Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FFJ3

Protein Details
Accession A0A109FFJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31KSLAPTSYTKRRRSPTPPPADPYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-94AKRKKR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 13, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR044113  DEADc_DDX41  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd17951  DEADc_DDX41  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MADVSDAPKSLAPTSYTKRRRSPTPPPADPYALPDDEPVYVPLKQRRAQLIEKLSAKGGGGGVTAAAEKRKHEEETEEREQREREEAEAKRKKREHQTLLMEAQEVKRQKAIEDAAKTERQKREEEEAKILAAQEATRKTLAGAEEIAKGIVYTERMKTSWQPPHYIRNKPEEEHQAIREKFHIITSGDDVPPPIPSFKDMKLPKPLLDYLKKKKIEAPTPIQLQGIPVAFSGRDMIGIAFTGSGKTLAFSLPLLMFALEEEKRMPFVQGEGPVGIIICPSRELARQTYEGLQEMARLMEQGGYPQVRSLLCIGGINMSEQGQVLSQGFHMVVATPGRLQDMLEKRKFTLAQCKYLCMDEADRMIDMGFEEDVRNILSFFKHQRQTLLFSATMPKRIQDFAQSALVQPILVNVGRAGAASLNIIQEVEYVKQEAKMVYLLECLQKTAPPVIIFSDNKNEVDGESAPEYLLLKGVEAVAIHGSKTQEEREYAIKAFKSGKKDVMVASSVASKGLDFSEIQHVINYSMPKEIEDYTHQCGRTGRAGKTGIATTFVNMQTPEQTLLDLKYLLMEAKQKVPPFLTSIEDPNLGADGKPVGCTNCGGLGHTIRNCPKLEENQRRTMAGIGRGGDSGGGGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.45
3 0.53
4 0.59
5 0.66
6 0.7
7 0.76
8 0.78
9 0.81
10 0.81
11 0.83
12 0.82
13 0.79
14 0.78
15 0.73
16 0.64
17 0.59
18 0.55
19 0.45
20 0.37
21 0.33
22 0.28
23 0.24
24 0.25
25 0.21
26 0.16
27 0.19
28 0.25
29 0.31
30 0.38
31 0.41
32 0.47
33 0.53
34 0.57
35 0.6
36 0.63
37 0.63
38 0.63
39 0.62
40 0.57
41 0.49
42 0.44
43 0.37
44 0.3
45 0.23
46 0.15
47 0.12
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.08
53 0.12
54 0.13
55 0.14
56 0.2
57 0.24
58 0.26
59 0.28
60 0.35
61 0.4
62 0.48
63 0.56
64 0.57
65 0.54
66 0.56
67 0.54
68 0.48
69 0.46
70 0.38
71 0.32
72 0.35
73 0.39
74 0.46
75 0.55
76 0.56
77 0.6
78 0.64
79 0.69
80 0.71
81 0.77
82 0.74
83 0.74
84 0.79
85 0.76
86 0.73
87 0.66
88 0.56
89 0.47
90 0.4
91 0.36
92 0.3
93 0.24
94 0.24
95 0.23
96 0.23
97 0.27
98 0.31
99 0.33
100 0.34
101 0.37
102 0.4
103 0.46
104 0.49
105 0.51
106 0.51
107 0.47
108 0.48
109 0.49
110 0.53
111 0.55
112 0.56
113 0.53
114 0.48
115 0.45
116 0.41
117 0.36
118 0.27
119 0.19
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.18
129 0.15
130 0.15
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.16
143 0.16
144 0.19
145 0.25
146 0.32
147 0.39
148 0.39
149 0.44
150 0.45
151 0.56
152 0.61
153 0.64
154 0.59
155 0.6
156 0.62
157 0.56
158 0.6
159 0.58
160 0.56
161 0.51
162 0.5
163 0.5
164 0.46
165 0.46
166 0.4
167 0.34
168 0.28
169 0.25
170 0.25
171 0.16
172 0.17
173 0.2
174 0.22
175 0.2
176 0.19
177 0.19
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.13
182 0.09
183 0.12
184 0.16
185 0.17
186 0.26
187 0.28
188 0.32
189 0.41
190 0.42
191 0.41
192 0.42
193 0.44
194 0.42
195 0.48
196 0.52
197 0.52
198 0.59
199 0.59
200 0.56
201 0.57
202 0.59
203 0.58
204 0.56
205 0.54
206 0.52
207 0.54
208 0.54
209 0.48
210 0.39
211 0.32
212 0.27
213 0.2
214 0.13
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.09
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.07
254 0.09
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.06
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.08
270 0.11
271 0.13
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.2
276 0.2
277 0.19
278 0.17
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.11
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.06
309 0.04
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.12
328 0.21
329 0.28
330 0.31
331 0.32
332 0.32
333 0.35
334 0.37
335 0.32
336 0.34
337 0.3
338 0.36
339 0.36
340 0.37
341 0.35
342 0.34
343 0.32
344 0.23
345 0.2
346 0.13
347 0.14
348 0.12
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.06
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.1
366 0.15
367 0.22
368 0.26
369 0.27
370 0.3
371 0.32
372 0.36
373 0.36
374 0.34
375 0.27
376 0.23
377 0.3
378 0.27
379 0.3
380 0.25
381 0.23
382 0.22
383 0.22
384 0.22
385 0.2
386 0.21
387 0.19
388 0.23
389 0.22
390 0.2
391 0.2
392 0.19
393 0.14
394 0.11
395 0.09
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.05
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.14
432 0.15
433 0.16
434 0.17
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.22
439 0.22
440 0.23
441 0.27
442 0.26
443 0.26
444 0.26
445 0.24
446 0.18
447 0.19
448 0.17
449 0.13
450 0.13
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.13
455 0.1
456 0.11
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.1
468 0.11
469 0.12
470 0.14
471 0.16
472 0.17
473 0.18
474 0.21
475 0.22
476 0.24
477 0.24
478 0.27
479 0.24
480 0.24
481 0.31
482 0.33
483 0.36
484 0.37
485 0.41
486 0.39
487 0.41
488 0.39
489 0.35
490 0.32
491 0.26
492 0.23
493 0.2
494 0.18
495 0.16
496 0.14
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.1
503 0.18
504 0.19
505 0.2
506 0.2
507 0.2
508 0.19
509 0.22
510 0.22
511 0.14
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.18
516 0.18
517 0.18
518 0.23
519 0.27
520 0.29
521 0.34
522 0.34
523 0.33
524 0.34
525 0.35
526 0.37
527 0.39
528 0.36
529 0.38
530 0.4
531 0.39
532 0.41
533 0.39
534 0.3
535 0.27
536 0.25
537 0.19
538 0.23
539 0.22
540 0.2
541 0.18
542 0.19
543 0.18
544 0.2
545 0.21
546 0.15
547 0.16
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.15
552 0.13
553 0.11
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.17
558 0.18
559 0.25
560 0.3
561 0.31
562 0.33
563 0.35
564 0.34
565 0.32
566 0.32
567 0.29
568 0.27
569 0.3
570 0.3
571 0.29
572 0.27
573 0.23
574 0.22
575 0.18
576 0.15
577 0.12
578 0.13
579 0.12
580 0.14
581 0.15
582 0.15
583 0.16
584 0.17
585 0.18
586 0.19
587 0.19
588 0.19
589 0.22
590 0.25
591 0.31
592 0.33
593 0.4
594 0.4
595 0.44
596 0.44
597 0.44
598 0.47
599 0.5
600 0.58
601 0.61
602 0.64
603 0.69
604 0.71
605 0.67
606 0.61
607 0.56
608 0.51
609 0.45
610 0.42
611 0.34
612 0.32
613 0.31
614 0.3
615 0.24