Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A139HLY8

Protein Details
Accession A0A139HLY8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
169-190VYSKAKYLLRKRQKYLKRFTVLHydrophilic
392-418TWKSGKRGTYFKKRRRWERCKAIVDETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
403-406KKRR
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 12.333, cyto 6, cyto_nucl 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MKVANMSAQHAHVRPNTYLFLRLPTETLRLIEIKLNTIIEVGKLGSFPSNLLLGRPYYHTYELLERREGELYSRLRIVPQSELNAEAGIEHATPSESTGEPATPEGALPEGYNLAAEDATLKTNQMTIDDASRQTLSHAEIEELKRSAAGKEVIEKILASHVGLDEKTVYSKAKYLLRKRQKYLKRFTVLPMDMGNLIEFMMEKDAPRIMEMREESLGLVTAWSNVHLSGADPLGLVGKERDTPCGRWLAVDDTGGLLVAAIAERMGILHPPLPSTTQSVPLPEAEAGAATEDSHDPPQANGTAKPKPPSHRDFPTPASSNSITLLHAAVQPNASILKYFGYDTSNPTVVGEDQEHPLHTHLKPLSWLQLLHPEEDPLYVEPERVSDETLATWKSGKRGTYFKKRRRWERCKAIVDETRSGGFDGLVIATHMHHTAILENLVPLIRGGGHVVIYSPAIEPLVNTIDLFSKDRRTAYINHISKGETPGKEDFPMDPRLLLAASIQTSRIRNWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYIFTARRSIPLEGNVEAKGNFSSKKRKLAAIQDGVAENAAKLGVSAEPVKALIDVAEDAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.38
4 0.35
5 0.38
6 0.33
7 0.34
8 0.32
9 0.31
10 0.3
11 0.28
12 0.3
13 0.26
14 0.26
15 0.24
16 0.22
17 0.23
18 0.26
19 0.24
20 0.24
21 0.25
22 0.24
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.14
27 0.14
28 0.12
29 0.1
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.15
37 0.14
38 0.15
39 0.16
40 0.15
41 0.17
42 0.21
43 0.22
44 0.23
45 0.25
46 0.25
47 0.26
48 0.34
49 0.39
50 0.39
51 0.4
52 0.37
53 0.37
54 0.38
55 0.35
56 0.29
57 0.3
58 0.28
59 0.28
60 0.29
61 0.27
62 0.27
63 0.29
64 0.29
65 0.28
66 0.29
67 0.3
68 0.28
69 0.3
70 0.28
71 0.25
72 0.22
73 0.16
74 0.12
75 0.09
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.11
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.13
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.12
114 0.11
115 0.15
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.17
121 0.16
122 0.17
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.2
128 0.22
129 0.24
130 0.23
131 0.2
132 0.19
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.18
137 0.15
138 0.2
139 0.24
140 0.23
141 0.22
142 0.22
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.11
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.14
159 0.19
160 0.25
161 0.33
162 0.42
163 0.51
164 0.61
165 0.69
166 0.72
167 0.78
168 0.8
169 0.81
170 0.81
171 0.8
172 0.74
173 0.68
174 0.65
175 0.65
176 0.56
177 0.48
178 0.38
179 0.29
180 0.24
181 0.22
182 0.19
183 0.09
184 0.08
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.09
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.08
206 0.07
207 0.05
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.06
226 0.11
227 0.11
228 0.17
229 0.19
230 0.2
231 0.22
232 0.26
233 0.25
234 0.21
235 0.22
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.14
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.1
262 0.14
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.18
268 0.16
269 0.16
270 0.12
271 0.11
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.03
278 0.04
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.17
290 0.22
291 0.24
292 0.29
293 0.32
294 0.35
295 0.41
296 0.45
297 0.47
298 0.47
299 0.49
300 0.49
301 0.49
302 0.5
303 0.45
304 0.39
305 0.37
306 0.33
307 0.28
308 0.25
309 0.22
310 0.15
311 0.13
312 0.12
313 0.08
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.1
329 0.11
330 0.14
331 0.17
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.13
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.17
346 0.15
347 0.2
348 0.19
349 0.19
350 0.2
351 0.21
352 0.24
353 0.21
354 0.21
355 0.16
356 0.24
357 0.25
358 0.24
359 0.23
360 0.19
361 0.18
362 0.18
363 0.18
364 0.09
365 0.12
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.12
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.13
377 0.12
378 0.1
379 0.12
380 0.12
381 0.16
382 0.18
383 0.2
384 0.22
385 0.31
386 0.4
387 0.49
388 0.59
389 0.64
390 0.71
391 0.79
392 0.86
393 0.88
394 0.89
395 0.88
396 0.89
397 0.89
398 0.87
399 0.81
400 0.79
401 0.74
402 0.69
403 0.61
404 0.51
405 0.41
406 0.34
407 0.3
408 0.22
409 0.16
410 0.1
411 0.08
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.08
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.15
454 0.17
455 0.17
456 0.21
457 0.23
458 0.24
459 0.26
460 0.27
461 0.3
462 0.36
463 0.44
464 0.42
465 0.41
466 0.41
467 0.41
468 0.4
469 0.41
470 0.4
471 0.3
472 0.3
473 0.33
474 0.34
475 0.34
476 0.33
477 0.29
478 0.26
479 0.3
480 0.26
481 0.22
482 0.2
483 0.2
484 0.18
485 0.15
486 0.12
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.13
491 0.16
492 0.18
493 0.2
494 0.27
495 0.27
496 0.29
497 0.31
498 0.39
499 0.43
500 0.47
501 0.51
502 0.48
503 0.5
504 0.48
505 0.46
506 0.38
507 0.35
508 0.32
509 0.29
510 0.28
511 0.22
512 0.23
513 0.23
514 0.21
515 0.16
516 0.13
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.12
521 0.16
522 0.16
523 0.19
524 0.22
525 0.24
526 0.24
527 0.29
528 0.32
529 0.3
530 0.32
531 0.3
532 0.28
533 0.24
534 0.22
535 0.18
536 0.17
537 0.2
538 0.25
539 0.35
540 0.4
541 0.5
542 0.53
543 0.58
544 0.62
545 0.68
546 0.72
547 0.69
548 0.64
549 0.57
550 0.54
551 0.48
552 0.4
553 0.3
554 0.19
555 0.12
556 0.1
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.06
561 0.09
562 0.11
563 0.11
564 0.12
565 0.13
566 0.13
567 0.12
568 0.12
569 0.09
570 0.09