Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HHW6

Protein Details
Accession A0A139HHW6    Localization Confidence High Confidence Score 20.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21APIRPASKKRTTARSRVAAKHydrophilic
84-110VREGAIEKKSKKRRRPNKKLNTDIGELBasic
132-155DLAVDGKKEKRRRKNEGKIVMKSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-102KKDKRTIKHGNLLAKVREGAIEKKSKKRRRPNKK
138-167KKEKRRRKNEGKIVMKSLKLRQGAMKRKKR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPIRPASKKRTTARSRVAAKSSTDPRGKYAPLPASETAISAEPAPTDALSNLKKDYFGFDGNDFRLSKKDKRTIKHGNLLAKVREGAIEKKSKKRRRPNKKLNTDIGELGDALPDIGDDEDVWEGIDEDGDLAVDGKKEKRRRKNEGKIVMKSLKLRQGAMKRKKRMEDDEMERMQRNLALLAQGRAADGMQESVEGGAEDARAKRWEALRAFIGGTMQKDQAFAKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.8
4 0.77
5 0.74
6 0.67
7 0.62
8 0.61
9 0.58
10 0.57
11 0.55
12 0.49
13 0.48
14 0.5
15 0.48
16 0.42
17 0.44
18 0.42
19 0.39
20 0.43
21 0.39
22 0.37
23 0.35
24 0.32
25 0.25
26 0.19
27 0.17
28 0.12
29 0.12
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.13
37 0.15
38 0.17
39 0.18
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.21
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.21
48 0.24
49 0.25
50 0.28
51 0.25
52 0.22
53 0.26
54 0.29
55 0.33
56 0.38
57 0.46
58 0.49
59 0.53
60 0.62
61 0.67
62 0.69
63 0.71
64 0.66
65 0.64
66 0.62
67 0.62
68 0.53
69 0.43
70 0.35
71 0.27
72 0.24
73 0.2
74 0.18
75 0.2
76 0.28
77 0.31
78 0.4
79 0.51
80 0.58
81 0.66
82 0.74
83 0.79
84 0.82
85 0.9
86 0.92
87 0.92
88 0.93
89 0.91
90 0.87
91 0.8
92 0.7
93 0.6
94 0.49
95 0.38
96 0.27
97 0.19
98 0.12
99 0.07
100 0.05
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.02
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.06
124 0.11
125 0.18
126 0.27
127 0.37
128 0.48
129 0.57
130 0.67
131 0.77
132 0.84
133 0.87
134 0.89
135 0.88
136 0.81
137 0.78
138 0.71
139 0.63
140 0.56
141 0.5
142 0.46
143 0.39
144 0.37
145 0.37
146 0.43
147 0.51
148 0.58
149 0.63
150 0.65
151 0.7
152 0.76
153 0.76
154 0.73
155 0.71
156 0.69
157 0.67
158 0.67
159 0.63
160 0.59
161 0.52
162 0.45
163 0.37
164 0.29
165 0.22
166 0.14
167 0.12
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.12
191 0.14
192 0.15
193 0.21
194 0.24
195 0.32
196 0.32
197 0.36
198 0.35
199 0.35
200 0.34
201 0.3
202 0.28
203 0.23
204 0.23
205 0.21
206 0.22
207 0.2
208 0.21