Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HJW9

Protein Details
Accession A0A139HJW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-322SSIPPDPPKKRGGRKRKAETQAEPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-314PPKKRGGRKRK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 4, cyto 3, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
IPR019006  Sre1_C  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032933  P:SREBP signaling pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF09427  DUF2014  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11399  bHLHzip_scHMS1_like  
Amino Acid Sequences MQIVDPKTGKHHAQHCHHASHARVPAGWEEASDIVWFDFVTRKLGETSSTDRLFLLKYNAVKGQHWSNLCHLNISPGWQRALVETEAKLDLTFQLADTRRRDSKMDTSWQGAAGYSQQQSAPFPGQLDGGANNEDWEEWLRWDPAAEPISPDDTFNSGSSKNDSPIQDLAFDAPFGKTDGEPLAPLHIVGNDSLDFGASHDFNTDFALFGNADLNAGFAFDQDGSIDNLVSSIPKLDTNTAAWAPPSTGLEEPNASLSAISNENFQQLHSATSLTATTPSLHQSPQSSSGTQNRRSLSSIPPDPPKKRGGRKRKAETQAEPSPEGLENGDSQDGDEPPIKKTSHNVIEKRYRNNLNDKIVELRNAVPSLRAMGRANSGKETEDLEGLTPAHKLNKATVMAKATEYIRHLEKRNHKMQEEMNALKAQLEKVETTFGNSRDRQESNSPTSAAQRSREASSASQGAVPSFLNVPQDQNRFGQPVVQQQYMQQQRGPTYARPPNPPAEAQNQQPHVNGRGGIMNKVMLGTMAGVMVMEGFGQEQSGDNSSARQLFSVPTALLKRALDGSAHSSSAAISRQAAIPLLKLFLVVGALFYLLAPFLMWAPRRKQKICSSVQLPKAPSLASPVEVRRQAWLTAIQSVWVPKHFLLEVVAVGFKMLQLSIRRLVGAEIFTHITGTSKEEEAARVKAWDIAIDAQLAGGDAQVSYYRLLLTLMESGTLPDSPARLMQKAVHFRVFFWEIANAGYGNILGFKSFTENVGRIYWDSARRIQKELIHAKSQGRPSEEDEVELLPDHLAQLVELDCDEVLSDEMIQRAWNLAWNKPSANELAPNAAKDSVVEDHAIRSPLDAVAAWYTNTTIDDTLADALSDTASTMDTEYYLGLALSVAPPASSTHIRALTAKAVLSNTNREANIVVAVEALPVICPTGGMNLVSHAPASPDVFTALTLAKLISLCSPSSPKAARSRAFAALNNMSLPPAQFSLLTAVAAYRLLRLLISNQGRSNDARVGLEDLAGSLRLWAGTQAGRDSGLGQHGRAKMVKLCLVIAKQLGGWEEKDSGYSSARSASSSPVREGIVIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.68
3 0.66
4 0.65
5 0.63
6 0.58
7 0.57
8 0.55
9 0.47
10 0.42
11 0.39
12 0.38
13 0.36
14 0.32
15 0.24
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.16
20 0.14
21 0.09
22 0.1
23 0.09
24 0.08
25 0.13
26 0.13
27 0.17
28 0.17
29 0.19
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.24
34 0.29
35 0.34
36 0.34
37 0.33
38 0.31
39 0.32
40 0.3
41 0.28
42 0.27
43 0.24
44 0.26
45 0.3
46 0.34
47 0.36
48 0.36
49 0.38
50 0.39
51 0.41
52 0.41
53 0.4
54 0.41
55 0.46
56 0.44
57 0.42
58 0.35
59 0.34
60 0.32
61 0.34
62 0.35
63 0.3
64 0.32
65 0.3
66 0.3
67 0.26
68 0.3
69 0.26
70 0.23
71 0.2
72 0.22
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.15
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.1
81 0.17
82 0.21
83 0.28
84 0.31
85 0.37
86 0.4
87 0.42
88 0.45
89 0.43
90 0.49
91 0.5
92 0.56
93 0.53
94 0.52
95 0.5
96 0.49
97 0.43
98 0.33
99 0.26
100 0.2
101 0.21
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.23
108 0.23
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.12
125 0.13
126 0.16
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.2
132 0.21
133 0.2
134 0.19
135 0.2
136 0.24
137 0.24
138 0.23
139 0.18
140 0.18
141 0.19
142 0.18
143 0.19
144 0.16
145 0.17
146 0.22
147 0.23
148 0.23
149 0.27
150 0.27
151 0.28
152 0.3
153 0.3
154 0.25
155 0.24
156 0.24
157 0.18
158 0.17
159 0.14
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.09
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.14
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.12
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.13
191 0.12
192 0.09
193 0.09
194 0.11
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.09
222 0.11
223 0.13
224 0.15
225 0.16
226 0.2
227 0.19
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.14
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.13
267 0.14
268 0.14
269 0.16
270 0.17
271 0.2
272 0.25
273 0.27
274 0.25
275 0.27
276 0.36
277 0.42
278 0.45
279 0.47
280 0.43
281 0.42
282 0.44
283 0.43
284 0.4
285 0.4
286 0.4
287 0.39
288 0.47
289 0.53
290 0.54
291 0.55
292 0.58
293 0.59
294 0.63
295 0.7
296 0.72
297 0.74
298 0.81
299 0.87
300 0.88
301 0.88
302 0.86
303 0.81
304 0.78
305 0.74
306 0.67
307 0.58
308 0.48
309 0.41
310 0.33
311 0.27
312 0.19
313 0.13
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.21
326 0.21
327 0.19
328 0.23
329 0.3
330 0.36
331 0.43
332 0.46
333 0.5
334 0.59
335 0.64
336 0.66
337 0.65
338 0.62
339 0.59
340 0.64
341 0.63
342 0.6
343 0.55
344 0.51
345 0.48
346 0.42
347 0.39
348 0.31
349 0.26
350 0.22
351 0.21
352 0.19
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.19
361 0.22
362 0.23
363 0.22
364 0.22
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.16
369 0.13
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.1
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.19
382 0.21
383 0.21
384 0.23
385 0.23
386 0.22
387 0.21
388 0.22
389 0.17
390 0.17
391 0.17
392 0.17
393 0.19
394 0.22
395 0.26
396 0.32
397 0.41
398 0.48
399 0.55
400 0.58
401 0.54
402 0.54
403 0.53
404 0.54
405 0.5
406 0.43
407 0.36
408 0.31
409 0.31
410 0.27
411 0.25
412 0.17
413 0.11
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.13
418 0.11
419 0.14
420 0.17
421 0.18
422 0.23
423 0.24
424 0.26
425 0.28
426 0.29
427 0.3
428 0.32
429 0.36
430 0.35
431 0.35
432 0.33
433 0.29
434 0.32
435 0.33
436 0.3
437 0.26
438 0.24
439 0.24
440 0.25
441 0.26
442 0.23
443 0.2
444 0.2
445 0.19
446 0.16
447 0.15
448 0.13
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.12
458 0.16
459 0.18
460 0.19
461 0.2
462 0.21
463 0.2
464 0.2
465 0.21
466 0.18
467 0.24
468 0.26
469 0.26
470 0.25
471 0.25
472 0.34
473 0.34
474 0.33
475 0.26
476 0.24
477 0.24
478 0.27
479 0.28
480 0.21
481 0.25
482 0.31
483 0.33
484 0.36
485 0.38
486 0.38
487 0.38
488 0.38
489 0.33
490 0.32
491 0.31
492 0.3
493 0.33
494 0.32
495 0.3
496 0.3
497 0.29
498 0.25
499 0.23
500 0.19
501 0.14
502 0.16
503 0.15
504 0.15
505 0.13
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.03
514 0.03
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.02
526 0.03
527 0.04
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.08
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.09
539 0.1
540 0.08
541 0.09
542 0.1
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.09
550 0.09
551 0.13
552 0.12
553 0.13
554 0.12
555 0.11
556 0.11
557 0.12
558 0.12
559 0.07
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.09
565 0.07
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.04
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.02
582 0.02
583 0.02
584 0.02
585 0.03
586 0.06
587 0.09
588 0.13
589 0.19
590 0.25
591 0.32
592 0.34
593 0.41
594 0.47
595 0.54
596 0.55
597 0.56
598 0.55
599 0.56
600 0.6
601 0.57
602 0.5
603 0.42
604 0.38
605 0.31
606 0.25
607 0.22
608 0.17
609 0.14
610 0.16
611 0.16
612 0.2
613 0.21
614 0.21
615 0.19
616 0.2
617 0.19
618 0.18
619 0.19
620 0.15
621 0.16
622 0.16
623 0.14
624 0.13
625 0.14
626 0.14
627 0.11
628 0.12
629 0.09
630 0.12
631 0.11
632 0.11
633 0.11
634 0.1
635 0.1
636 0.09
637 0.08
638 0.06
639 0.06
640 0.06
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.06
645 0.08
646 0.11
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.14
651 0.15
652 0.13
653 0.12
654 0.1
655 0.09
656 0.1
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.08
661 0.08
662 0.1
663 0.1
664 0.09
665 0.1
666 0.11
667 0.13
668 0.15
669 0.16
670 0.14
671 0.13
672 0.13
673 0.15
674 0.14
675 0.12
676 0.11
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.09
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.05
685 0.03
686 0.03
687 0.03
688 0.03
689 0.04
690 0.05
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.07
698 0.08
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.07
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.11
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.18
714 0.25
715 0.32
716 0.35
717 0.37
718 0.35
719 0.34
720 0.39
721 0.37
722 0.3
723 0.23
724 0.21
725 0.15
726 0.15
727 0.16
728 0.1
729 0.07
730 0.07
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.04
736 0.05
737 0.05
738 0.08
739 0.09
740 0.1
741 0.13
742 0.14
743 0.16
744 0.17
745 0.17
746 0.15
747 0.17
748 0.2
749 0.21
750 0.23
751 0.28
752 0.36
753 0.37
754 0.4
755 0.41
756 0.41
757 0.47
758 0.52
759 0.49
760 0.45
761 0.46
762 0.47
763 0.49
764 0.51
765 0.45
766 0.39
767 0.37
768 0.38
769 0.43
770 0.39
771 0.34
772 0.29
773 0.25
774 0.22
775 0.2
776 0.16
777 0.07
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.06
786 0.06
787 0.06
788 0.05
789 0.05
790 0.05
791 0.05
792 0.05
793 0.05
794 0.05
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.07
799 0.06
800 0.08
801 0.08
802 0.13
803 0.14
804 0.18
805 0.21
806 0.24
807 0.24
808 0.24
809 0.26
810 0.22
811 0.22
812 0.22
813 0.19
814 0.24
815 0.24
816 0.23
817 0.23
818 0.21
819 0.19
820 0.15
821 0.17
822 0.12
823 0.12
824 0.13
825 0.12
826 0.14
827 0.16
828 0.17
829 0.14
830 0.13
831 0.13
832 0.12
833 0.12
834 0.1
835 0.09
836 0.1
837 0.11
838 0.1
839 0.09
840 0.1
841 0.1
842 0.1
843 0.1
844 0.08
845 0.08
846 0.08
847 0.09
848 0.1
849 0.09
850 0.08
851 0.07
852 0.07
853 0.06
854 0.06
855 0.05
856 0.04
857 0.05
858 0.05
859 0.06
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.05
867 0.05
868 0.04
869 0.05
870 0.05
871 0.05
872 0.05
873 0.05
874 0.05
875 0.07
876 0.11
877 0.13
878 0.15
879 0.2
880 0.22
881 0.24
882 0.25
883 0.26
884 0.26
885 0.25
886 0.23
887 0.19
888 0.19
889 0.22
890 0.24
891 0.27
892 0.26
893 0.3
894 0.29
895 0.28
896 0.27
897 0.24
898 0.22
899 0.17
900 0.13
901 0.09
902 0.09
903 0.08
904 0.08
905 0.07
906 0.05
907 0.04
908 0.05
909 0.04
910 0.04
911 0.05
912 0.07
913 0.08
914 0.09
915 0.09
916 0.1
917 0.12
918 0.12
919 0.11
920 0.09
921 0.1
922 0.11
923 0.12
924 0.11
925 0.11
926 0.12
927 0.12
928 0.12
929 0.12
930 0.11
931 0.1
932 0.09
933 0.09
934 0.09
935 0.09
936 0.1
937 0.11
938 0.12
939 0.12
940 0.15
941 0.2
942 0.2
943 0.27
944 0.29
945 0.33
946 0.41
947 0.49
948 0.49
949 0.51
950 0.54
951 0.53
952 0.54
953 0.5
954 0.48
955 0.43
956 0.41
957 0.36
958 0.31
959 0.25
960 0.22
961 0.2
962 0.15
963 0.12
964 0.12
965 0.11
966 0.12
967 0.15
968 0.15
969 0.14
970 0.12
971 0.11
972 0.11
973 0.12
974 0.11
975 0.08
976 0.08
977 0.08
978 0.09
979 0.1
980 0.12
981 0.2
982 0.26
983 0.29
984 0.32
985 0.33
986 0.36
987 0.37
988 0.38
989 0.33
990 0.29
991 0.26
992 0.24
993 0.26
994 0.24
995 0.22
996 0.18
997 0.14
998 0.13
999 0.12
1000 0.11
1001 0.07
1002 0.07
1003 0.07
1004 0.07
1005 0.07
1006 0.1
1007 0.12
1008 0.14
1009 0.15
1010 0.16
1011 0.16
1012 0.16
1013 0.17
1014 0.17
1015 0.22
1016 0.21
1017 0.21
1018 0.27
1019 0.28
1020 0.32
1021 0.33
1022 0.34
1023 0.31
1024 0.36
1025 0.39
1026 0.33
1027 0.33
1028 0.35
1029 0.34
1030 0.34
1031 0.3
1032 0.25
1033 0.22
1034 0.23
1035 0.23
1036 0.2
1037 0.19
1038 0.18
1039 0.2
1040 0.19
1041 0.2
1042 0.2
1043 0.2
1044 0.21
1045 0.2
1046 0.19
1047 0.21
1048 0.22
1049 0.22
1050 0.21
1051 0.27
1052 0.32
1053 0.35
1054 0.36
1055 0.34
1056 0.34