Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FIZ8

Protein Details
Accession A0A109FIZ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-69KANNSQPRNNGPRRDNKNRNQADREVHydrophilic
245-267FGAPKAAPNKQKKQKEAKTFLEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-108ARRGGRGGRGGRAPGGGNPRG
272-309RPPRRDTRDARESTRGGRPARGRGEGRGRGGAASRGST
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.5, nucl 8, extr 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAGVFSRNAFAALGDGDDFAPVAKPKAAAAPAPAAPAAAAAAPKANNSQPRNNGPRRDNKNRNQADREVNAAVPVGEGAKEDRAQNFARRGGRGGRGGRAPGGGNPRGNSGTYLGGARPRRENGGGRPFDRQSQTGRVDSEKAEAAGWGAEDGKKELEAEVLAEADAKAEAPAEGAATPVREAPVVEEEEEDNTQTYEEYLAAKAAKKLNIGELPEARPANEGEDLFANAQAVTKKSEQEEEWLFGAPKAAPNKQKKQKEAKTFLEIEFTSRPPRRDTRDARESTRGGRPARGRGEGRGRGGAASRGSTRGQGRSQGPAAPAVSDASAFPALA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.2
14 0.22
15 0.2
16 0.23
17 0.26
18 0.25
19 0.26
20 0.25
21 0.19
22 0.16
23 0.15
24 0.12
25 0.08
26 0.07
27 0.06
28 0.09
29 0.09
30 0.11
31 0.14
32 0.19
33 0.27
34 0.32
35 0.41
36 0.46
37 0.55
38 0.64
39 0.69
40 0.73
41 0.72
42 0.77
43 0.78
44 0.82
45 0.83
46 0.82
47 0.85
48 0.85
49 0.85
50 0.81
51 0.78
52 0.75
53 0.66
54 0.61
55 0.52
56 0.43
57 0.35
58 0.28
59 0.21
60 0.13
61 0.11
62 0.07
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.09
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.17
71 0.2
72 0.25
73 0.29
74 0.32
75 0.35
76 0.34
77 0.36
78 0.37
79 0.4
80 0.41
81 0.39
82 0.37
83 0.36
84 0.36
85 0.33
86 0.3
87 0.25
88 0.22
89 0.26
90 0.26
91 0.25
92 0.25
93 0.27
94 0.26
95 0.26
96 0.23
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.12
102 0.17
103 0.2
104 0.21
105 0.23
106 0.24
107 0.26
108 0.29
109 0.33
110 0.35
111 0.42
112 0.44
113 0.41
114 0.45
115 0.42
116 0.43
117 0.41
118 0.34
119 0.28
120 0.32
121 0.34
122 0.31
123 0.31
124 0.28
125 0.28
126 0.26
127 0.24
128 0.17
129 0.14
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.1
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.13
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.18
196 0.22
197 0.24
198 0.24
199 0.24
200 0.24
201 0.24
202 0.27
203 0.26
204 0.22
205 0.2
206 0.18
207 0.17
208 0.17
209 0.15
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.07
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.16
223 0.17
224 0.21
225 0.2
226 0.24
227 0.26
228 0.25
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.19
233 0.2
234 0.14
235 0.16
236 0.19
237 0.24
238 0.32
239 0.41
240 0.52
241 0.6
242 0.68
243 0.73
244 0.79
245 0.83
246 0.85
247 0.84
248 0.8
249 0.78
250 0.73
251 0.64
252 0.59
253 0.49
254 0.42
255 0.36
256 0.32
257 0.34
258 0.35
259 0.36
260 0.37
261 0.45
262 0.49
263 0.57
264 0.64
265 0.64
266 0.71
267 0.74
268 0.73
269 0.73
270 0.67
271 0.62
272 0.61
273 0.57
274 0.49
275 0.52
276 0.51
277 0.53
278 0.56
279 0.58
280 0.52
281 0.54
282 0.62
283 0.6
284 0.58
285 0.53
286 0.47
287 0.41
288 0.41
289 0.37
290 0.29
291 0.26
292 0.25
293 0.24
294 0.25
295 0.29
296 0.32
297 0.34
298 0.35
299 0.39
300 0.4
301 0.44
302 0.45
303 0.43
304 0.4
305 0.38
306 0.35
307 0.28
308 0.26
309 0.2
310 0.18
311 0.14
312 0.13
313 0.13