FuNGI

A0A139HR17

Protein Details

Accession

A0A139HR17

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
202-221	SEPRRRSSAHLRRNRNEPTP	Hydrophilic
349-369	LEVAAKRRRRENVRKLRCATA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
355-358	RRRR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MAFSPRFSLDTPTHLTSPSPSSPTSAYPFPTQAHDGRHSSSRRMSRRGSTASQMSVGSIGGSLDIQTRRGSTVRETSQNAISTLLQPPIVRTGLLPHTHASAAAAGFKAPTTKDIPPVTLTHVPHVPPDNFRDYLNRIGPLFDSFQRGRAESEQHAWLKKDKELEKAEALERRLSRDSSAPTTPLSPNASRYGPISPLERPSEPRRRSSAHLRRNRNEPTPLSTIPNVYFDEHFHLENPRTFDVVSERSEIVRPPLASQQAEQKSSNAAPQPPRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKELQTEAEESVAKIQSLRDDLRRLDKEVAISGLEVAAKRRRRENVRKLRCATAQVQSVVENISKADELVDAGAYSEAADQMDRVGRLVCGHSEWGQDDTELIDLRPLRALQGLDSGLQELQLRIGTGYAQSFESILMKDLRAHVERVPSDQTLKRWSRQRGIPPTYMETDDDFRKDLLSALNGLARAGHTAPAAAAYREAVNKEVKSIIRRSLPSSSDDDADSMVSTSTRGGSRPSQQEKSMILSRNLRALDAEDAEKLFVSVYTSISEALRRVSTQTKIILDVTSQMQAPEAKVPARSPGEQGPNDQFAAGMKADSMSAVREEITQALDMSSLLGQAVDTAQTQIGRVLKVRNEQAIRLPLNLFLRYFTLNRLFADECEAVSGRGGNVLKGIINAQLSGFVQVLGTAEAERTASLLENDSWNAEDFSDNDNTVLQRILASMSADPPEWTKITTPIWEEPGPPPNANGNAIAEQSNGTTDKPSTHGATPTPGGKAAVKPAYIDESRYVLVSSAASLLSIIDTFLSLTSWLPSMTSQISTSLLEVLRAFNSRTNQMILGAGATRVGGLKNITTKHLALASQALSFVIALIPYMRECVRRHIPAGQGGILAEFDKTKRLYQDHQSGVHDKLVDIMTSRSAFHIKAMHNVDFDKSSADDKPNAYMEQFTKETLVLYRTLSRHLSEVDVGMIMRQIFATVREQWTQAYGDLDVKTRAGEKKLLRDVELLEAKLGKLEGFEPVGREISGVVKAKVSLEDESPKKVEEEGKKTSAPAAPGSEAFFDQDEEKANGGQGEEGGKAEEGKEVGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.33
3	0.31
4	0.35
5	0.33
6	0.31
7	0.27
8	0.3
9	0.31
10	0.35
11	0.37
12	0.34
13	0.32
14	0.33
15	0.36
16	0.35
17	0.37
18	0.38
19	0.37
20	0.4
21	0.43
22	0.42
23	0.42
24	0.49
25	0.47
26	0.49
27	0.53
28	0.56
29	0.58
30	0.63
31	0.65
32	0.65
33	0.71
34	0.72
35	0.68
36	0.65
37	0.62
38	0.57
39	0.52
40	0.44
41	0.35
42	0.28
43	0.23
44	0.16
45	0.11
46	0.08
47	0.06
48	0.06
49	0.06
50	0.11
51	0.12
52	0.14
53	0.15
54	0.16
55	0.19
56	0.21
57	0.23
58	0.24
59	0.33
60	0.38
61	0.43
62	0.46
63	0.47
64	0.5
65	0.5
66	0.44
67	0.36
68	0.31
69	0.27
70	0.27
71	0.24
72	0.21
73	0.19
74	0.2
75	0.23
76	0.22
77	0.19
78	0.16
79	0.21
80	0.26
81	0.29
82	0.29
83	0.25
84	0.27
85	0.27
86	0.26
87	0.21
88	0.16
89	0.14
90	0.15
91	0.14
92	0.11
93	0.12
94	0.12
95	0.13
96	0.11
97	0.15
98	0.18
99	0.2
100	0.28
101	0.3
102	0.32
103	0.33
104	0.34
105	0.37
106	0.39
107	0.37
108	0.34
109	0.35
110	0.34
111	0.35
112	0.4
113	0.36
114	0.34
115	0.38
116	0.39
117	0.37
118	0.37
119	0.39
120	0.36
121	0.42
122	0.41
123	0.38
124	0.32
125	0.33
126	0.32
127	0.29
128	0.29
129	0.23
130	0.27
131	0.24
132	0.29
133	0.31
134	0.31
135	0.31
136	0.32
137	0.35
138	0.31
139	0.35
140	0.37
141	0.39
142	0.42
143	0.4
144	0.42
145	0.4
146	0.4
147	0.45
148	0.41
149	0.46
150	0.48
151	0.5
152	0.48
153	0.49
154	0.5
155	0.46
156	0.45
157	0.43
158	0.38
159	0.39
160	0.38
161	0.35
162	0.32
163	0.33
164	0.36
165	0.35
166	0.37
167	0.32
168	0.3
169	0.33
170	0.32
171	0.31
172	0.31
173	0.27
174	0.28
175	0.31
176	0.31
177	0.28
178	0.29
179	0.27
180	0.24
181	0.25
182	0.25
183	0.23
184	0.28
185	0.32
186	0.32
187	0.35
188	0.42
189	0.51
190	0.51
191	0.55
192	0.56
193	0.55
194	0.6
195	0.65
196	0.66
197	0.66
198	0.72
199	0.76
200	0.75
201	0.8
202	0.8
203	0.75
204	0.72
205	0.65
206	0.62
207	0.58
208	0.54
209	0.49
210	0.43
211	0.4
212	0.33
213	0.33
214	0.28
215	0.24
216	0.22
217	0.2
218	0.24
219	0.23
220	0.22
221	0.2
222	0.24
223	0.25
224	0.28
225	0.31
226	0.26
227	0.26
228	0.25
229	0.25
230	0.26
231	0.26
232	0.24
233	0.23
234	0.22
235	0.23
236	0.24
237	0.23
238	0.21
239	0.22
240	0.2
241	0.2
242	0.25
243	0.28
244	0.28
245	0.28
246	0.35
247	0.35
248	0.38
249	0.36
250	0.31
251	0.31
252	0.31
253	0.34
254	0.28
255	0.29
256	0.35
257	0.42
258	0.48
259	0.47
260	0.49
261	0.45
262	0.43
263	0.4
264	0.4
265	0.35
266	0.33
267	0.34
268	0.33
269	0.31
270	0.29
271	0.27
272	0.2
273	0.19
274	0.15
275	0.11
276	0.11
277	0.13
278	0.15
279	0.14
280	0.14
281	0.14
282	0.13
283	0.13
284	0.13
285	0.12
286	0.1
287	0.09
288	0.08
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.09
313	0.13
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.12
319	0.16
320	0.19
321	0.2
322	0.23
323	0.26
324	0.34
325	0.36
326	0.37
327	0.36
328	0.35
329	0.32
330	0.29
331	0.28
332	0.18
333	0.16
334	0.13
335	0.1
336	0.09
337	0.08
338	0.1
339	0.17
340	0.22
341	0.25
342	0.31
343	0.39
344	0.49
345	0.6
346	0.68
347	0.72
348	0.77
349	0.84
350	0.81
351	0.79
352	0.7
353	0.64
354	0.57
355	0.51
356	0.45
357	0.37
358	0.34
359	0.28
360	0.26
361	0.22
362	0.18
363	0.12
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.05
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.1
394	0.11
395	0.12
396	0.13
397	0.14
398	0.13
399	0.12
400	0.11
401	0.1
402	0.09
403	0.08
404	0.07
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.09
411	0.11
412	0.12
413	0.1
414	0.12
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.12
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.06
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.05
427	0.06
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.1
442	0.11
443	0.15
444	0.15
445	0.17
446	0.17
447	0.21
448	0.22
449	0.23
450	0.24
451	0.21
452	0.24
453	0.25
454	0.25
455	0.29
456	0.32
457	0.35
458	0.4
459	0.44
460	0.47
461	0.51
462	0.59
463	0.6
464	0.62
465	0.6
466	0.55
467	0.53
468	0.48
469	0.42
470	0.33
471	0.25
472	0.22
473	0.19
474	0.18
475	0.15
476	0.13
477	0.12
478	0.11
479	0.11
480	0.09
481	0.08
482	0.09
483	0.09
484	0.1
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.08
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.08
502	0.09
503	0.09
504	0.12
505	0.12
506	0.13
507	0.15
508	0.16
509	0.19
510	0.21
511	0.23
512	0.25
513	0.26
514	0.29
515	0.3
516	0.3
517	0.29
518	0.31
519	0.27
520	0.24
521	0.22
522	0.19
523	0.15
524	0.13
525	0.11
526	0.06
527	0.05
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.09
535	0.12
536	0.19
537	0.28
538	0.33
539	0.34
540	0.35
541	0.37
542	0.36
543	0.37
544	0.36
545	0.3
546	0.26
547	0.28
548	0.28
549	0.29
550	0.28
551	0.23
552	0.18
553	0.17
554	0.16
555	0.13
556	0.12
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.07
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.07
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.1
577	0.13
578	0.14
579	0.16
580	0.19
581	0.18
582	0.19
583	0.19
584	0.17
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.1
589	0.09
590	0.08
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.11
598	0.11
599	0.15
600	0.18
601	0.18
602	0.18
603	0.22
604	0.28
605	0.28
606	0.3
607	0.28
608	0.27
609	0.26
610	0.24
611	0.18
612	0.12
613	0.13
614	0.1
615	0.07
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.04
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.05
634	0.06
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.05
646	0.05
647	0.06
648	0.08
649	0.1
650	0.1
651	0.11
652	0.14
653	0.17
654	0.21
655	0.23
656	0.27
657	0.26
658	0.27
659	0.29
660	0.33
661	0.3
662	0.27
663	0.26
664	0.23
665	0.24
666	0.24
667	0.2
668	0.14
669	0.15
670	0.15
671	0.16
672	0.15
673	0.18
674	0.18
675	0.18
676	0.21
677	0.2
678	0.18
679	0.23
680	0.2
681	0.15
682	0.15
683	0.15
684	0.12
685	0.11
686	0.11
687	0.06
688	0.1
689	0.1
690	0.08
691	0.09
692	0.09
693	0.09
694	0.09
695	0.1
696	0.08
697	0.08
698	0.08
699	0.07
700	0.08
701	0.08
702	0.09
703	0.08
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.04
711	0.04
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.04
716	0.04
717	0.05
718	0.05
719	0.07
720	0.07
721	0.08
722	0.09
723	0.09
724	0.09
725	0.1
726	0.09
727	0.08
728	0.08
729	0.09
730	0.12
731	0.13
732	0.12
733	0.12
734	0.12
735	0.12
736	0.12
737	0.11
738	0.07
739	0.06
740	0.06
741	0.07
742	0.06
743	0.07
744	0.07
745	0.08
746	0.09
747	0.09
748	0.1
749	0.1
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.12
754	0.15
755	0.16
756	0.19
757	0.21
758	0.21
759	0.25
760	0.25
761	0.26
762	0.26
763	0.32
764	0.32
765	0.28
766	0.27
767	0.26
768	0.27
769	0.26
770	0.24
771	0.18
772	0.17
773	0.18
774	0.16
775	0.13
776	0.11
777	0.1
778	0.11
779	0.1
780	0.09
781	0.09
782	0.1
783	0.11
784	0.13
785	0.16
786	0.17
787	0.19
788	0.21
789	0.2
790	0.23
791	0.24
792	0.23
793	0.21
794	0.19
795	0.18
796	0.17
797	0.18
798	0.21
799	0.22
800	0.2
801	0.2
802	0.21
803	0.25
804	0.23
805	0.23
806	0.19
807	0.18
808	0.18
809	0.18
810	0.16
811	0.11
812	0.12
813	0.1
814	0.08
815	0.07
816	0.07
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.05
821	0.05
822	0.04
823	0.03
824	0.04
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.05
829	0.05
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.07
834	0.07
835	0.1
836	0.11
837	0.12
838	0.11
839	0.12
840	0.14
841	0.13
842	0.14
843	0.14
844	0.13
845	0.12
846	0.12
847	0.13
848	0.13
849	0.14
850	0.15
851	0.15
852	0.18
853	0.2
854	0.21
855	0.22
856	0.2
857	0.2
858	0.19
859	0.15
860	0.13
861	0.11
862	0.09
863	0.07
864	0.07
865	0.06
866	0.06
867	0.06
868	0.07
869	0.07
870	0.1
871	0.15
872	0.16
873	0.19
874	0.21
875	0.21
876	0.22
877	0.23
878	0.21
879	0.17
880	0.2
881	0.18
882	0.15
883	0.15
884	0.13
885	0.11
886	0.1
887	0.09
888	0.06
889	0.04
890	0.04
891	0.05
892	0.06
893	0.06
894	0.08
895	0.1
896	0.15
897	0.16
898	0.25
899	0.32
900	0.35
901	0.38
902	0.41
903	0.45
904	0.45
905	0.47
906	0.39
907	0.31
908	0.27
909	0.25
910	0.19
911	0.15
912	0.1
913	0.08
914	0.08
915	0.12
916	0.14
917	0.17
918	0.22
919	0.27
920	0.33
921	0.41
922	0.5
923	0.51
924	0.54
925	0.55
926	0.53
927	0.5
928	0.47
929	0.38
930	0.28
931	0.26
932	0.23
933	0.18
934	0.16
935	0.15
936	0.16
937	0.16
938	0.17
939	0.15
940	0.16
941	0.16
942	0.18
943	0.24
944	0.22
945	0.29
946	0.34
947	0.34
948	0.34
949	0.35
950	0.34
951	0.28
952	0.27
953	0.21
954	0.17
955	0.17
956	0.2
957	0.23
958	0.25
959	0.24
960	0.29
961	0.3
962	0.29
963	0.27
964	0.28
965	0.26
966	0.28
967	0.28
968	0.24
969	0.22
970	0.21
971	0.22
972	0.19
973	0.19
974	0.15
975	0.16
976	0.22
977	0.22
978	0.26
979	0.27
980	0.26
981	0.27
982	0.27
983	0.27
984	0.22
985	0.21
986	0.18
987	0.16
988	0.14
989	0.12
990	0.13
991	0.1
992	0.09
993	0.08
994	0.08
995	0.08
996	0.1
997	0.14
998	0.18
999	0.22
1000	0.23
1001	0.24
1002	0.24
1003	0.26
1004	0.26
1005	0.22
1006	0.19
1007	0.16
1008	0.19
1009	0.19
1010	0.21
1011	0.19
1012	0.18
1013	0.18
1014	0.22
1015	0.25
1016	0.24
1017	0.31
1018	0.35
1019	0.43
1020	0.52
1021	0.53
1022	0.5
1023	0.48
1024	0.46
1025	0.48
1026	0.46
1027	0.36
1028	0.3
1029	0.28
1030	0.26
1031	0.24
1032	0.23
1033	0.14
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.13
1037	0.15
1038	0.16
1039	0.17
1040	0.18
1041	0.2
1042	0.18
1043	0.18
1044	0.15
1045	0.15
1046	0.2
1047	0.21
1048	0.2
1049	0.2
1050	0.21
1051	0.22
1052	0.24
1053	0.24
1054	0.2
1055	0.22
1056	0.3
1057	0.31
1058	0.36
1059	0.36
1060	0.34
1061	0.32
1062	0.34
1063	0.38
1064	0.39
1065	0.44
1066	0.46
1067	0.5
1068	0.5
1069	0.5
1070	0.51
1071	0.46
1072	0.39
1073	0.35
1074	0.32
1075	0.29
1076	0.3
1077	0.31
1078	0.28
1079	0.24
1080	0.23
1081	0.2
1082	0.17
1083	0.16
1084	0.16
1085	0.18
1086	0.18
1087	0.19
1088	0.18
1089	0.18
1090	0.18
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.13
1094	0.14
1095	0.13
1096	0.13
1097	0.13
1098	0.12
1099	0.13
1100	0.12
1101	0.14
1102	0.12

A0A139HR17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer