Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HH84

Protein Details
Accession A0A139HH84    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40TKPPSSRSPASKKQLQQWQCHydrophilic
119-173IKDGKSDRRSRSRSPARRGDRRSHHYDERSQSPQDRDHRRSDRRNRSPPPSNGNNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-141KAKAIKDGKSDRRSRSRSPARRGDRRS
Subcellular Location(s) mito 18, extr 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MLPAVFCWINQSKLARPAILTKPPSSRSPASKKQLQQWQCGDNPCQKLTSGAGRRTRWMRDWYVGSLGPEFTRLAITHRKFFLSLLPLNNMDNAMLTAPFLAVVRKAQADEAALKAKAIKDGKSDRRSRSRSPARRGDRRSHHYDERSQSPQDRDHRRSDRRNRSPPPSNGNNYDSRDRGSARAPSSRNYEDRAPKGDMMKQVNESSQQDRRVYVGNLSYDVKWHHLKDHMRKDGTLDVLFADVLLLPNGMSKGCGIVEYATRDQAQTAINTLSNTPLMGRLVYVREDRETEPRFSQPQRGGMGGGYGGRGGFQGGQGSYGGGMGGATGGATGGARQIFVSNLPFQVGWQDLKDLFRQAGNVIRADVHLAPDGSPKGSGIVAFETPEDAQNAIQTFHGYDWQGRILEVREDRYAGSGPGFGGRGGFGGRGGFGARGGFGGGGYGGGGYGGGFGGRGGGFGGGYGRGGYGGGRGGFQSGDGGYGGGGGGYGGGNFGGGQAAASVPPNAFTDGVSSGGEQSTIIHVKNLPWSTSNEDLMELFTTIGEVVRAEIQYEPNGRSRGSGVVQFANEDFAGTAIEKFQGYSYGGRPLGLDFAKYPNDGNAMDAEPSGSMQEQMM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.39
3 0.37
4 0.43
5 0.47
6 0.52
7 0.5
8 0.47
9 0.52
10 0.54
11 0.57
12 0.56
13 0.55
14 0.56
15 0.62
16 0.67
17 0.67
18 0.73
19 0.75
20 0.77
21 0.8
22 0.77
23 0.76
24 0.73
25 0.71
26 0.67
27 0.67
28 0.63
29 0.61
30 0.6
31 0.52
32 0.46
33 0.39
34 0.36
35 0.35
36 0.4
37 0.4
38 0.42
39 0.49
40 0.5
41 0.58
42 0.61
43 0.63
44 0.6
45 0.59
46 0.57
47 0.55
48 0.57
49 0.53
50 0.51
51 0.46
52 0.41
53 0.35
54 0.3
55 0.23
56 0.2
57 0.18
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.17
62 0.26
63 0.29
64 0.34
65 0.36
66 0.37
67 0.36
68 0.36
69 0.37
70 0.34
71 0.35
72 0.32
73 0.34
74 0.33
75 0.33
76 0.33
77 0.27
78 0.2
79 0.15
80 0.12
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.09
91 0.11
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.18
99 0.2
100 0.18
101 0.18
102 0.2
103 0.2
104 0.24
105 0.25
106 0.24
107 0.29
108 0.39
109 0.49
110 0.56
111 0.63
112 0.65
113 0.73
114 0.77
115 0.76
116 0.77
117 0.78
118 0.79
119 0.81
120 0.82
121 0.82
122 0.85
123 0.85
124 0.84
125 0.83
126 0.81
127 0.8
128 0.77
129 0.76
130 0.72
131 0.74
132 0.69
133 0.66
134 0.62
135 0.58
136 0.56
137 0.51
138 0.53
139 0.54
140 0.58
141 0.56
142 0.62
143 0.68
144 0.72
145 0.79
146 0.82
147 0.84
148 0.85
149 0.9
150 0.88
151 0.87
152 0.87
153 0.84
154 0.81
155 0.79
156 0.73
157 0.69
158 0.65
159 0.62
160 0.56
161 0.53
162 0.46
163 0.39
164 0.36
165 0.32
166 0.3
167 0.28
168 0.3
169 0.29
170 0.35
171 0.35
172 0.36
173 0.41
174 0.44
175 0.42
176 0.39
177 0.43
178 0.43
179 0.46
180 0.47
181 0.43
182 0.4
183 0.41
184 0.41
185 0.4
186 0.37
187 0.36
188 0.34
189 0.32
190 0.31
191 0.32
192 0.3
193 0.29
194 0.3
195 0.32
196 0.3
197 0.3
198 0.3
199 0.3
200 0.27
201 0.25
202 0.23
203 0.19
204 0.2
205 0.21
206 0.19
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.26
214 0.34
215 0.42
216 0.51
217 0.55
218 0.53
219 0.52
220 0.52
221 0.49
222 0.43
223 0.33
224 0.23
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.11
229 0.07
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.12
247 0.13
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.13
252 0.14
253 0.13
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.15
275 0.16
276 0.23
277 0.25
278 0.25
279 0.26
280 0.27
281 0.31
282 0.3
283 0.35
284 0.29
285 0.31
286 0.3
287 0.28
288 0.26
289 0.21
290 0.2
291 0.14
292 0.11
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.03
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.1
334 0.11
335 0.09
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.12
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.15
353 0.14
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.17
394 0.17
395 0.19
396 0.17
397 0.18
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.13
402 0.12
403 0.1
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.02
433 0.03
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.02
438 0.02
439 0.02
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.05
469 0.06
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.06
489 0.07
490 0.06
491 0.08
492 0.09
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.12
497 0.12
498 0.14
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.08
505 0.08
506 0.12
507 0.14
508 0.14
509 0.15
510 0.16
511 0.18
512 0.27
513 0.28
514 0.25
515 0.24
516 0.28
517 0.32
518 0.35
519 0.35
520 0.28
521 0.26
522 0.25
523 0.24
524 0.21
525 0.15
526 0.1
527 0.08
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.06
532 0.05
533 0.06
534 0.09
535 0.09
536 0.1
537 0.12
538 0.14
539 0.19
540 0.23
541 0.24
542 0.27
543 0.29
544 0.28
545 0.28
546 0.28
547 0.28
548 0.27
549 0.29
550 0.26
551 0.29
552 0.29
553 0.29
554 0.27
555 0.24
556 0.21
557 0.17
558 0.13
559 0.09
560 0.1
561 0.09
562 0.1
563 0.08
564 0.1
565 0.09
566 0.1
567 0.1
568 0.12
569 0.14
570 0.17
571 0.19
572 0.25
573 0.25
574 0.25
575 0.25
576 0.23
577 0.28
578 0.25
579 0.24
580 0.18
581 0.23
582 0.26
583 0.26
584 0.26
585 0.22
586 0.25
587 0.24
588 0.23
589 0.21
590 0.2
591 0.2
592 0.19
593 0.16
594 0.13
595 0.13
596 0.13
597 0.1