Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HPN4

Protein Details
Accession A0A139HPN4    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-27SSSSASASARPPRRRRDEYEQDTEIHydrophilic
263-287SEWHDQLKTMRKKQREKQAENQDLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
335-348RRIEAKERRKAAEK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038729  Rad50/SbcC_AAA  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13476  AAA_23  
Amino Acid Sequences MSSSSSASASARPPRRRRDEYEQDTEITAYESATGSPASKRRRRDEGISDDNDDNDDESQHSPLLPDSYRRSPKGKGRAIDAYSVSDASQEHKPGAIVRVTMKTFVTYTHAEFLPGPNLNMIIGPNGTGKSTLVCAICLGLGWKPEHLGRAKDVAEFVKHGAKEAIIEIELKADTDIHPENPVITCIITRDGGKGEDKKTTFKINGRKSTRKAVQELCKNNYSIQVDNLCQFLPQDRVVEFAALSPVELLVQTQRAAADPYMSEWHDQLKTMRKKQREKQAENQDLVATLKEMESRQRRQAEDVEKFREKEALRHRLNALEKLKPVAEYSDIRNRRIEAKERRKAAEKEFRELERRMAPNFAAMNSKDAYRKQLDRVVNQRSNLVAQTETRVGGEQAKLRDLGDQIQQCTEEVNTETDRVKKDKATVLRLQPDLNRLRAEKDKPAPEFDFEALSGKIKDLSDRIKEIDKEEDDPTNQIRSLELQARQRQELIKDERARREHLQSQAGKMSSQIQRHSAQSAKLWDWLQDNREQFTGNVYGPAIVECSVKDKRHASMVEAIIGPGDLKAFTVVNRQDFRKLTDHGSKTMKLWDLAVQSVSQPLSDFEHPLSDEQLKSLGLEGWVQDLLEGPEAVLAMLCSNKNLHRIPYGMSDNFDDTQIEALKRAGIMAWVTPKKTWTVARRYGHDSTRVMPINPAKLLTDAPINTQAEQDIGRKISELEDETRQIDEELKGVKARATQLKQQKTQLTAERDDLKKEKEDKQKKVAMWQGLDTKIANAEKKIEDAQAAVKSGYGKVTAIKDKELDLLLNKGQRALDYSRLLDSLRRLHEQLFEAEIIRIEAESDYEQLKAQNEEERTQLAERQEEVARLVAVEGQLKRAGEALVERVRQLSQDLTPEEEEVRQEIDGKTLEELNAIIEQQKARLEMVGHTGGLNLLKEYEDRERKIEQKRGQLNTLESDLEELDANITNIRDRWEPELDELIASISEAFSENFARVQCAGEVGIHKDEDFEQWAIQIKVKFRENESLSILDSHRQSGGERAVSTIFYLMALQSLARAPFRVVDEINQGMDPRNERLVHSRMVDIACAEHTSQYFLITPKLLNGLKYHKNMKVHCIASGEYMPDSKEENRLGTFEEMALKALAIRNAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.76
3 0.81
4 0.83
5 0.84
6 0.86
7 0.84
8 0.84
9 0.76
10 0.68
11 0.6
12 0.51
13 0.41
14 0.31
15 0.22
16 0.13
17 0.11
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.17
24 0.24
25 0.34
26 0.4
27 0.49
28 0.56
29 0.66
30 0.71
31 0.74
32 0.76
33 0.76
34 0.78
35 0.74
36 0.7
37 0.61
38 0.55
39 0.47
40 0.37
41 0.28
42 0.19
43 0.16
44 0.13
45 0.14
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.15
51 0.19
52 0.18
53 0.23
54 0.29
55 0.39
56 0.47
57 0.51
58 0.54
59 0.57
60 0.65
61 0.7
62 0.71
63 0.64
64 0.63
65 0.68
66 0.65
67 0.62
68 0.54
69 0.47
70 0.4
71 0.36
72 0.29
73 0.22
74 0.19
75 0.17
76 0.21
77 0.19
78 0.18
79 0.18
80 0.19
81 0.21
82 0.25
83 0.24
84 0.21
85 0.24
86 0.3
87 0.3
88 0.31
89 0.28
90 0.26
91 0.23
92 0.23
93 0.24
94 0.2
95 0.21
96 0.25
97 0.24
98 0.24
99 0.24
100 0.25
101 0.27
102 0.25
103 0.23
104 0.18
105 0.19
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.15
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.15
132 0.17
133 0.23
134 0.26
135 0.27
136 0.27
137 0.32
138 0.32
139 0.32
140 0.33
141 0.3
142 0.28
143 0.26
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.24
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.18
152 0.18
153 0.12
154 0.13
155 0.11
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.09
162 0.13
163 0.16
164 0.14
165 0.16
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.18
180 0.23
181 0.28
182 0.28
183 0.35
184 0.36
185 0.39
186 0.4
187 0.45
188 0.46
189 0.47
190 0.55
191 0.57
192 0.66
193 0.7
194 0.75
195 0.73
196 0.77
197 0.77
198 0.74
199 0.71
200 0.7
201 0.7
202 0.7
203 0.74
204 0.69
205 0.64
206 0.59
207 0.52
208 0.5
209 0.44
210 0.36
211 0.33
212 0.31
213 0.29
214 0.29
215 0.29
216 0.22
217 0.19
218 0.18
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.14
252 0.19
253 0.18
254 0.19
255 0.22
256 0.29
257 0.38
258 0.47
259 0.54
260 0.59
261 0.69
262 0.75
263 0.82
264 0.83
265 0.81
266 0.82
267 0.85
268 0.83
269 0.74
270 0.67
271 0.56
272 0.46
273 0.38
274 0.28
275 0.17
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.18
281 0.26
282 0.31
283 0.39
284 0.44
285 0.45
286 0.47
287 0.55
288 0.55
289 0.56
290 0.57
291 0.57
292 0.55
293 0.54
294 0.51
295 0.49
296 0.4
297 0.4
298 0.44
299 0.47
300 0.45
301 0.48
302 0.49
303 0.49
304 0.52
305 0.52
306 0.45
307 0.4
308 0.38
309 0.36
310 0.36
311 0.29
312 0.27
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.22
317 0.3
318 0.33
319 0.34
320 0.35
321 0.35
322 0.38
323 0.41
324 0.46
325 0.47
326 0.55
327 0.61
328 0.64
329 0.67
330 0.68
331 0.67
332 0.67
333 0.66
334 0.58
335 0.57
336 0.57
337 0.56
338 0.53
339 0.49
340 0.44
341 0.41
342 0.41
343 0.35
344 0.33
345 0.29
346 0.28
347 0.28
348 0.24
349 0.21
350 0.18
351 0.2
352 0.18
353 0.2
354 0.19
355 0.19
356 0.24
357 0.25
358 0.28
359 0.3
360 0.37
361 0.39
362 0.43
363 0.51
364 0.55
365 0.53
366 0.51
367 0.48
368 0.41
369 0.38
370 0.31
371 0.24
372 0.16
373 0.12
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.16
389 0.17
390 0.19
391 0.2
392 0.2
393 0.2
394 0.2
395 0.18
396 0.18
397 0.15
398 0.1
399 0.09
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.14
404 0.17
405 0.2
406 0.22
407 0.23
408 0.22
409 0.26
410 0.31
411 0.36
412 0.39
413 0.42
414 0.46
415 0.5
416 0.49
417 0.46
418 0.41
419 0.43
420 0.39
421 0.34
422 0.3
423 0.25
424 0.28
425 0.33
426 0.34
427 0.35
428 0.39
429 0.43
430 0.42
431 0.47
432 0.44
433 0.39
434 0.38
435 0.31
436 0.25
437 0.19
438 0.19
439 0.14
440 0.14
441 0.12
442 0.09
443 0.11
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.17
448 0.19
449 0.21
450 0.23
451 0.25
452 0.26
453 0.27
454 0.29
455 0.26
456 0.26
457 0.25
458 0.26
459 0.22
460 0.23
461 0.22
462 0.18
463 0.17
464 0.14
465 0.12
466 0.12
467 0.15
468 0.18
469 0.21
470 0.27
471 0.31
472 0.34
473 0.34
474 0.34
475 0.33
476 0.3
477 0.34
478 0.33
479 0.36
480 0.41
481 0.45
482 0.51
483 0.51
484 0.54
485 0.49
486 0.49
487 0.46
488 0.44
489 0.47
490 0.41
491 0.41
492 0.4
493 0.37
494 0.3
495 0.25
496 0.27
497 0.24
498 0.26
499 0.25
500 0.25
501 0.27
502 0.28
503 0.3
504 0.25
505 0.22
506 0.22
507 0.24
508 0.21
509 0.22
510 0.21
511 0.21
512 0.21
513 0.22
514 0.22
515 0.23
516 0.24
517 0.21
518 0.21
519 0.2
520 0.17
521 0.17
522 0.17
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.07
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.1
534 0.14
535 0.14
536 0.18
537 0.19
538 0.19
539 0.25
540 0.26
541 0.23
542 0.25
543 0.25
544 0.24
545 0.22
546 0.21
547 0.15
548 0.14
549 0.12
550 0.05
551 0.05
552 0.03
553 0.03
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.1
558 0.12
559 0.17
560 0.19
561 0.2
562 0.24
563 0.25
564 0.29
565 0.27
566 0.27
567 0.28
568 0.34
569 0.34
570 0.34
571 0.37
572 0.34
573 0.31
574 0.32
575 0.28
576 0.2
577 0.19
578 0.18
579 0.16
580 0.15
581 0.15
582 0.11
583 0.1
584 0.11
585 0.1
586 0.07
587 0.06
588 0.07
589 0.09
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.13
597 0.11
598 0.11
599 0.1
600 0.11
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.07
605 0.06
606 0.07
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.05
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.04
620 0.04
621 0.03
622 0.03
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.08
628 0.14
629 0.15
630 0.17
631 0.17
632 0.18
633 0.2
634 0.24
635 0.27
636 0.22
637 0.22
638 0.21
639 0.21
640 0.21
641 0.19
642 0.13
643 0.09
644 0.11
645 0.11
646 0.1
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.08
652 0.06
653 0.05
654 0.06
655 0.06
656 0.14
657 0.15
658 0.16
659 0.16
660 0.17
661 0.17
662 0.21
663 0.26
664 0.27
665 0.34
666 0.43
667 0.46
668 0.49
669 0.54
670 0.55
671 0.51
672 0.48
673 0.41
674 0.33
675 0.37
676 0.34
677 0.28
678 0.27
679 0.28
680 0.26
681 0.25
682 0.23
683 0.17
684 0.17
685 0.17
686 0.14
687 0.14
688 0.11
689 0.13
690 0.18
691 0.18
692 0.17
693 0.17
694 0.16
695 0.13
696 0.14
697 0.14
698 0.11
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.11
703 0.12
704 0.13
705 0.13
706 0.14
707 0.15
708 0.17
709 0.17
710 0.17
711 0.16
712 0.15
713 0.14
714 0.12
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.13
721 0.14
722 0.18
723 0.24
724 0.26
725 0.33
726 0.42
727 0.5
728 0.52
729 0.56
730 0.55
731 0.5
732 0.52
733 0.52
734 0.48
735 0.42
736 0.42
737 0.43
738 0.4
739 0.41
740 0.39
741 0.34
742 0.36
743 0.39
744 0.44
745 0.48
746 0.57
747 0.6
748 0.65
749 0.69
750 0.63
751 0.66
752 0.63
753 0.57
754 0.48
755 0.45
756 0.41
757 0.35
758 0.35
759 0.28
760 0.22
761 0.2
762 0.21
763 0.19
764 0.15
765 0.18
766 0.17
767 0.19
768 0.2
769 0.17
770 0.15
771 0.15
772 0.18
773 0.16
774 0.16
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.14
779 0.14
780 0.1
781 0.09
782 0.12
783 0.17
784 0.21
785 0.22
786 0.23
787 0.23
788 0.23
789 0.25
790 0.22
791 0.18
792 0.14
793 0.16
794 0.17
795 0.19
796 0.18
797 0.18
798 0.17
799 0.16
800 0.2
801 0.19
802 0.23
803 0.23
804 0.24
805 0.23
806 0.24
807 0.24
808 0.22
809 0.23
810 0.23
811 0.25
812 0.26
813 0.27
814 0.27
815 0.31
816 0.31
817 0.29
818 0.24
819 0.21
820 0.19
821 0.18
822 0.16
823 0.12
824 0.1
825 0.08
826 0.07
827 0.06
828 0.07
829 0.07
830 0.08
831 0.09
832 0.09
833 0.1
834 0.11
835 0.13
836 0.13
837 0.14
838 0.18
839 0.21
840 0.21
841 0.22
842 0.22
843 0.22
844 0.21
845 0.23
846 0.2
847 0.2
848 0.19
849 0.22
850 0.22
851 0.2
852 0.2
853 0.18
854 0.15
855 0.13
856 0.12
857 0.09
858 0.09
859 0.13
860 0.12
861 0.13
862 0.15
863 0.15
864 0.15
865 0.15
866 0.14
867 0.11
868 0.12
869 0.16
870 0.2
871 0.2
872 0.2
873 0.2
874 0.21
875 0.2
876 0.2
877 0.17
878 0.13
879 0.18
880 0.19
881 0.21
882 0.21
883 0.22
884 0.21
885 0.19
886 0.18
887 0.14
888 0.14
889 0.11
890 0.13
891 0.13
892 0.14
893 0.14
894 0.14
895 0.15
896 0.15
897 0.14
898 0.12
899 0.12
900 0.1
901 0.1
902 0.09
903 0.09
904 0.11
905 0.11
906 0.13
907 0.14
908 0.14
909 0.14
910 0.15
911 0.15
912 0.14
913 0.19
914 0.19
915 0.17
916 0.16
917 0.16
918 0.15
919 0.15
920 0.13
921 0.08
922 0.07
923 0.08
924 0.08
925 0.12
926 0.21
927 0.27
928 0.29
929 0.33
930 0.38
931 0.45
932 0.55
933 0.61
934 0.58
935 0.61
936 0.68
937 0.69
938 0.68
939 0.64
940 0.58
941 0.51
942 0.46
943 0.37
944 0.27
945 0.24
946 0.19
947 0.15
948 0.12
949 0.09
950 0.08
951 0.08
952 0.09
953 0.09
954 0.09
955 0.1
956 0.11
957 0.14
958 0.15
959 0.17
960 0.22
961 0.25
962 0.27
963 0.29
964 0.32
965 0.29
966 0.26
967 0.24
968 0.19
969 0.14
970 0.12
971 0.09
972 0.05
973 0.05
974 0.06
975 0.06
976 0.07
977 0.08
978 0.09
979 0.11
980 0.12
981 0.13
982 0.13
983 0.14
984 0.13
985 0.13
986 0.13
987 0.13
988 0.15
989 0.17
990 0.19
991 0.17
992 0.17
993 0.17
994 0.18
995 0.18
996 0.19
997 0.17
998 0.14
999 0.16
1000 0.21
1001 0.21
1002 0.24
1003 0.25
1004 0.26
1005 0.32
1006 0.38
1007 0.4
1008 0.39
1009 0.48
1010 0.47
1011 0.48
1012 0.47
1013 0.41
1014 0.36
1015 0.37
1016 0.33
1017 0.28
1018 0.26
1019 0.23
1020 0.21
1021 0.2
1022 0.2
1023 0.23
1024 0.27
1025 0.26
1026 0.25
1027 0.26
1028 0.25
1029 0.25
1030 0.25
1031 0.19
1032 0.13
1033 0.09
1034 0.1
1035 0.08
1036 0.07
1037 0.07
1038 0.06
1039 0.07
1040 0.1
1041 0.11
1042 0.12
1043 0.13
1044 0.13
1045 0.17
1046 0.2
1047 0.23
1048 0.21
1049 0.23
1050 0.28
1051 0.29
1052 0.29
1053 0.26
1054 0.24
1055 0.22
1056 0.25
1057 0.25
1058 0.23
1059 0.28
1060 0.27
1061 0.3
1062 0.36
1063 0.38
1064 0.38
1065 0.38
1066 0.36
1067 0.34
1068 0.33
1069 0.31
1070 0.24
1071 0.21
1072 0.18
1073 0.17
1074 0.16
1075 0.15
1076 0.15
1077 0.17
1078 0.17
1079 0.17
1080 0.19
1081 0.18
1082 0.21
1083 0.2
1084 0.2
1085 0.18
1086 0.26
1087 0.26
1088 0.25
1089 0.29
1090 0.35
1091 0.41
1092 0.48
1093 0.53
1094 0.52
1095 0.59
1096 0.6
1097 0.63
1098 0.63
1099 0.56
1100 0.52
1101 0.48
1102 0.43
1103 0.4
1104 0.39
1105 0.32
1106 0.24
1107 0.24
1108 0.22
1109 0.2
1110 0.23
1111 0.2
1112 0.25
1113 0.26
1114 0.28
1115 0.29
1116 0.29
1117 0.31
1118 0.3
1119 0.28
1120 0.23
1121 0.25
1122 0.21
1123 0.21
1124 0.2
1125 0.16
1126 0.16
1127 0.19