Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HX44

Protein Details
Accession A0A139HX44    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-164QPSSTHIRSRNQRRYAQERHSHHydrophilic
832-871DGFHMVKKPRTNRNTYPHAVAKPPVTTPVRPRKARQDFNAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6, extr 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018834  DNA/RNA-bd_Est1-type  
IPR045153  Est1/Ebs1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10373  EST1_DNA_bind  
Amino Acid Sequences MNIAQADPSRHGHHSYQATSPVFAAFFATLGLIPRSSQPDYGSDVCESPRTSSSDNSWTNDRERQQLPLTSERHSSIPDRTTAEQIGRLCLDQERSLNSGRTSPRGRGMLAAASVIAPKRSASSELQRADVRKLASPCKLAKQPSSTHIRSRNQRRYAQERHSHVRVSSSENVQAAVERIEQGPVPRDSGYESKFPSRHNTIVPPRPLANQPPLSTVQDIQQTDTQKDEPTLGARDSCGGPDARTRSKYQGLILQPDSSPISEEQLAAEVKGIYAGLVIVEAKCINIDAAHAADPKSHLGPEQWQRLIALHRTLLYEHHDFLMATQHPSATAALRGLATKYSMPARMWKHGIHAFLEVLRHRRPDSQDYMLAFIYLAYQMMALLFETVPSFTDTWIECLGDLARYRMAIEEEKEAHATWGGVAARWYTMASDRHPAIGRLYHHLGILERPSLRKFCFYAKSLTCVIPFPNARDSLSTLCGPIVQDDQTIQSSRQSAEARIVTFHALVSTGRARSLVEEIGQDALHLLGQQLNKLRDFGAYLAVTNVAAVFDLGTPTNMLWQLYSAAITQAMQSSRPSVKLPIQADDVLSKLLPDTRPGPLTESTTGFFTDCFEFVLRQYNSPDFVRGCLGFVHITLVWIQSLHVLRTRLNSGSHHTLALPIDVGRLPWGALAEFLNTLASINPVSTYVLERARQGNFLGAEGKEDAQPLSEDYTIRGLIWGQFYFCPGWFDGQCEDDGRAIETNSMAQARVERVLWLGLYLAFHTEHLHYDVQKKVFSTSMGRNASTSESARPAAVAPVDVEMEQISEVVALSPRSGTSGTRSSTSSGSSVDGFHMVKKPRTNRNTYPHAVAKPPVTTPVRPRKARQDFNAVRVVDENASEWSMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.44
4 0.47
5 0.46
6 0.42
7 0.4
8 0.33
9 0.25
10 0.22
11 0.19
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.1
18 0.12
19 0.1
20 0.11
21 0.15
22 0.21
23 0.22
24 0.24
25 0.24
26 0.26
27 0.32
28 0.34
29 0.32
30 0.28
31 0.28
32 0.27
33 0.29
34 0.27
35 0.24
36 0.26
37 0.28
38 0.29
39 0.31
40 0.36
41 0.41
42 0.44
43 0.44
44 0.45
45 0.44
46 0.47
47 0.51
48 0.49
49 0.47
50 0.44
51 0.47
52 0.47
53 0.49
54 0.49
55 0.5
56 0.5
57 0.45
58 0.47
59 0.43
60 0.39
61 0.36
62 0.34
63 0.32
64 0.33
65 0.34
66 0.36
67 0.36
68 0.38
69 0.38
70 0.37
71 0.35
72 0.32
73 0.32
74 0.28
75 0.26
76 0.23
77 0.23
78 0.25
79 0.23
80 0.25
81 0.25
82 0.26
83 0.3
84 0.32
85 0.3
86 0.33
87 0.33
88 0.38
89 0.39
90 0.4
91 0.43
92 0.43
93 0.42
94 0.38
95 0.37
96 0.32
97 0.28
98 0.24
99 0.17
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.13
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.14
108 0.17
109 0.21
110 0.29
111 0.38
112 0.39
113 0.43
114 0.44
115 0.45
116 0.44
117 0.42
118 0.35
119 0.32
120 0.35
121 0.38
122 0.39
123 0.43
124 0.44
125 0.48
126 0.52
127 0.51
128 0.53
129 0.54
130 0.53
131 0.54
132 0.6
133 0.55
134 0.57
135 0.62
136 0.64
137 0.68
138 0.74
139 0.77
140 0.76
141 0.8
142 0.8
143 0.8
144 0.81
145 0.81
146 0.78
147 0.76
148 0.75
149 0.72
150 0.66
151 0.57
152 0.53
153 0.45
154 0.43
155 0.41
156 0.36
157 0.36
158 0.33
159 0.33
160 0.27
161 0.26
162 0.19
163 0.15
164 0.13
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.21
176 0.26
177 0.27
178 0.27
179 0.29
180 0.34
181 0.37
182 0.39
183 0.42
184 0.42
185 0.43
186 0.42
187 0.49
188 0.51
189 0.57
190 0.58
191 0.54
192 0.49
193 0.49
194 0.49
195 0.45
196 0.44
197 0.42
198 0.39
199 0.39
200 0.41
201 0.4
202 0.37
203 0.32
204 0.27
205 0.28
206 0.27
207 0.26
208 0.27
209 0.27
210 0.26
211 0.28
212 0.25
213 0.2
214 0.2
215 0.19
216 0.16
217 0.16
218 0.18
219 0.17
220 0.16
221 0.15
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.17
229 0.23
230 0.27
231 0.3
232 0.33
233 0.36
234 0.41
235 0.42
236 0.38
237 0.4
238 0.37
239 0.4
240 0.38
241 0.35
242 0.29
243 0.29
244 0.27
245 0.2
246 0.18
247 0.12
248 0.14
249 0.12
250 0.13
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.11
255 0.12
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.03
267 0.04
268 0.05
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.13
283 0.12
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.19
288 0.25
289 0.31
290 0.3
291 0.29
292 0.3
293 0.31
294 0.33
295 0.28
296 0.23
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.19
303 0.18
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.19
310 0.15
311 0.15
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.13
330 0.13
331 0.2
332 0.23
333 0.27
334 0.3
335 0.29
336 0.32
337 0.33
338 0.34
339 0.28
340 0.25
341 0.21
342 0.19
343 0.21
344 0.17
345 0.18
346 0.19
347 0.2
348 0.2
349 0.25
350 0.28
351 0.32
352 0.36
353 0.35
354 0.37
355 0.36
356 0.36
357 0.31
358 0.26
359 0.19
360 0.14
361 0.1
362 0.06
363 0.06
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.05
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.09
380 0.09
381 0.11
382 0.11
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.13
398 0.14
399 0.14
400 0.15
401 0.14
402 0.12
403 0.11
404 0.1
405 0.06
406 0.08
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.05
415 0.08
416 0.1
417 0.11
418 0.15
419 0.15
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.16
424 0.18
425 0.17
426 0.18
427 0.2
428 0.18
429 0.18
430 0.18
431 0.17
432 0.14
433 0.14
434 0.12
435 0.11
436 0.11
437 0.13
438 0.15
439 0.16
440 0.17
441 0.17
442 0.21
443 0.25
444 0.25
445 0.31
446 0.29
447 0.32
448 0.31
449 0.31
450 0.26
451 0.22
452 0.21
453 0.19
454 0.19
455 0.18
456 0.19
457 0.19
458 0.18
459 0.19
460 0.2
461 0.16
462 0.18
463 0.16
464 0.13
465 0.12
466 0.12
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.08
471 0.07
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.12
479 0.12
480 0.16
481 0.16
482 0.15
483 0.19
484 0.21
485 0.19
486 0.18
487 0.18
488 0.14
489 0.13
490 0.12
491 0.08
492 0.07
493 0.06
494 0.08
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.12
502 0.11
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.08
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.07
515 0.07
516 0.09
517 0.14
518 0.16
519 0.16
520 0.17
521 0.17
522 0.14
523 0.15
524 0.13
525 0.13
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.04
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.13
561 0.14
562 0.16
563 0.17
564 0.17
565 0.22
566 0.28
567 0.29
568 0.28
569 0.29
570 0.28
571 0.28
572 0.25
573 0.2
574 0.14
575 0.12
576 0.09
577 0.07
578 0.1
579 0.1
580 0.11
581 0.14
582 0.16
583 0.18
584 0.19
585 0.22
586 0.2
587 0.23
588 0.23
589 0.22
590 0.2
591 0.19
592 0.19
593 0.16
594 0.14
595 0.12
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.11
602 0.2
603 0.19
604 0.19
605 0.23
606 0.23
607 0.25
608 0.25
609 0.28
610 0.19
611 0.2
612 0.21
613 0.18
614 0.17
615 0.14
616 0.15
617 0.12
618 0.12
619 0.13
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.1
628 0.11
629 0.12
630 0.15
631 0.16
632 0.18
633 0.21
634 0.24
635 0.22
636 0.23
637 0.24
638 0.27
639 0.32
640 0.32
641 0.29
642 0.26
643 0.26
644 0.24
645 0.22
646 0.16
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.06
666 0.07
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.07
672 0.08
673 0.1
674 0.13
675 0.17
676 0.18
677 0.21
678 0.24
679 0.25
680 0.26
681 0.24
682 0.25
683 0.21
684 0.21
685 0.21
686 0.17
687 0.17
688 0.17
689 0.18
690 0.14
691 0.14
692 0.13
693 0.11
694 0.11
695 0.11
696 0.12
697 0.13
698 0.12
699 0.13
700 0.16
701 0.15
702 0.14
703 0.14
704 0.12
705 0.13
706 0.16
707 0.15
708 0.14
709 0.14
710 0.16
711 0.17
712 0.17
713 0.17
714 0.14
715 0.19
716 0.17
717 0.2
718 0.2
719 0.2
720 0.2
721 0.19
722 0.2
723 0.16
724 0.16
725 0.15
726 0.14
727 0.13
728 0.13
729 0.12
730 0.12
731 0.13
732 0.13
733 0.11
734 0.11
735 0.13
736 0.15
737 0.16
738 0.16
739 0.14
740 0.14
741 0.15
742 0.14
743 0.12
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.09
751 0.11
752 0.11
753 0.13
754 0.15
755 0.18
756 0.19
757 0.25
758 0.31
759 0.32
760 0.33
761 0.32
762 0.3
763 0.29
764 0.29
765 0.3
766 0.31
767 0.38
768 0.39
769 0.39
770 0.37
771 0.37
772 0.38
773 0.35
774 0.3
775 0.24
776 0.24
777 0.24
778 0.24
779 0.23
780 0.2
781 0.19
782 0.18
783 0.15
784 0.12
785 0.12
786 0.13
787 0.12
788 0.12
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.07
793 0.06
794 0.05
795 0.05
796 0.06
797 0.08
798 0.08
799 0.08
800 0.09
801 0.09
802 0.11
803 0.12
804 0.12
805 0.17
806 0.23
807 0.25
808 0.26
809 0.28
810 0.28
811 0.29
812 0.3
813 0.25
814 0.2
815 0.2
816 0.18
817 0.18
818 0.17
819 0.19
820 0.17
821 0.2
822 0.26
823 0.3
824 0.35
825 0.43
826 0.51
827 0.58
828 0.66
829 0.72
830 0.75
831 0.78
832 0.81
833 0.77
834 0.76
835 0.73
836 0.68
837 0.63
838 0.58
839 0.52
840 0.46
841 0.43
842 0.43
843 0.4
844 0.42
845 0.48
846 0.55
847 0.61
848 0.64
849 0.7
850 0.73
851 0.79
852 0.83
853 0.79
854 0.79
855 0.76
856 0.75
857 0.76
858 0.65
859 0.55
860 0.47
861 0.43
862 0.32
863 0.27
864 0.22
865 0.17