Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139GTW1

Protein Details
Accession A0A139GTW1    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21ESSRGPPRVKNKAPAPQQISHydrophilic
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRLNHydrophilic
611-638DIEKVTKMLPRKVKKRRKLDDDSFEEYMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
620-628PRKVKKRRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, nucl 13, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAPAPQQISAEQLLREAVDRQEPALEKPTTRFADLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRLNMGNWFRYAAWELEQKEYRRARSVFERALDCEPTNVQLWVRYIESEMKERNINHARNLLDRAVSILPRVDKLWYKYVYMEEMLGNIPGTRAVFERWMSWEPDEAAWSAYIKLEKRYGEFDRARNIFERFTIVHPEPRNWIKWAKFEEENGTSDLVREVFGMAIEALGDEFMDEKLFIAYAKFEAKLKEYERSRAIYKYALDRMPRSKSAILHKSYTTFEKQFGDREGVEDVVLSKRRVLYEEQVKENPKNYDAWFDYARLEETGGDEERVRDVYERAIAQMPPSHEKRHWRRYIYLWIFYAMYEELTTRDADRAQQVYEEALKIVPHKQFTFAKLWILKAQFHLRRQELDKARKTLGMAIGMCPKNKLFRAYIEMELKLFEFVRCRTLYEKWIEFDPSNSQAWIKFAELEHGLEDLDRTRAIFELAIQQDVLDMPELVWKAYIDFEEEEGAYDKTRDLYERLLQKTGHVKVWISYAHFELNVPDAEEVSDEATVSEAAKTRARKIFERAHKLYKDQTLVEERVSLLNAWKSFEDTHGSAQDIEKVTKMLPRKVKKRRKLDDDSFEEYMDYVFPADDESSAKVSKLMMMAQKWKSEQESAAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.79
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.58
8 0.51
9 0.44
10 0.34
11 0.28
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.2
19 0.2
20 0.26
21 0.27
22 0.29
23 0.34
24 0.34
25 0.3
26 0.32
27 0.41
28 0.37
29 0.38
30 0.34
31 0.29
32 0.37
33 0.36
34 0.37
35 0.32
36 0.31
37 0.3
38 0.33
39 0.32
40 0.29
41 0.36
42 0.38
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.81
53 0.77
54 0.69
55 0.67
56 0.64
57 0.6
58 0.6
59 0.59
60 0.54
61 0.54
62 0.55
63 0.48
64 0.44
65 0.39
66 0.3
67 0.25
68 0.26
69 0.27
70 0.33
71 0.39
72 0.38
73 0.45
74 0.49
75 0.49
76 0.51
77 0.5
78 0.48
79 0.52
80 0.58
81 0.55
82 0.54
83 0.53
84 0.48
85 0.51
86 0.49
87 0.39
88 0.32
89 0.27
90 0.24
91 0.23
92 0.21
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.18
97 0.19
98 0.17
99 0.18
100 0.23
101 0.25
102 0.28
103 0.29
104 0.29
105 0.33
106 0.33
107 0.41
108 0.44
109 0.44
110 0.42
111 0.45
112 0.44
113 0.43
114 0.46
115 0.38
116 0.29
117 0.26
118 0.25
119 0.22
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.19
153 0.21
154 0.23
155 0.22
156 0.23
157 0.21
158 0.21
159 0.21
160 0.16
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.16
169 0.2
170 0.21
171 0.23
172 0.29
173 0.31
174 0.37
175 0.41
176 0.41
177 0.46
178 0.45
179 0.45
180 0.42
181 0.4
182 0.32
183 0.27
184 0.27
185 0.2
186 0.2
187 0.25
188 0.24
189 0.29
190 0.29
191 0.31
192 0.33
193 0.35
194 0.36
195 0.32
196 0.37
197 0.34
198 0.39
199 0.42
200 0.41
201 0.39
202 0.39
203 0.41
204 0.37
205 0.35
206 0.29
207 0.26
208 0.2
209 0.19
210 0.17
211 0.12
212 0.09
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.19
243 0.21
244 0.27
245 0.28
246 0.32
247 0.34
248 0.35
249 0.35
250 0.32
251 0.31
252 0.26
253 0.26
254 0.27
255 0.29
256 0.29
257 0.29
258 0.31
259 0.35
260 0.36
261 0.36
262 0.34
263 0.32
264 0.33
265 0.4
266 0.44
267 0.41
268 0.39
269 0.38
270 0.37
271 0.36
272 0.35
273 0.3
274 0.24
275 0.23
276 0.23
277 0.24
278 0.24
279 0.24
280 0.23
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.14
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.11
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.17
296 0.21
297 0.28
298 0.32
299 0.35
300 0.37
301 0.4
302 0.4
303 0.41
304 0.35
305 0.26
306 0.25
307 0.22
308 0.23
309 0.22
310 0.24
311 0.21
312 0.2
313 0.2
314 0.18
315 0.18
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.15
339 0.18
340 0.2
341 0.22
342 0.23
343 0.33
344 0.42
345 0.5
346 0.55
347 0.53
348 0.55
349 0.57
350 0.65
351 0.59
352 0.53
353 0.43
354 0.37
355 0.33
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.12
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.14
382 0.15
383 0.17
384 0.17
385 0.22
386 0.24
387 0.27
388 0.3
389 0.26
390 0.29
391 0.28
392 0.29
393 0.28
394 0.27
395 0.25
396 0.24
397 0.33
398 0.33
399 0.35
400 0.41
401 0.38
402 0.41
403 0.43
404 0.49
405 0.49
406 0.53
407 0.55
408 0.52
409 0.51
410 0.48
411 0.46
412 0.4
413 0.33
414 0.28
415 0.22
416 0.2
417 0.27
418 0.27
419 0.27
420 0.24
421 0.22
422 0.23
423 0.25
424 0.26
425 0.2
426 0.22
427 0.28
428 0.3
429 0.35
430 0.33
431 0.31
432 0.28
433 0.26
434 0.23
435 0.18
436 0.15
437 0.1
438 0.11
439 0.11
440 0.16
441 0.16
442 0.18
443 0.2
444 0.23
445 0.28
446 0.31
447 0.33
448 0.29
449 0.31
450 0.32
451 0.29
452 0.28
453 0.26
454 0.23
455 0.21
456 0.2
457 0.19
458 0.17
459 0.18
460 0.17
461 0.14
462 0.13
463 0.12
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.15
468 0.13
469 0.12
470 0.1
471 0.1
472 0.08
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.15
482 0.16
483 0.16
484 0.16
485 0.15
486 0.15
487 0.15
488 0.14
489 0.06
490 0.05
491 0.05
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.13
508 0.11
509 0.1
510 0.1
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.18
516 0.24
517 0.31
518 0.34
519 0.36
520 0.35
521 0.38
522 0.44
523 0.42
524 0.4
525 0.34
526 0.31
527 0.29
528 0.33
529 0.31
530 0.25
531 0.23
532 0.21
533 0.21
534 0.2
535 0.19
536 0.16
537 0.16
538 0.14
539 0.14
540 0.12
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.1
545 0.08
546 0.08
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.09
554 0.12
555 0.17
556 0.2
557 0.27
558 0.33
559 0.37
560 0.4
561 0.46
562 0.54
563 0.59
564 0.67
565 0.66
566 0.69
567 0.68
568 0.68
569 0.67
570 0.64
571 0.57
572 0.48
573 0.48
574 0.45
575 0.44
576 0.4
577 0.34
578 0.28
579 0.25
580 0.25
581 0.2
582 0.17
583 0.21
584 0.21
585 0.21
586 0.21
587 0.22
588 0.23
589 0.24
590 0.26
591 0.23
592 0.27
593 0.27
594 0.27
595 0.26
596 0.26
597 0.3
598 0.26
599 0.25
600 0.21
601 0.2
602 0.21
603 0.24
604 0.3
605 0.32
606 0.39
607 0.49
608 0.59
609 0.69
610 0.79
611 0.84
612 0.89
613 0.91
614 0.92
615 0.92
616 0.91
617 0.91
618 0.87
619 0.84
620 0.74
621 0.63
622 0.53
623 0.43
624 0.33
625 0.22
626 0.15
627 0.08
628 0.07
629 0.06
630 0.08
631 0.09
632 0.09
633 0.11
634 0.13
635 0.16
636 0.17
637 0.17
638 0.16
639 0.16
640 0.18
641 0.18
642 0.21
643 0.24
644 0.29
645 0.38
646 0.41
647 0.46
648 0.46
649 0.48
650 0.47
651 0.44