Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HQX2

Protein Details
Accession A0A139HQX2    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-75SPEPQNSKSSKRKREATDADIDSKKAAKKARRKLKKPKDVDDDALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-44KRKR
52-68DSKKAAKKARRKLKKPK
149-156RRKKQGKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MSSLSCHIPAAMADSDSDQAGVPLIENLSDSPEPQNSKSSKRKREATDADIDSKKAAKKARRKLKKPKDVDDDALDSELGINKGIAYMDSSLMADHIAQRTKRFQPDLSLVEAEDWRIPETAITDTTSFSQDRVTDSLPTFLEQFAGARRKKQGKKLENAPNEKGAPHTLVVAGAGLRAADLTRALRKFQTKEAMVAKLFAKHIKLKEAVESCKKTRMNIGVGTPQRIMDLLDDGALSAKHLERIVVDASHIDTKKRGMLDMKELQVPLVKLLTRENLKERYGSGEGKVELLFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.09
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.08
15 0.12
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.21
20 0.25
21 0.26
22 0.34
23 0.32
24 0.42
25 0.52
26 0.59
27 0.64
28 0.7
29 0.77
30 0.76
31 0.82
32 0.81
33 0.76
34 0.75
35 0.68
36 0.66
37 0.59
38 0.52
39 0.42
40 0.39
41 0.35
42 0.31
43 0.35
44 0.37
45 0.46
46 0.57
47 0.66
48 0.73
49 0.81
50 0.87
51 0.91
52 0.92
53 0.91
54 0.9
55 0.88
56 0.82
57 0.76
58 0.69
59 0.61
60 0.51
61 0.42
62 0.32
63 0.23
64 0.18
65 0.15
66 0.11
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.07
83 0.1
84 0.14
85 0.15
86 0.18
87 0.24
88 0.29
89 0.35
90 0.35
91 0.33
92 0.34
93 0.4
94 0.39
95 0.36
96 0.31
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.18
101 0.13
102 0.11
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.13
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.08
131 0.08
132 0.1
133 0.17
134 0.17
135 0.19
136 0.26
137 0.35
138 0.4
139 0.49
140 0.55
141 0.56
142 0.63
143 0.7
144 0.74
145 0.73
146 0.74
147 0.67
148 0.59
149 0.52
150 0.44
151 0.36
152 0.27
153 0.2
154 0.14
155 0.13
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.06
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.18
174 0.24
175 0.26
176 0.31
177 0.37
178 0.32
179 0.37
180 0.39
181 0.39
182 0.34
183 0.33
184 0.29
185 0.24
186 0.25
187 0.21
188 0.21
189 0.23
190 0.25
191 0.28
192 0.3
193 0.27
194 0.33
195 0.37
196 0.4
197 0.43
198 0.47
199 0.43
200 0.49
201 0.49
202 0.42
203 0.44
204 0.44
205 0.4
206 0.38
207 0.4
208 0.4
209 0.42
210 0.43
211 0.37
212 0.31
213 0.26
214 0.23
215 0.2
216 0.12
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.13
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.14
237 0.21
238 0.21
239 0.2
240 0.19
241 0.21
242 0.26
243 0.25
244 0.27
245 0.26
246 0.3
247 0.38
248 0.43
249 0.44
250 0.43
251 0.42
252 0.39
253 0.36
254 0.32
255 0.25
256 0.21
257 0.19
258 0.17
259 0.21
260 0.29
261 0.29
262 0.34
263 0.39
264 0.41
265 0.42
266 0.43
267 0.4
268 0.4
269 0.4
270 0.37
271 0.33
272 0.33
273 0.32
274 0.32