89 0.46
90 0.35
91 0.31
92 0.26
93 0.24
94 0.15
95 0.17
96 0.16
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.24
113 0.23
114 0.25
115 0.27
116 0.26
117 0.25
118 0.25
119 0.24
120 0.18
121 0.18
122 0.19
123 0.16
124 0.19
125 0.24
126 0.31
127 0.35
128 0.39
129 0.42
130 0.45
131 0.47
132 0.44
133 0.39
134 0.33
135 0.32
136 0.31
137 0.35
138 0.35
139 0.37
140 0.38
141 0.41
142 0.42
143 0.44
144 0.43
145 0.44
146 0.43
147 0.42
148 0.42
149 0.41
150 0.39
151 0.36
152 0.31
153 0.23
154 0.17
155 0.14
156 0.1
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.05
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.05
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.13
191 0.13
192 0.14
193 0.18
194 0.18
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.1
202 0.1
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.09
216 0.18
217 0.24
218 0.25
219 0.3
220 0.33
221 0.4
222 0.46
223 0.5
224 0.47
225 0.44
226 0.45
227 0.45
228 0.43
229 0.38
230 0.32
231 0.26
232 0.2
233 0.16
234 0.13
235 0.09
236 0.08
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.12
246 0.2
247 0.24
248 0.24
249 0.25
250 0.25
251 0.29
252 0.28
253 0.27
254 0.23
255 0.26
256 0.25
257 0.24
258 0.27
259 0.23
260 0.23
261 0.22
262 0.19
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.15
281 0.14
282 0.13
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.17
297 0.15
298 0.16
299 0.14
300 0.14
301 0.11
302 0.09