Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FIR1

Protein Details
Accession A0A109FIR1    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-128GPDGNPLPPKRPRGRPRKVPGVDNRPPBasic
138-158TPSGRGRPKARGRGRGRGRGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-131PPKRPRGRPRKVPGVDNRPPPGS
135-167GADTPSGRGRPKARGRGRGRGRGRGRGGKRARP
220-225RKVSRP
238-240RRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15502  PHD_Phf1p_Phf2p_like  
Amino Acid Sequences MTTGAAGGNPFGQPQQPLQPGAEPQLAGLPANGSLQFEEDLKDIPSQLAGYADGAAAPQPPTRQFPSVLQQPAQPPAPTFATAPGIPVNTAPQVMPPLQPLGPDGNPLPPKRPRGRPRKVPGVDNRPPPGSTSSGADTPSGRGRPKARGRGRGRGRGRGRGGKRARPSSDEDDFGNGGTTTDTDAEGEDDNKDSVDLNEEVDDDFGAGGKGGGPTTKFGRKVSRPKTFVPTNKPTIHRRKRATAPSQLDANLMCEVCRAGHSPAENRLVICESCNKGWHQLCSTPHIPHEIVDSTLPWFCAPCDAKIAASKQPQDVTDDASSSAPWTTGQGVDKGEGLEADKENEYSEAIKREWLTTQPLTVLVGYILSIEKKFAPALSSQTSSSTSLPIWPSALPQKLLELKETAAKEAAEREAALERQAEELAAAQGALPMLDTPGTSEAGTPLTFDGITIPGEAPARTAASRAAQPGGGGQPSHQAAGAQPTPPPPSFAPQQPPRASSSSSSSQQQGGGGGHVPAFLRQPFNMVPALGGAASAASPAGSPVSAYATGSQQGMGGGGGGDIPVGAAQAQAQAARYAPYGSSVLPPQQQQHHHLAQQQLHPSQQLHHHQQQQHQQQQLQQHQQQQQSAYGSHSSQMGQQQQQHPSHVQQAYGAYAAAAPGQYANAYALPGYDGMSMSRGMSGNGAPDQQQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.27
3 0.29
4 0.31
5 0.32
6 0.35
7 0.35
8 0.38
9 0.37
10 0.28
11 0.24
12 0.26
13 0.24
14 0.2
15 0.18
16 0.14
17 0.12
18 0.14
19 0.14
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.18
48 0.24
49 0.29
50 0.31
51 0.32
52 0.36
53 0.43
54 0.48
55 0.49
56 0.45
57 0.45
58 0.45
59 0.48
60 0.46
61 0.38
62 0.31
63 0.3
64 0.31
65 0.28
66 0.25
67 0.23
68 0.24
69 0.22
70 0.23
71 0.21
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.16
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.21
91 0.2
92 0.25
93 0.31
94 0.32
95 0.38
96 0.39
97 0.49
98 0.55
99 0.65
100 0.67
101 0.72
102 0.81
103 0.85
104 0.88
105 0.89
106 0.85
107 0.84
108 0.84
109 0.83
110 0.8
111 0.77
112 0.72
113 0.63
114 0.58
115 0.52
116 0.45
117 0.37
118 0.31
119 0.27
120 0.25
121 0.24
122 0.25
123 0.23
124 0.2
125 0.2
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.29
130 0.32
131 0.42
132 0.51
133 0.58
134 0.61
135 0.67
136 0.73
137 0.77
138 0.82
139 0.82
140 0.79
141 0.78
142 0.76
143 0.75
144 0.75
145 0.74
146 0.7
147 0.7
148 0.72
149 0.7
150 0.73
151 0.73
152 0.68
153 0.63
154 0.66
155 0.62
156 0.58
157 0.51
158 0.42
159 0.37
160 0.33
161 0.28
162 0.22
163 0.15
164 0.11
165 0.1
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.09
202 0.14
203 0.2
204 0.21
205 0.24
206 0.33
207 0.41
208 0.51
209 0.59
210 0.64
211 0.63
212 0.65
213 0.7
214 0.69
215 0.68
216 0.66
217 0.64
218 0.62
219 0.64
220 0.65
221 0.66
222 0.69
223 0.72
224 0.72
225 0.7
226 0.71
227 0.74
228 0.78
229 0.76
230 0.75
231 0.7
232 0.63
233 0.6
234 0.52
235 0.43
236 0.34
237 0.28
238 0.19
239 0.14
240 0.11
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.11
248 0.14
249 0.16
250 0.21
251 0.25
252 0.24
253 0.22
254 0.22
255 0.22
256 0.2
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.2
262 0.19
263 0.25
264 0.27
265 0.29
266 0.26
267 0.29
268 0.3
269 0.34
270 0.36
271 0.3
272 0.28
273 0.29
274 0.26
275 0.21
276 0.23
277 0.17
278 0.15
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.13
288 0.14
289 0.13
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.2
294 0.23
295 0.22
296 0.25
297 0.26
298 0.25
299 0.26
300 0.26
301 0.26
302 0.24
303 0.22
304 0.18
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.1
310 0.1
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.07
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.18
343 0.15
344 0.16
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.12
365 0.15
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.18
370 0.19
371 0.18
372 0.15
373 0.12
374 0.14
375 0.14
376 0.13
377 0.12
378 0.11
379 0.13
380 0.17
381 0.18
382 0.16
383 0.15
384 0.18
385 0.22
386 0.23
387 0.22
388 0.18
389 0.17
390 0.21
391 0.21
392 0.18
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.14
397 0.14
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.03
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.07
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.11
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.12
456 0.14
457 0.14
458 0.13
459 0.11
460 0.1
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.13
465 0.11
466 0.11
467 0.17
468 0.18
469 0.14
470 0.15
471 0.17
472 0.21
473 0.21
474 0.24
475 0.19
476 0.22
477 0.26
478 0.31
479 0.38
480 0.41
481 0.5
482 0.49
483 0.5
484 0.5
485 0.49
486 0.44
487 0.37
488 0.36
489 0.33
490 0.33
491 0.33
492 0.31
493 0.29
494 0.28
495 0.26
496 0.22
497 0.16
498 0.15
499 0.13
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.11
506 0.12
507 0.13
508 0.13
509 0.17
510 0.17
511 0.19
512 0.19
513 0.16
514 0.14
515 0.12
516 0.13
517 0.08
518 0.08
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.05
531 0.08
532 0.08
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.13
537 0.13
538 0.12
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.07
543 0.06
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.03
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.05
557 0.06
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.1
565 0.1
566 0.12
567 0.12
568 0.12
569 0.15
570 0.16
571 0.2
572 0.23
573 0.25
574 0.28
575 0.34
576 0.38
577 0.41
578 0.47
579 0.48
580 0.48
581 0.5
582 0.52
583 0.51
584 0.52
585 0.53
586 0.47
587 0.43
588 0.43
589 0.38
590 0.35
591 0.38
592 0.41
593 0.43
594 0.49
595 0.56
596 0.59
597 0.66
598 0.72
599 0.74
600 0.72
601 0.69
602 0.64
603 0.61
604 0.65
605 0.67
606 0.66
607 0.62
608 0.63
609 0.64
610 0.66
611 0.65
612 0.58
613 0.53
614 0.46
615 0.41
616 0.35
617 0.31
618 0.27
619 0.24
620 0.23
621 0.19
622 0.2
623 0.26
624 0.31
625 0.33
626 0.41
627 0.47
628 0.54
629 0.56
630 0.57
631 0.53
632 0.5
633 0.54
634 0.47
635 0.4
636 0.34
637 0.33
638 0.3
639 0.26
640 0.22
641 0.13
642 0.11
643 0.11
644 0.09
645 0.08
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.07
650 0.07
651 0.09
652 0.08
653 0.09
654 0.08
655 0.08
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.09
660 0.09
661 0.1
662 0.11
663 0.11
664 0.11
665 0.14
666 0.13
667 0.12
668 0.14
669 0.14
670 0.17
671 0.19
672 0.2