FuNGI

A0A139H1U2

Protein Details

Accession

A0A139H1U2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-50	MSRTTFTERPVKRKKEQRTDIWSNLLR	Hydrophilic
86-113	LTRPPPAQPPSRKQERKQQSTKGELRLS	Hydrophilic
559-583	SDSPTPRTSTPKPPGRPHRDANNAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008467 Dynein1_light_intermed_chain
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005868 C:cytoplasmic dynein complex GO:0005874 C:microtubule GO:0007018 P:microtubule-based movement

Amino Acid Sequences

MALGIESTAPEQHEEQPDPASTVMSRTTFTERPVKRKKEQRTDIWSNLLRQTREAQSRNKTQAVQHRELLICGASPDDQRQFVSTLTRPPPAQPPSRKQERKQQSTKGELRLSNQYAYGYGHVTLYSPPQQSGTGVQVLGTEAEEVASVQIHTLPDAKEEYVGTLRRLLKKEQKQKEEDGLGDVELDGGKDPEEDRKPAVCILLSWKQPWQFLQQLKTWLQLLAQSLLPPGVPATDPLDVLKEAQLGITVVVQHTEAQEHLLREGYKEEDFDYISQCLRTAILPLHPFSALIYTTSTAPPQQAGGPLSEQQKVVFNSLALDLATLSPRRARSSSGAEKREELTPKHEFMDRMAIVIPAGWDSPAFIRTLSETFSPEDIVNGWLADLQPPPPPKPSPEQKSAETAVEVKQANGGAEVYESSPVDENEDFPEIPLSPSKLTPSAVRTYEQRVLDPQAHKAPKPPKIEVTTKPDQVFLAEMRQHLQQLEAQDRERESRGHRTGVSNTSLSGTGGRVVGLPAGESTGALGELGEVSFNVGGVSYDTMTAQAAIDRLKRPNQSSDSPTPRTSTPKPPGRPHRDANNAADDKKTSGGTPGVTSPKLSDSKEPLDTAKLEEYFQSLMKKGGGASSRDATPTKSTPKGQSSQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.31
3	0.33
4	0.33
5	0.32
6	0.3
7	0.25
8	0.18
9	0.18
10	0.2
11	0.18
12	0.18
13	0.2
14	0.26
15	0.27
16	0.31
17	0.39
18	0.41
19	0.51
20	0.61
21	0.66
22	0.69
23	0.77
24	0.83
25	0.85
26	0.88
27	0.87
28	0.87
29	0.87
30	0.83
31	0.82
32	0.75
33	0.68
34	0.66
35	0.62
36	0.53
37	0.46
38	0.47
39	0.46
40	0.52
41	0.53
42	0.55
43	0.58
44	0.66
45	0.7
46	0.69
47	0.63
48	0.61
49	0.65
50	0.66
51	0.62
52	0.56
53	0.55
54	0.51
55	0.48
56	0.42
57	0.32
58	0.23
59	0.18
60	0.16
61	0.12
62	0.13
63	0.18
64	0.2
65	0.21
66	0.21
67	0.23
68	0.23
69	0.22
70	0.27
71	0.24
72	0.3
73	0.32
74	0.36
75	0.34
76	0.36
77	0.44
78	0.45
79	0.52
80	0.53
81	0.58
82	0.64
83	0.74
84	0.8
85	0.77
86	0.8
87	0.82
88	0.83
89	0.83
90	0.83
91	0.81
92	0.82
93	0.83
94	0.8
95	0.76
96	0.68
97	0.62
98	0.62
99	0.56
100	0.47
101	0.41
102	0.33
103	0.27
104	0.26
105	0.24
106	0.16
107	0.13
108	0.12
109	0.11
110	0.12
111	0.12
112	0.15
113	0.2
114	0.19
115	0.19
116	0.21
117	0.21
118	0.21
119	0.23
120	0.22
121	0.17
122	0.16
123	0.15
124	0.14
125	0.14
126	0.13
127	0.11
128	0.07
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.04
136	0.04
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.11
141	0.11
142	0.12
143	0.14
144	0.14
145	0.14
146	0.14
147	0.15
148	0.17
149	0.19
150	0.18
151	0.23
152	0.28
153	0.34
154	0.37
155	0.42
156	0.47
157	0.56
158	0.66
159	0.68
160	0.72
161	0.71
162	0.73
163	0.72
164	0.65
165	0.56
166	0.48
167	0.38
168	0.29
169	0.24
170	0.19
171	0.12
172	0.08
173	0.08
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.13
180	0.16
181	0.18
182	0.21
183	0.22
184	0.23
185	0.24
186	0.24
187	0.17
188	0.15
189	0.19
190	0.23
191	0.23
192	0.24
193	0.26
194	0.27
195	0.29
196	0.3
197	0.3
198	0.3
199	0.33
200	0.36
201	0.35
202	0.39
203	0.38
204	0.38
205	0.33
206	0.26
207	0.22
208	0.2
209	0.18
210	0.14
211	0.13
212	0.12
213	0.11
214	0.11
215	0.1
216	0.08
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.1
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.08
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.14
252	0.13
253	0.11
254	0.12
255	0.12
256	0.11
257	0.12
258	0.12
259	0.12
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.12
270	0.13
271	0.14
272	0.15
273	0.14
274	0.14
275	0.12
276	0.13
277	0.08
278	0.07
279	0.08
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.1
292	0.11
293	0.14
294	0.16
295	0.17
296	0.16
297	0.14
298	0.18
299	0.18
300	0.18
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.07
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.09
314	0.1
315	0.13
316	0.13
317	0.15
318	0.18
319	0.27
320	0.36
321	0.42
322	0.44
323	0.42
324	0.43
325	0.42
326	0.42
327	0.37
328	0.28
329	0.26
330	0.26
331	0.27
332	0.27
333	0.28
334	0.23
335	0.21
336	0.28
337	0.22
338	0.19
339	0.18
340	0.17
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.05
353	0.06
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.09
366	0.08
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.12
375	0.14
376	0.16
377	0.2
378	0.21
379	0.23
380	0.31
381	0.4
382	0.41
383	0.47
384	0.5
385	0.48
386	0.51
387	0.5
388	0.42
389	0.33
390	0.28
391	0.21
392	0.22
393	0.2
394	0.16
395	0.15
396	0.15
397	0.14
398	0.13
399	0.12
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.11
410	0.1
411	0.11
412	0.12
413	0.14
414	0.13
415	0.12
416	0.14
417	0.11
418	0.12
419	0.12
420	0.13
421	0.12
422	0.13
423	0.15
424	0.15
425	0.16
426	0.18
427	0.21
428	0.24
429	0.24
430	0.25
431	0.26
432	0.3
433	0.35
434	0.33
435	0.3
436	0.27
437	0.29
438	0.34
439	0.33
440	0.32
441	0.35
442	0.37
443	0.36
444	0.42
445	0.46
446	0.48
447	0.52
448	0.51
449	0.5
450	0.53
451	0.6
452	0.58
453	0.59
454	0.57
455	0.56
456	0.53
457	0.47
458	0.41
459	0.34
460	0.3
461	0.22
462	0.22
463	0.19
464	0.19
465	0.2
466	0.21
467	0.21
468	0.19
469	0.19
470	0.15
471	0.17
472	0.22
473	0.24
474	0.24
475	0.26
476	0.27
477	0.29
478	0.29
479	0.28
480	0.27
481	0.35
482	0.37
483	0.38
484	0.39
485	0.41
486	0.44
487	0.45
488	0.44
489	0.34
490	0.3
491	0.28
492	0.26
493	0.21
494	0.17
495	0.12
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.08
503	0.08
504	0.06
505	0.07
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.06
525	0.07
526	0.06
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.07
533	0.07
534	0.08
535	0.11
536	0.16
537	0.2
538	0.25
539	0.31
540	0.38
541	0.4
542	0.48
543	0.51
544	0.53
545	0.57
546	0.63
547	0.65
548	0.63
549	0.61
550	0.55
551	0.52
552	0.53
553	0.51
554	0.52
555	0.54
556	0.59
557	0.65
558	0.73
559	0.81
560	0.83
561	0.85
562	0.82
563	0.82
564	0.82
565	0.79
566	0.74
567	0.73
568	0.67
569	0.6
570	0.55
571	0.46
572	0.38
573	0.35
574	0.3
575	0.2
576	0.2
577	0.21
578	0.21
579	0.22
580	0.26
581	0.29
582	0.28
583	0.29
584	0.27
585	0.31
586	0.34
587	0.34
588	0.35
589	0.37
590	0.43
591	0.46
592	0.46
593	0.41
594	0.41
595	0.39
596	0.36
597	0.35
598	0.3
599	0.27
600	0.26
601	0.26
602	0.24
603	0.25
604	0.25
605	0.2
606	0.21
607	0.21
608	0.21
609	0.19
610	0.24
611	0.26
612	0.25
613	0.29
614	0.31
615	0.32
616	0.34
617	0.34
618	0.32
619	0.34
620	0.38
621	0.4
622	0.44
623	0.48
624	0.53

A0A139H1U2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer