Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HK47

Protein Details
Accession A0A139HK47    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
469-488REGDRERQIRRQRRETARFTBasic
519-545EDERMGRGERSKKKRRFRSLSPVGRETBasic
706-725VTEPRERKRLQNIINGRKYRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
524-536GRGERSKKKRRFR
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MSAVNANRVNAPQAFVSSYAPRIRTYGNSLLTPVVPQTILPPVRTTKRGTTAINYAEEFDDDSIDDSDAPSRRATGLRTAQQRSQPDPLVEKAKELGKEVYAPVDVQGIWRDWMGKPKRTLTERQMHVQSALPTNLIPIKIDLDVAPFRPEAALPTPGNAKDFGIDENLPAYKAPEPTPPYRLKDTFLWNLHEALITPDMFAKTFVDELDFPVMRKQAMINEIAQAIRMQLEEHSSVALHPLFQPETANPPAPTTNAPTPSMRPAVSREDSSTPMQMDTPSNRFLELPHTNGDHVSSDAPTPAANGTSTPAIGATAHPLPRDPLTSSALNPADSHRCVITLSINLQNRLYTDKFEWSLLHPPGFPEIFAKQTCADLGLPGEWVPMMAHAIYEASLRLKKDMIDNNGTLAGVVGSGVDGWGVVENEACEYHGTAESALGVGAGWRFDEDGLGADWEPKIEVLSKEEIEKREGDRERQIRRQRRETARFTTTYNLPTQQSSTYGDYFSGGLGVSQANGGGEDERMGRGERSKKKRRFRSLSPVGRETPEAAGFGGTSYNLSEGERQYWTCSHCNVWGAAIWGVRDGPAGPRTLCNNCGLLYERDKRLPPWNYRLFALEKNQGSREAHVPQYAQAPPRQPTHLQSDIASFPVSTPVQPTPIRPQQSELNPSSHLYTGASSGGQGQISATTMADIINYAEPGEDLDWTKVTEPRERKRLQNIINGRKYRERRLAAEGHSGSGGNYPGATGVGSYLSTGYGQRQSMSQGGGDPGPSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.23
4 0.21
5 0.26
6 0.3
7 0.3
8 0.29
9 0.3
10 0.32
11 0.33
12 0.38
13 0.4
14 0.38
15 0.38
16 0.38
17 0.37
18 0.34
19 0.31
20 0.24
21 0.18
22 0.14
23 0.13
24 0.14
25 0.21
26 0.23
27 0.23
28 0.27
29 0.32
30 0.38
31 0.42
32 0.46
33 0.45
34 0.5
35 0.55
36 0.54
37 0.52
38 0.54
39 0.54
40 0.52
41 0.44
42 0.38
43 0.33
44 0.3
45 0.26
46 0.18
47 0.14
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.15
55 0.16
56 0.18
57 0.16
58 0.17
59 0.19
60 0.22
61 0.24
62 0.28
63 0.35
64 0.41
65 0.5
66 0.53
67 0.56
68 0.61
69 0.64
70 0.6
71 0.58
72 0.54
73 0.49
74 0.49
75 0.48
76 0.49
77 0.44
78 0.4
79 0.37
80 0.37
81 0.35
82 0.34
83 0.31
84 0.24
85 0.27
86 0.26
87 0.25
88 0.21
89 0.19
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.15
100 0.26
101 0.31
102 0.36
103 0.4
104 0.47
105 0.55
106 0.58
107 0.65
108 0.65
109 0.67
110 0.65
111 0.66
112 0.63
113 0.56
114 0.52
115 0.47
116 0.42
117 0.36
118 0.32
119 0.25
120 0.21
121 0.22
122 0.23
123 0.19
124 0.16
125 0.12
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.12
130 0.14
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.14
139 0.16
140 0.21
141 0.18
142 0.21
143 0.25
144 0.25
145 0.26
146 0.23
147 0.2
148 0.15
149 0.16
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.17
162 0.23
163 0.28
164 0.32
165 0.39
166 0.44
167 0.45
168 0.5
169 0.5
170 0.46
171 0.46
172 0.49
173 0.5
174 0.47
175 0.47
176 0.4
177 0.4
178 0.36
179 0.31
180 0.24
181 0.18
182 0.17
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.11
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.17
197 0.16
198 0.16
199 0.18
200 0.19
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.17
206 0.18
207 0.16
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.16
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.11
233 0.17
234 0.19
235 0.21
236 0.18
237 0.2
238 0.2
239 0.2
240 0.21
241 0.21
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.25
246 0.27
247 0.3
248 0.31
249 0.26
250 0.22
251 0.23
252 0.28
253 0.29
254 0.28
255 0.27
256 0.27
257 0.3
258 0.3
259 0.28
260 0.21
261 0.19
262 0.18
263 0.17
264 0.17
265 0.18
266 0.2
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.19
272 0.23
273 0.22
274 0.21
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.21
279 0.22
280 0.14
281 0.12
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.22
315 0.22
316 0.2
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.1
328 0.12
329 0.17
330 0.18
331 0.19
332 0.19
333 0.19
334 0.17
335 0.2
336 0.18
337 0.14
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.18
343 0.16
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.18
348 0.17
349 0.19
350 0.18
351 0.16
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.1
362 0.07
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.03
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.16
387 0.21
388 0.24
389 0.26
390 0.26
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.18
395 0.13
396 0.08
397 0.04
398 0.04
399 0.03
400 0.02
401 0.02
402 0.02
403 0.02
404 0.02
405 0.02
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.04
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.07
446 0.08
447 0.1
448 0.13
449 0.13
450 0.17
451 0.21
452 0.21
453 0.21
454 0.23
455 0.22
456 0.28
457 0.3
458 0.3
459 0.35
460 0.42
461 0.47
462 0.54
463 0.63
464 0.64
465 0.7
466 0.75
467 0.76
468 0.79
469 0.81
470 0.79
471 0.76
472 0.71
473 0.64
474 0.57
475 0.51
476 0.43
477 0.37
478 0.32
479 0.28
480 0.23
481 0.23
482 0.23
483 0.19
484 0.18
485 0.19
486 0.2
487 0.18
488 0.17
489 0.16
490 0.16
491 0.15
492 0.12
493 0.09
494 0.06
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.04
505 0.04
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.15
513 0.25
514 0.34
515 0.44
516 0.55
517 0.64
518 0.74
519 0.83
520 0.88
521 0.87
522 0.86
523 0.87
524 0.87
525 0.87
526 0.83
527 0.77
528 0.68
529 0.6
530 0.52
531 0.42
532 0.34
533 0.25
534 0.19
535 0.14
536 0.12
537 0.1
538 0.1
539 0.08
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.06
545 0.07
546 0.1
547 0.11
548 0.14
549 0.15
550 0.16
551 0.18
552 0.21
553 0.24
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.25
558 0.26
559 0.24
560 0.21
561 0.18
562 0.17
563 0.17
564 0.16
565 0.13
566 0.12
567 0.11
568 0.1
569 0.1
570 0.08
571 0.11
572 0.12
573 0.14
574 0.14
575 0.17
576 0.22
577 0.25
578 0.26
579 0.24
580 0.24
581 0.22
582 0.24
583 0.25
584 0.24
585 0.29
586 0.34
587 0.35
588 0.39
589 0.4
590 0.41
591 0.47
592 0.51
593 0.51
594 0.55
595 0.59
596 0.57
597 0.56
598 0.57
599 0.51
600 0.47
601 0.45
602 0.43
603 0.38
604 0.39
605 0.4
606 0.4
607 0.37
608 0.36
609 0.35
610 0.31
611 0.31
612 0.3
613 0.29
614 0.26
615 0.31
616 0.31
617 0.3
618 0.29
619 0.32
620 0.34
621 0.37
622 0.4
623 0.37
624 0.38
625 0.43
626 0.44
627 0.4
628 0.37
629 0.36
630 0.33
631 0.31
632 0.27
633 0.18
634 0.13
635 0.17
636 0.17
637 0.13
638 0.17
639 0.17
640 0.23
641 0.24
642 0.28
643 0.32
644 0.4
645 0.45
646 0.42
647 0.45
648 0.47
649 0.54
650 0.57
651 0.51
652 0.45
653 0.42
654 0.42
655 0.4
656 0.33
657 0.26
658 0.19
659 0.16
660 0.14
661 0.14
662 0.13
663 0.1
664 0.11
665 0.12
666 0.11
667 0.1
668 0.09
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.09
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.1
687 0.1
688 0.12
689 0.13
690 0.14
691 0.17
692 0.18
693 0.22
694 0.29
695 0.37
696 0.45
697 0.54
698 0.58
699 0.64
700 0.71
701 0.77
702 0.75
703 0.76
704 0.77
705 0.78
706 0.83
707 0.8
708 0.75
709 0.75
710 0.74
711 0.74
712 0.73
713 0.68
714 0.63
715 0.67
716 0.69
717 0.63
718 0.66
719 0.57
720 0.49
721 0.43
722 0.38
723 0.31
724 0.26
725 0.22
726 0.12
727 0.11
728 0.1
729 0.09
730 0.1
731 0.09
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.07
737 0.07
738 0.08
739 0.09
740 0.1
741 0.14
742 0.18
743 0.19
744 0.2
745 0.21
746 0.24
747 0.26
748 0.27
749 0.23
750 0.2
751 0.22
752 0.22