Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HJA0

Protein Details
Accession A0A139HJA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
522-549MLRILLSHFRPKKKAKKQKTGNGFAMLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
531-540RPKKKAKKQK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026832  Asteroid  
IPR039436  Asteroid_dom  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF12813  XPG_I_2  
Amino Acid Sequences MGIQRFGSRMRDYATRTTLGSTASPQDTSIAIIDGPGLAHYIYYGICDSANGPITYRGCTEATKAWLDRMQQFGFKIEAILFDGALPSSKKDVRIDRLQSYTNRLQVFKQSSTSSLSGLDGEARKRLPPPPFLVFALVEELLLSKYADVTYVVPGEADPHCIAAAQALPSDSGSITIFSDDADLLVYKASKACQIVPFRDLSESETTSGAVLTGHAYNTSEIVKRCPSAIEDLIKPAYYMSLDHHCTLEKAFQKTASAHAELREDFPEFAKSFESISEAKQLASIRADPTWKAALASRDSRVSELVHQVQSDERGGLRMYLPFLSDDPTRASAWNVGVEIRSLAYSVLLQAHKMESSIQEYKRSGSRIASSPMEPLTMEDMACMARELVSDVSKVKAVPGVGSQLKGADGWRYLAMQHTLAHLYKEESTLPSVEEMAQVVMKREARKWHTFHLAAQYQAAYYSLRMLRQLLAHASSQATPASWDASFTGLNALLSDLPSVSRFFDDKAGNDRREEHERWSEMLRILLSHFRPKKKAKKQKTGNGFAMLADD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.42
3 0.4
4 0.39
5 0.37
6 0.32
7 0.28
8 0.23
9 0.25
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.2
15 0.2
16 0.17
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.08
23 0.06
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.09
36 0.13
37 0.18
38 0.16
39 0.17
40 0.22
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.21
46 0.22
47 0.25
48 0.24
49 0.27
50 0.31
51 0.3
52 0.31
53 0.33
54 0.36
55 0.38
56 0.39
57 0.37
58 0.34
59 0.34
60 0.33
61 0.31
62 0.26
63 0.22
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.15
76 0.18
77 0.22
78 0.28
79 0.36
80 0.41
81 0.5
82 0.55
83 0.55
84 0.57
85 0.59
86 0.55
87 0.55
88 0.53
89 0.49
90 0.45
91 0.41
92 0.39
93 0.42
94 0.46
95 0.4
96 0.38
97 0.34
98 0.33
99 0.37
100 0.35
101 0.27
102 0.22
103 0.2
104 0.16
105 0.15
106 0.18
107 0.16
108 0.16
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.23
113 0.29
114 0.3
115 0.33
116 0.38
117 0.39
118 0.41
119 0.4
120 0.4
121 0.34
122 0.29
123 0.25
124 0.19
125 0.14
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.11
143 0.1
144 0.13
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.09
151 0.1
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.11
179 0.14
180 0.2
181 0.25
182 0.27
183 0.28
184 0.28
185 0.26
186 0.26
187 0.24
188 0.21
189 0.2
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.14
195 0.14
196 0.1
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.17
216 0.2
217 0.2
218 0.19
219 0.21
220 0.21
221 0.2
222 0.18
223 0.14
224 0.11
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.13
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.16
233 0.16
234 0.16
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.21
241 0.22
242 0.25
243 0.23
244 0.2
245 0.18
246 0.18
247 0.2
248 0.19
249 0.2
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.12
262 0.09
263 0.1
264 0.14
265 0.14
266 0.13
267 0.15
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.15
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.13
281 0.14
282 0.17
283 0.2
284 0.19
285 0.2
286 0.2
287 0.2
288 0.19
289 0.17
290 0.15
291 0.18
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.18
298 0.16
299 0.11
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.08
343 0.14
344 0.21
345 0.21
346 0.25
347 0.26
348 0.28
349 0.31
350 0.32
351 0.27
352 0.24
353 0.27
354 0.26
355 0.29
356 0.29
357 0.26
358 0.26
359 0.25
360 0.22
361 0.18
362 0.15
363 0.14
364 0.12
365 0.11
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.17
388 0.17
389 0.18
390 0.17
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.14
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.14
402 0.15
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.17
408 0.18
409 0.15
410 0.16
411 0.16
412 0.16
413 0.16
414 0.14
415 0.15
416 0.15
417 0.15
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.11
427 0.15
428 0.18
429 0.2
430 0.24
431 0.33
432 0.39
433 0.47
434 0.49
435 0.52
436 0.57
437 0.56
438 0.56
439 0.56
440 0.52
441 0.44
442 0.41
443 0.34
444 0.25
445 0.24
446 0.21
447 0.12
448 0.09
449 0.14
450 0.15
451 0.16
452 0.17
453 0.19
454 0.2
455 0.22
456 0.24
457 0.21
458 0.21
459 0.21
460 0.21
461 0.21
462 0.19
463 0.19
464 0.16
465 0.13
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.11
470 0.12
471 0.11
472 0.13
473 0.13
474 0.12
475 0.14
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.1
487 0.11
488 0.13
489 0.14
490 0.15
491 0.22
492 0.24
493 0.26
494 0.35
495 0.42
496 0.41
497 0.43
498 0.46
499 0.45
500 0.51
501 0.5
502 0.48
503 0.48
504 0.49
505 0.49
506 0.48
507 0.46
508 0.4
509 0.4
510 0.33
511 0.25
512 0.25
513 0.3
514 0.3
515 0.36
516 0.43
517 0.48
518 0.56
519 0.66
520 0.74
521 0.78
522 0.86
523 0.86
524 0.9
525 0.93
526 0.94
527 0.94
528 0.93
529 0.87
530 0.82
531 0.71