Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HVD1

Protein Details
Accession A0A139HVD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-292DEKSRLKEEKRARKEERRKRKEEKRRKRAEKEASSAKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-201KSKKR
231-286EKSQRKAELKAKKEAKRAKSKPSDDEKSRLKEEKRARKEERRKRKEEKRRKRAEKE
Subcellular Location(s) mito 14, mito_nucl 11.833, cyto_mito 9.833, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences LSQTPMTFPHNPTLQPSSTSKVHIAILFHAMGLAGNKIRTKLSHDPNNTAWARDTKTFGRKILAQQGWKDGDYLGAENASHASHYTAANASHIRVMLREDNLGLGAKIAAGNADTFGLSMFSGLLGRLNGKDDATLKKQEHSVRDAELRMYGYRKFGFMNFVSGGLLVGDKMEPPKSTNIAHIKPQVVPVKLDTEKKSKKRKADEDEDAPVRNSGDTSSSESSEEDRARVEKSQRKAELKAKKEAKRAKSKPSDDEKSRLKEEKRARKEERRKRKEEKRRKRAEKEASSAKTPVPASAANSEGEGSGTSTPTLMGGRQALRHRYIMQKRMASGNAAALKEIFMLQPQAPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.4
4 0.38
5 0.36
6 0.39
7 0.35
8 0.31
9 0.33
10 0.31
11 0.28
12 0.25
13 0.26
14 0.22
15 0.2
16 0.18
17 0.14
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.1
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.18
26 0.19
27 0.26
28 0.33
29 0.41
30 0.49
31 0.53
32 0.57
33 0.58
34 0.65
35 0.58
36 0.49
37 0.43
38 0.38
39 0.37
40 0.34
41 0.37
42 0.35
43 0.43
44 0.46
45 0.44
46 0.43
47 0.43
48 0.47
49 0.53
50 0.51
51 0.48
52 0.46
53 0.51
54 0.49
55 0.45
56 0.39
57 0.28
58 0.24
59 0.21
60 0.19
61 0.13
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.14
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.13
81 0.12
82 0.15
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.11
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.11
119 0.12
120 0.17
121 0.2
122 0.26
123 0.24
124 0.26
125 0.31
126 0.34
127 0.35
128 0.34
129 0.32
130 0.28
131 0.31
132 0.29
133 0.24
134 0.21
135 0.19
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.14
144 0.17
145 0.16
146 0.19
147 0.15
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.08
153 0.07
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.1
163 0.13
164 0.13
165 0.2
166 0.25
167 0.26
168 0.3
169 0.32
170 0.31
171 0.3
172 0.35
173 0.33
174 0.27
175 0.26
176 0.23
177 0.25
178 0.27
179 0.31
180 0.28
181 0.33
182 0.41
183 0.5
184 0.59
185 0.6
186 0.66
187 0.71
188 0.78
189 0.76
190 0.77
191 0.75
192 0.69
193 0.68
194 0.61
195 0.52
196 0.43
197 0.34
198 0.25
199 0.18
200 0.14
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.14
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.18
210 0.21
211 0.2
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.21
217 0.27
218 0.29
219 0.35
220 0.44
221 0.49
222 0.52
223 0.57
224 0.61
225 0.63
226 0.61
227 0.64
228 0.65
229 0.65
230 0.7
231 0.72
232 0.73
233 0.75
234 0.76
235 0.77
236 0.78
237 0.77
238 0.77
239 0.78
240 0.77
241 0.71
242 0.73
243 0.7
244 0.66
245 0.66
246 0.64
247 0.57
248 0.57
249 0.63
250 0.66
251 0.68
252 0.72
253 0.75
254 0.79
255 0.87
256 0.89
257 0.9
258 0.89
259 0.89
260 0.9
261 0.92
262 0.92
263 0.93
264 0.93
265 0.93
266 0.94
267 0.95
268 0.94
269 0.94
270 0.93
271 0.91
272 0.88
273 0.87
274 0.79
275 0.72
276 0.64
277 0.54
278 0.48
279 0.39
280 0.32
281 0.25
282 0.22
283 0.22
284 0.23
285 0.24
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.15
290 0.14
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.09
301 0.11
302 0.15
303 0.17
304 0.24
305 0.31
306 0.35
307 0.38
308 0.41
309 0.43
310 0.49
311 0.55
312 0.57
313 0.59
314 0.58
315 0.57
316 0.6
317 0.56
318 0.49
319 0.41
320 0.4
321 0.38
322 0.33
323 0.31
324 0.25
325 0.23
326 0.21
327 0.21
328 0.14
329 0.1
330 0.13