Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HHC2

Protein Details
Accession A0A139HHC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-250ASAPTEKKEKPKKEKQPKQPKAPAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-175AKAEKERKKKEKAA
205-213QKPKKEKAK
228-250PTEKKEKPKKEKQPKQPKAPAAP
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 13.333, nucl 6, mito_nucl 5.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50886  TRBD  
CDD cd10304  GST_C_Arc1p_N_like  
Amino Acid Sequences MAATQIDDKVKSLIAKSFPNASDQENEPAKLSAAIFTSLDYTPAEKTEIEQWTTTASHLASPNEDAAKTAERLSHLNTHLASRTTILGSKPSVADVAIFSRLAPVVKEWSPEQRTGDQGYHHIVRYLDFVQNAELFALKLDAGEKVDIDPSKVVAPIKPIDAKAEKERKKKEKAAAAAAGADGAAAAGGTLTSAASEDTKKAENQKPKKEKAKDLGESVAAAVGASAPTEKKEKPKKEKQPKQPKAPAAPEKPFSPALIDLRVGHILKAEQHPNADSLYVSTIACGDAPGTENTSEYEGKIVRTVCSGLNGLVPLEEMQGRKIVAVCNLKPVTMRGIKSAAMVLAASPRVAPGEDDHHAGPVELVNPPADAEAGERVYFEGFEGEPDAVLNPKKKVWEDNQVGFTTTEDKIVAFEPTKVEKLKDSGKTEVAKLRTKQGLCTVKTLTGATVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.33
4 0.39
5 0.37
6 0.4
7 0.39
8 0.36
9 0.36
10 0.34
11 0.39
12 0.35
13 0.36
14 0.33
15 0.31
16 0.29
17 0.26
18 0.23
19 0.18
20 0.16
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.12
33 0.15
34 0.21
35 0.25
36 0.26
37 0.25
38 0.24
39 0.26
40 0.26
41 0.24
42 0.19
43 0.15
44 0.17
45 0.2
46 0.21
47 0.19
48 0.21
49 0.23
50 0.23
51 0.22
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.2
56 0.2
57 0.19
58 0.19
59 0.22
60 0.25
61 0.29
62 0.28
63 0.3
64 0.29
65 0.3
66 0.31
67 0.3
68 0.26
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.2
73 0.18
74 0.19
75 0.18
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.16
80 0.14
81 0.14
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.14
93 0.15
94 0.18
95 0.18
96 0.27
97 0.3
98 0.32
99 0.35
100 0.33
101 0.35
102 0.36
103 0.36
104 0.28
105 0.28
106 0.3
107 0.28
108 0.26
109 0.24
110 0.21
111 0.2
112 0.22
113 0.21
114 0.19
115 0.16
116 0.17
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.12
121 0.1
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.11
142 0.15
143 0.15
144 0.18
145 0.2
146 0.19
147 0.23
148 0.25
149 0.27
150 0.33
151 0.42
152 0.46
153 0.53
154 0.63
155 0.66
156 0.72
157 0.77
158 0.75
159 0.73
160 0.7
161 0.67
162 0.6
163 0.51
164 0.43
165 0.35
166 0.27
167 0.18
168 0.13
169 0.06
170 0.03
171 0.02
172 0.01
173 0.01
174 0.01
175 0.01
176 0.01
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.03
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.1
187 0.11
188 0.19
189 0.26
190 0.35
191 0.43
192 0.53
193 0.61
194 0.68
195 0.76
196 0.75
197 0.76
198 0.75
199 0.75
200 0.67
201 0.6
202 0.53
203 0.43
204 0.37
205 0.29
206 0.2
207 0.1
208 0.07
209 0.05
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.04
216 0.08
217 0.1
218 0.19
219 0.29
220 0.39
221 0.49
222 0.6
223 0.7
224 0.79
225 0.87
226 0.89
227 0.91
228 0.9
229 0.9
230 0.88
231 0.83
232 0.79
233 0.78
234 0.76
235 0.71
236 0.65
237 0.57
238 0.5
239 0.46
240 0.39
241 0.31
242 0.24
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.14
249 0.17
250 0.15
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.13
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.15
263 0.11
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.12
286 0.13
287 0.16
288 0.16
289 0.13
290 0.14
291 0.16
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.18
312 0.24
313 0.24
314 0.31
315 0.32
316 0.31
317 0.3
318 0.3
319 0.31
320 0.29
321 0.3
322 0.24
323 0.26
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.18
328 0.13
329 0.12
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.14
341 0.16
342 0.18
343 0.18
344 0.19
345 0.19
346 0.18
347 0.16
348 0.11
349 0.11
350 0.09
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.1
360 0.11
361 0.11
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.16
377 0.19
378 0.2
379 0.22
380 0.28
381 0.3
382 0.38
383 0.42
384 0.48
385 0.52
386 0.57
387 0.59
388 0.55
389 0.54
390 0.46
391 0.39
392 0.33
393 0.25
394 0.2
395 0.15
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.18
400 0.15
401 0.17
402 0.2
403 0.24
404 0.29
405 0.3
406 0.3
407 0.3
408 0.35
409 0.42
410 0.46
411 0.46
412 0.47
413 0.51
414 0.53
415 0.54
416 0.56
417 0.53
418 0.53
419 0.51
420 0.54
421 0.56
422 0.54
423 0.53
424 0.56
425 0.59
426 0.53
427 0.56
428 0.5
429 0.45
430 0.46
431 0.42