Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HI54

Protein Details
Accession A0A139HI54    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAAMERRRKRDLREQNRRAWNGEHydrophilic
1188-1211AAPRYDKSGNTRSRQRARKLQLGDHydrophilic
1243-1263KKSANGRDSGTRRRGNRRSKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1251-1263SGTRRRGNRRSKG
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MAAMERRRKRDLREQNRRAWNGEKDILEVQGSLDSNMKKNTAFIKRLRTALTAANQATFLHDIRSLSLHKYLTEIISACYEALTKLKVAADITAAVEVVSALHQRFGPEEFTSYLAWYVGRALATPDKAQLKALAPDVREREERERIARQRTLLRVATELWLVGVLKSLEDISQPAEAAKGAKLPETTSKPKVNGVRADTVDPEPFPLEVLKDMLGQDREHVNLPLVVLFVKAFAWDILGSKATKGEQRQKVAEDGATIAANTNGESQTSTENDDGAVPDPPLTPPAMQERFRNIIQRYFDDVKAHIIRDQERLTNQGKRNAEAYVKSGEVFEDRQANYEKAVKAQEKLVASAQTLAEVLGAEMPDLSEKDTANSGFEGSVGLVKTGEYLRGQSEGAGIWEDEDERRFYENLTDLKDRVPGILLEDGKKKKDGNDEQVGKKIDESNEPRDKPAESEETSTAIANKTVGAQVDALLTRLHELTTRDQVDQFAIDFCFLNSKASRNRLIKAVEDVPKGRTDLLPLYARLITTLGRYLHDIPEAMIKYLDDEFRSLQRRKSKDFLGQVRMVNIRYIAELTKFGVVPEHVIFHCLKVSLDDFSRMNIEIIANLLENCGRYLLRNPDTSPRMTSFLETLQRKKAAQHLGQQERMLIENAAYYVNPPERAAIQQKERTTLDLFVRKLVYSDLSKKSLDKVIKQIRKLHWEESEVVDILRKIFVKPGKIKFGNIYLLGMMLAALWRFHTSFVVTVLDELLERITVGLEVNDFKYNQRRIAEVKYLGELYMYRIVDSALIFDTLYKILNYGHKNGYAQPGDICPIDLPDDYFRIRLACALLETCGHCFEKGAAKKKLDFYLSFLQYYINVKDPLPMDIEFVIQDTFNLLRPQWKLVLGDLSEASRVFSEACKLHYQTTASNQAPEPEEAEELEAEGNLSGDDHADGEEDAAEGEDANTKSDSDDAKVQGDDENEVVRANDSDEEEHIVVTRPEDQRDPEADADFDRELAKLMAESVDSRKFERKTMFDVPLPMRRSVRDATTTAAEDSGGEGSAPVPANGPGTMKFALLSKKGNRQQTRSIELPSDSSFAVAMRTQQQNERAEQQRIKNLVLNYDLTDDQTDGDSPSFHYVNASNNNVRLVGTGLLNQRGLVLPRNSRQKSGEATDKENGPCLDTASSSRRDSFTDETGGFESLHAAPRYDKSGNTRSRQRARKLQLGDIDWYGNNSTSTAKSPQNREESQQSLDQYVVDKKSANGRDSGTRRRGNRRSKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.85
3 0.89
4 0.85
5 0.79
6 0.75
7 0.72
8 0.68
9 0.65
10 0.56
11 0.49
12 0.47
13 0.43
14 0.36
15 0.28
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.15
20 0.19
21 0.2
22 0.24
23 0.27
24 0.28
25 0.24
26 0.28
27 0.36
28 0.4
29 0.45
30 0.48
31 0.55
32 0.59
33 0.63
34 0.62
35 0.55
36 0.49
37 0.48
38 0.47
39 0.44
40 0.39
41 0.36
42 0.33
43 0.3
44 0.3
45 0.26
46 0.21
47 0.16
48 0.17
49 0.17
50 0.18
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.27
55 0.25
56 0.23
57 0.26
58 0.26
59 0.23
60 0.25
61 0.22
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.16
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.11
72 0.14
73 0.15
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.08
85 0.06
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.11
90 0.12
91 0.13
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.17
96 0.2
97 0.19
98 0.21
99 0.2
100 0.19
101 0.18
102 0.15
103 0.13
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.14
110 0.18
111 0.21
112 0.22
113 0.26
114 0.28
115 0.29
116 0.3
117 0.3
118 0.28
119 0.29
120 0.34
121 0.32
122 0.3
123 0.36
124 0.39
125 0.4
126 0.4
127 0.42
128 0.43
129 0.47
130 0.5
131 0.5
132 0.56
133 0.58
134 0.63
135 0.62
136 0.6
137 0.6
138 0.6
139 0.6
140 0.54
141 0.48
142 0.42
143 0.39
144 0.36
145 0.28
146 0.23
147 0.16
148 0.13
149 0.12
150 0.1
151 0.11
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.15
170 0.15
171 0.18
172 0.25
173 0.32
174 0.38
175 0.42
176 0.47
177 0.46
178 0.53
179 0.57
180 0.56
181 0.56
182 0.54
183 0.54
184 0.51
185 0.51
186 0.47
187 0.42
188 0.37
189 0.29
190 0.26
191 0.19
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.13
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.17
202 0.18
203 0.17
204 0.19
205 0.2
206 0.21
207 0.21
208 0.21
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.12
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.14
230 0.14
231 0.19
232 0.26
233 0.35
234 0.4
235 0.46
236 0.5
237 0.5
238 0.51
239 0.48
240 0.41
241 0.31
242 0.25
243 0.2
244 0.16
245 0.14
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.12
264 0.12
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.21
274 0.27
275 0.28
276 0.32
277 0.37
278 0.4
279 0.42
280 0.47
281 0.4
282 0.4
283 0.41
284 0.41
285 0.42
286 0.42
287 0.42
288 0.36
289 0.35
290 0.36
291 0.35
292 0.32
293 0.27
294 0.27
295 0.28
296 0.31
297 0.33
298 0.29
299 0.28
300 0.32
301 0.35
302 0.39
303 0.41
304 0.43
305 0.43
306 0.4
307 0.41
308 0.38
309 0.37
310 0.3
311 0.28
312 0.23
313 0.21
314 0.2
315 0.19
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.18
321 0.18
322 0.21
323 0.24
324 0.23
325 0.23
326 0.28
327 0.26
328 0.23
329 0.29
330 0.28
331 0.27
332 0.29
333 0.32
334 0.26
335 0.28
336 0.27
337 0.21
338 0.2
339 0.21
340 0.18
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.06
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.08
376 0.09
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.1
381 0.11
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.15
397 0.19
398 0.2
399 0.25
400 0.25
401 0.24
402 0.25
403 0.27
404 0.23
405 0.19
406 0.17
407 0.12
408 0.12
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.24
413 0.26
414 0.27
415 0.29
416 0.28
417 0.28
418 0.37
419 0.42
420 0.43
421 0.51
422 0.56
423 0.56
424 0.61
425 0.58
426 0.47
427 0.41
428 0.36
429 0.28
430 0.3
431 0.33
432 0.36
433 0.43
434 0.43
435 0.43
436 0.41
437 0.4
438 0.33
439 0.32
440 0.29
441 0.22
442 0.25
443 0.24
444 0.24
445 0.24
446 0.23
447 0.19
448 0.13
449 0.12
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.1
468 0.13
469 0.2
470 0.22
471 0.22
472 0.22
473 0.23
474 0.21
475 0.19
476 0.16
477 0.1
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.1
483 0.09
484 0.12
485 0.12
486 0.16
487 0.21
488 0.25
489 0.33
490 0.33
491 0.35
492 0.36
493 0.37
494 0.34
495 0.33
496 0.35
497 0.32
498 0.32
499 0.31
500 0.28
501 0.27
502 0.26
503 0.23
504 0.16
505 0.14
506 0.13
507 0.16
508 0.17
509 0.16
510 0.18
511 0.17
512 0.17
513 0.14
514 0.13
515 0.1
516 0.09
517 0.12
518 0.11
519 0.11
520 0.13
521 0.14
522 0.15
523 0.15
524 0.14
525 0.11
526 0.16
527 0.15
528 0.14
529 0.12
530 0.11
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.09
535 0.09
536 0.1
537 0.16
538 0.23
539 0.23
540 0.28
541 0.35
542 0.39
543 0.43
544 0.47
545 0.46
546 0.46
547 0.53
548 0.53
549 0.51
550 0.51
551 0.46
552 0.45
553 0.42
554 0.35
555 0.26
556 0.2
557 0.14
558 0.1
559 0.11
560 0.09
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.09
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.1
572 0.09
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.11
577 0.09
578 0.09
579 0.08
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.11
588 0.1
589 0.09
590 0.08
591 0.06
592 0.06
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.1
604 0.17
605 0.2
606 0.22
607 0.23
608 0.29
609 0.31
610 0.32
611 0.3
612 0.24
613 0.24
614 0.23
615 0.22
616 0.16
617 0.17
618 0.23
619 0.23
620 0.24
621 0.25
622 0.26
623 0.26
624 0.26
625 0.3
626 0.31
627 0.32
628 0.37
629 0.43
630 0.46
631 0.47
632 0.46
633 0.39
634 0.32
635 0.29
636 0.22
637 0.13
638 0.08
639 0.06
640 0.07
641 0.06
642 0.05
643 0.05
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.12
651 0.17
652 0.19
653 0.24
654 0.29
655 0.29
656 0.32
657 0.32
658 0.31
659 0.27
660 0.27
661 0.25
662 0.26
663 0.26
664 0.24
665 0.24
666 0.22
667 0.21
668 0.18
669 0.16
670 0.13
671 0.19
672 0.21
673 0.23
674 0.23
675 0.23
676 0.25
677 0.29
678 0.29
679 0.25
680 0.32
681 0.39
682 0.44
683 0.47
684 0.53
685 0.51
686 0.57
687 0.57
688 0.51
689 0.44
690 0.41
691 0.39
692 0.33
693 0.3
694 0.22
695 0.19
696 0.16
697 0.13
698 0.11
699 0.11
700 0.09
701 0.08
702 0.12
703 0.15
704 0.22
705 0.29
706 0.34
707 0.41
708 0.42
709 0.43
710 0.4
711 0.41
712 0.36
713 0.29
714 0.24
715 0.15
716 0.14
717 0.13
718 0.1
719 0.06
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.04
726 0.05
727 0.06
728 0.06
729 0.07
730 0.07
731 0.09
732 0.09
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.07
737 0.07
738 0.06
739 0.05
740 0.03
741 0.03
742 0.03
743 0.03
744 0.03
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.05
749 0.07
750 0.09
751 0.09
752 0.11
753 0.19
754 0.21
755 0.25
756 0.25
757 0.26
758 0.28
759 0.33
760 0.37
761 0.31
762 0.3
763 0.27
764 0.26
765 0.23
766 0.2
767 0.15
768 0.12
769 0.15
770 0.14
771 0.13
772 0.13
773 0.13
774 0.13
775 0.13
776 0.11
777 0.06
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.07
782 0.07
783 0.07
784 0.06
785 0.06
786 0.08
787 0.14
788 0.17
789 0.2
790 0.22
791 0.23
792 0.24
793 0.26
794 0.31
795 0.25
796 0.24
797 0.2
798 0.19
799 0.19
800 0.18
801 0.16
802 0.09
803 0.09
804 0.1
805 0.09
806 0.1
807 0.1
808 0.13
809 0.13
810 0.13
811 0.13
812 0.12
813 0.11
814 0.11
815 0.1
816 0.08
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.1
821 0.1
822 0.1
823 0.12
824 0.12
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.2
829 0.26
830 0.34
831 0.38
832 0.4
833 0.44
834 0.48
835 0.5
836 0.45
837 0.39
838 0.36
839 0.39
840 0.38
841 0.35
842 0.3
843 0.26
844 0.24
845 0.27
846 0.22
847 0.17
848 0.16
849 0.16
850 0.2
851 0.2
852 0.19
853 0.19
854 0.18
855 0.15
856 0.14
857 0.15
858 0.11
859 0.11
860 0.1
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.09
866 0.1
867 0.1
868 0.15
869 0.17
870 0.19
871 0.2
872 0.21
873 0.2
874 0.2
875 0.24
876 0.19
877 0.19
878 0.17
879 0.15
880 0.14
881 0.13
882 0.12
883 0.08
884 0.08
885 0.07
886 0.07
887 0.11
888 0.12
889 0.15
890 0.19
891 0.2
892 0.22
893 0.25
894 0.26
895 0.24
896 0.29
897 0.35
898 0.31
899 0.33
900 0.31
901 0.3
902 0.31
903 0.28
904 0.24
905 0.16
906 0.16
907 0.13
908 0.14
909 0.11
910 0.09
911 0.08
912 0.07
913 0.06
914 0.05
915 0.05
916 0.04
917 0.04
918 0.04
919 0.04
920 0.04
921 0.04
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.04
930 0.04
931 0.04
932 0.04
933 0.09
934 0.09
935 0.11
936 0.11
937 0.11
938 0.11
939 0.15
940 0.16
941 0.13
942 0.18
943 0.18
944 0.2
945 0.2
946 0.2
947 0.19
948 0.19
949 0.18
950 0.13
951 0.13
952 0.11
953 0.11
954 0.11
955 0.09
956 0.08
957 0.09
958 0.1
959 0.1
960 0.11
961 0.12
962 0.15
963 0.15
964 0.14
965 0.14
966 0.13
967 0.12
968 0.12
969 0.18
970 0.17
971 0.2
972 0.22
973 0.24
974 0.28
975 0.3
976 0.33
977 0.28
978 0.27
979 0.25
980 0.23
981 0.24
982 0.19
983 0.17
984 0.13
985 0.11
986 0.11
987 0.11
988 0.1
989 0.07
990 0.07
991 0.07
992 0.07
993 0.09
994 0.13
995 0.18
996 0.19
997 0.22
998 0.29
999 0.3
1000 0.35
1001 0.4
1002 0.4
1003 0.42
1004 0.48
1005 0.5
1006 0.45
1007 0.5
1008 0.49
1009 0.5
1010 0.5
1011 0.46
1012 0.4
1013 0.37
1014 0.4
1015 0.35
1016 0.35
1017 0.32
1018 0.3
1019 0.3
1020 0.31
1021 0.31
1022 0.26
1023 0.23
1024 0.18
1025 0.14
1026 0.14
1027 0.11
1028 0.08
1029 0.06
1030 0.06
1031 0.06
1032 0.09
1033 0.1
1034 0.09
1035 0.09
1036 0.1
1037 0.11
1038 0.12
1039 0.14
1040 0.11
1041 0.15
1042 0.16
1043 0.15
1044 0.14
1045 0.16
1046 0.21
1047 0.23
1048 0.29
1049 0.31
1050 0.41
1051 0.47
1052 0.57
1053 0.61
1054 0.62
1055 0.69
1056 0.69
1057 0.7
1058 0.63
1059 0.59
1060 0.53
1061 0.46
1062 0.43
1063 0.35
1064 0.29
1065 0.22
1066 0.19
1067 0.16
1068 0.13
1069 0.14
1070 0.11
1071 0.13
1072 0.18
1073 0.23
1074 0.25
1075 0.3
1076 0.37
1077 0.39
1078 0.42
1079 0.48
1080 0.48
1081 0.51
1082 0.55
1083 0.56
1084 0.58
1085 0.57
1086 0.55
1087 0.52
1088 0.46
1089 0.42
1090 0.39
1091 0.34
1092 0.27
1093 0.27
1094 0.25
1095 0.21
1096 0.21
1097 0.17
1098 0.14
1099 0.14
1100 0.13
1101 0.11
1102 0.11
1103 0.11
1104 0.11
1105 0.16
1106 0.15
1107 0.14
1108 0.16
1109 0.17
1110 0.24
1111 0.3
1112 0.34
1113 0.33
1114 0.34
1115 0.35
1116 0.33
1117 0.31
1118 0.24
1119 0.19
1120 0.15
1121 0.13
1122 0.17
1123 0.19
1124 0.21
1125 0.21
1126 0.2
1127 0.2
1128 0.2
1129 0.21
1130 0.23
1131 0.26
1132 0.31
1133 0.38
1134 0.49
1135 0.5
1136 0.53
1137 0.54
1138 0.52
1139 0.53
1140 0.53
1141 0.55
1142 0.49
1143 0.53
1144 0.53
1145 0.55
1146 0.5
1147 0.49
1148 0.42
1149 0.35
1150 0.31
1151 0.27
1152 0.24
1153 0.2
1154 0.24
1155 0.25
1156 0.3
1157 0.3
1158 0.33
1159 0.32
1160 0.33
1161 0.37
1162 0.37
1163 0.35
1164 0.35
1165 0.32
1166 0.32
1167 0.32
1168 0.31
1169 0.25
1170 0.2
1171 0.19
1172 0.15
1173 0.22
1174 0.2
1175 0.2
1176 0.21
1177 0.24
1178 0.3
1179 0.29
1180 0.31
1181 0.33
1182 0.42
1183 0.5
1184 0.56
1185 0.63
1186 0.67
1187 0.76
1188 0.82
1189 0.83
1190 0.84
1191 0.83
1192 0.84
1193 0.79
1194 0.76
1195 0.73
1196 0.67
1197 0.61
1198 0.53
1199 0.47
1200 0.38
1201 0.35
1202 0.28
1203 0.22
1204 0.19
1205 0.16
1206 0.17
1207 0.16
1208 0.2
1209 0.24
1210 0.3
1211 0.37
1212 0.44
1213 0.52
1214 0.58
1215 0.59
1216 0.61
1217 0.63
1218 0.6
1219 0.56
1220 0.53
1221 0.47
1222 0.39
1223 0.36
1224 0.31
1225 0.27
1226 0.3
1227 0.28
1228 0.24
1229 0.24
1230 0.25
1231 0.34
1232 0.4
1233 0.38
1234 0.36
1235 0.37
1236 0.46
1237 0.53
1238 0.61
1239 0.61
1240 0.62
1241 0.68
1242 0.75
1243 0.81