Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FJD9

Protein Details
Accession A0A109FJD9    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162STAATHKKPKRPKMEKSYDYHydrophilic
239-267SAGGGFGEERRRKKKKRKHDDPNNIATDPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-154KKPKRP
247-260ERRRKKKKRKHDDP
267-272PKKQRR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences MADKPWRRHLVSLHNPHPSPLSGTQDLISHFQLEPLYDTFLRPYLPSSLTSVPVDAADQLSVGAPSNGGAPPLSSTQATTLPLPVPGQVVLPTNRSKLNKATTSPAPPSTPGGGGGFKITLGGIKLAGLTSPALASASTAASSTAATHKKPKRPKMEKSYDYMVGDVLGRISQPRSASSSGAASSLLHLVSNPDPAPCPPLHPFDPHQLREAFTLKPGGLAGFDMTIWEARDPSGTGASAGGGFGEERRRKKKKRKHDDPNNIATDPKKQRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.66
3 0.62
4 0.58
5 0.48
6 0.43
7 0.37
8 0.38
9 0.31
10 0.32
11 0.32
12 0.31
13 0.32
14 0.28
15 0.24
16 0.19
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.16
21 0.17
22 0.15
23 0.19
24 0.17
25 0.18
26 0.17
27 0.18
28 0.18
29 0.15
30 0.16
31 0.16
32 0.17
33 0.18
34 0.22
35 0.23
36 0.25
37 0.25
38 0.23
39 0.19
40 0.17
41 0.16
42 0.12
43 0.1
44 0.07
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.12
77 0.12
78 0.16
79 0.17
80 0.18
81 0.23
82 0.24
83 0.26
84 0.29
85 0.35
86 0.35
87 0.35
88 0.39
89 0.38
90 0.42
91 0.42
92 0.38
93 0.32
94 0.28
95 0.29
96 0.25
97 0.2
98 0.16
99 0.15
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.1
132 0.12
133 0.13
134 0.22
135 0.29
136 0.37
137 0.46
138 0.55
139 0.61
140 0.68
141 0.77
142 0.79
143 0.83
144 0.78
145 0.74
146 0.7
147 0.62
148 0.53
149 0.43
150 0.32
151 0.22
152 0.18
153 0.13
154 0.08
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.14
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.15
168 0.15
169 0.14
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.13
183 0.17
184 0.15
185 0.19
186 0.19
187 0.24
188 0.26
189 0.3
190 0.33
191 0.39
192 0.47
193 0.44
194 0.45
195 0.4
196 0.39
197 0.39
198 0.38
199 0.28
200 0.21
201 0.23
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.09
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.08
232 0.18
233 0.24
234 0.33
235 0.43
236 0.54
237 0.65
238 0.76
239 0.84
240 0.86
241 0.91
242 0.93
243 0.95
244 0.96
245 0.96
246 0.95
247 0.94
248 0.88
249 0.77
250 0.69
251 0.59
252 0.58