FuNGI

A0A139HGI6

Protein Details

Accession

A0A139HGI6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
322-346	TTLPQSPERHRPPHRRNRSEQLPDI	Hydrophilic
355-377	SRSSRSRSTHHRSKSSRRGRSPL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
361-380	RSTHHRSKSSRRGRSPLPSP

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024977 Apc4-like_WD40_dom IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR037363 Sec13/Seh1_fam IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0005198 F:structural molecule activity GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF12894 ANAPC4_WD40 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MIHDAVLDYYGRRLATCSSDKTIKIFEIEGEQHRLTETLKGHEGAVWGVAWAHPKYGTILASCSYDGRILIWREQNNQWQRIYEFTHHTASVNLVAWSPPETGCHLAAASSDGNVSVLTFENNNFSHAIFQAHGLGVNSVSWSPAILPGQLTSAQNGPHTAGPQRRFVTGGSDNLVKIWQYNANTQTYDNITTLTGHADWVRDVAWSPTPLSKIYIASASQDHTVRIWTLPAGADIADASAWKSEELNLDVVVWRASWSMAGNVLAVSCGDNRVSLWKEKLKGGWEVVKTMEEPAQQKSDNNTADMMRCSMIYPNVIAGAPTTLPQSPERHRPPHRRNRSEQLPDISRLSMDESSRSSRSRSTHHRSKSSRRGRSPLPSPNKSVRFFDESPPPRHRRSNVPERPKSYVKDAPPIAINESAKDTSRRLYIQAYERGYLTPPTTPTYERSRPSYRRSGSSRDILTTVAEMGTVVPPPTSPYYERPRYERTSSGRSERSSHGGHSRKHSRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.24
3	0.3
4	0.33
5	0.37
6	0.43
7	0.43
8	0.45
9	0.46
10	0.39
11	0.35
12	0.31
13	0.26
14	0.27
15	0.31
16	0.32
17	0.35
18	0.33
19	0.31
20	0.3
21	0.3
22	0.24
23	0.25
24	0.24
25	0.23
26	0.26
27	0.27
28	0.26
29	0.27
30	0.27
31	0.21
32	0.19
33	0.13
34	0.1
35	0.1
36	0.1
37	0.13
38	0.13
39	0.14
40	0.13
41	0.14
42	0.17
43	0.2
44	0.2
45	0.16
46	0.18
47	0.18
48	0.19
49	0.19
50	0.17
51	0.15
52	0.14
53	0.13
54	0.13
55	0.18
56	0.19
57	0.25
58	0.32
59	0.34
60	0.39
61	0.44
62	0.53
63	0.54
64	0.56
65	0.51
66	0.47
67	0.45
68	0.44
69	0.44
70	0.4
71	0.38
72	0.36
73	0.38
74	0.35
75	0.34
76	0.3
77	0.27
78	0.24
79	0.19
80	0.16
81	0.13
82	0.12
83	0.13
84	0.14
85	0.14
86	0.11
87	0.12
88	0.14
89	0.16
90	0.16
91	0.16
92	0.14
93	0.13
94	0.13
95	0.14
96	0.11
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.08
101	0.07
102	0.07
103	0.05
104	0.06
105	0.07
106	0.07
107	0.08
108	0.13
109	0.13
110	0.14
111	0.14
112	0.14
113	0.14
114	0.14
115	0.16
116	0.11
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.06
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.06
131	0.09
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.12
137	0.14
138	0.14
139	0.12
140	0.13
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.14
145	0.13
146	0.14
147	0.18
148	0.24
149	0.25
150	0.32
151	0.32
152	0.31
153	0.31
154	0.3
155	0.32
156	0.27
157	0.27
158	0.22
159	0.22
160	0.21
161	0.2
162	0.21
163	0.13
164	0.11
165	0.11
166	0.12
167	0.13
168	0.18
169	0.21
170	0.23
171	0.24
172	0.23
173	0.24
174	0.22
175	0.21
176	0.16
177	0.14
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.11
182	0.09
183	0.08
184	0.09
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.06
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.11
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.15
200	0.14
201	0.14
202	0.14
203	0.12
204	0.12
205	0.13
206	0.12
207	0.13
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.06
232	0.07
233	0.08
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.09
238	0.09
239	0.07
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.09
261	0.11
262	0.13
263	0.17
264	0.21
265	0.23
266	0.25
267	0.27
268	0.25
269	0.26
270	0.26
271	0.28
272	0.24
273	0.23
274	0.22
275	0.21
276	0.18
277	0.17
278	0.17
279	0.14
280	0.15
281	0.16
282	0.18
283	0.18
284	0.19
285	0.22
286	0.26
287	0.24
288	0.23
289	0.23
290	0.2
291	0.21
292	0.21
293	0.18
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.07
311	0.1
312	0.13
313	0.18
314	0.21
315	0.32
316	0.38
317	0.46
318	0.55
319	0.65
320	0.73
321	0.79
322	0.86
323	0.84
324	0.85
325	0.85
326	0.86
327	0.82
328	0.77
329	0.73
330	0.65
331	0.59
332	0.53
333	0.43
334	0.33
335	0.26
336	0.23
337	0.18
338	0.15
339	0.15
340	0.16
341	0.2
342	0.23
343	0.24
344	0.22
345	0.25
346	0.28
347	0.34
348	0.41
349	0.47
350	0.54
351	0.61
352	0.69
353	0.72
354	0.8
355	0.82
356	0.83
357	0.83
358	0.81
359	0.79
360	0.76
361	0.77
362	0.75
363	0.75
364	0.74
365	0.68
366	0.67
367	0.7
368	0.7
369	0.64
370	0.59
371	0.53
372	0.52
373	0.49
374	0.48
375	0.5
376	0.49
377	0.53
378	0.59
379	0.59
380	0.56
381	0.62
382	0.61
383	0.61
384	0.64
385	0.69
386	0.7
387	0.76
388	0.79
389	0.76
390	0.8
391	0.75
392	0.68
393	0.65
394	0.62
395	0.55
396	0.55
397	0.51
398	0.46
399	0.44
400	0.42
401	0.37
402	0.35
403	0.31
404	0.24
405	0.27
406	0.25
407	0.24
408	0.25
409	0.24
410	0.22
411	0.26
412	0.26
413	0.25
414	0.28
415	0.33
416	0.38
417	0.44
418	0.43
419	0.4
420	0.39
421	0.38
422	0.35
423	0.31
424	0.25
425	0.21
426	0.2
427	0.22
428	0.24
429	0.25
430	0.28
431	0.35
432	0.41
433	0.41
434	0.47
435	0.54
436	0.58
437	0.64
438	0.7
439	0.66
440	0.67
441	0.69
442	0.7
443	0.67
444	0.67
445	0.62
446	0.54
447	0.5
448	0.42
449	0.37
450	0.29
451	0.23
452	0.14
453	0.11
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.09
459	0.08
460	0.09
461	0.13
462	0.17
463	0.2
464	0.23
465	0.3
466	0.4
467	0.49
468	0.54
469	0.56
470	0.61
471	0.64
472	0.65
473	0.66
474	0.63
475	0.63
476	0.65
477	0.68
478	0.67
479	0.63
480	0.62
481	0.58
482	0.58
483	0.51
484	0.5
485	0.51
486	0.52
487	0.54
488	0.6

A0A139HGI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer