Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FDJ3

Protein Details
Accession A0A109FDJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
787-814LSFLRRCLKLVRTCQRWRRYMRAMRIPVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-73SRGKKTPAGRVKARESG
531-543RRAARERRFRERA
Subcellular Location(s) plas 9, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5, mito 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MQEEEEAPAFVIKKRTKPRSSLVSKLSTSSDSTSAPLPTASALEGEEDDGNVPVIRSRGKKTPAGRVKARESGAAAARGKISFGGGDDGDEAGDDSETSFVVKRSSNASSSTPRRLLRPSAAIASSTASPSLASSSAAGAPFALGSSAKTESSAVAAAAGSIYSKEYLDELKRSQLKAPKPSSEEETAAPSPAGYDSLTRSKFGAEQLQESTELPSSQQIERARLRREELRKAGLAEPARAATGNDDGFISLQVGFASKGGESRLVREEDEIGDGDEDMAAFTDSLSRLPLGKRANADAARRLREEMGEMIDDVEMDVRDQDEEMKEWEEAQIRRAGGGGGTGMGRDRGGRNDGAGRKAPYRAAPIPQSSTLPSMSAVSARLSAALQALTASHTLEASALEHFEKERVELDSQETELRREVVKTEEKSRWFGEFKDEVEDWSAFLDEKFPQLERIEATLLSIQRERTALVTRRRFADDADDVALFTGASVLPVFRLAAAGTGDAEMQGERRSAIPSDEDDLPPRSIVRTTRRAARERRFRERARPSGDDGLGYDTDSDLSAGDRSDLVEALTTAEADLASLFSDVKAPEFRDPNLVIRKRFEEWRSKYGEEYRMTFAGLSLAQVWEFWARVEMARWNPFELDELPRTPTELGAYQWHQALSTYGQRPDRTPGATNLDETEEEEEDEDESTEVVNAIVASVAIPRLALLARQTYDPYSARQTAAALRIVDEISYSVEINSPKFEGLICAFLFRLRLAIAALQTLILPHLTGLAVPSLAYDPSTFEARLSFLRRCLKLVRTCQRWRRYMRAMRIPVVPEAVGGEEGMGEAGEGLLEVGAGDSFDELVQRELVARTVLPVVEAAWASGGADIAKSIIEALPKDTPPALRRRLEGENVGHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.59
3 0.64
4 0.7
5 0.76
6 0.77
7 0.79
8 0.79
9 0.76
10 0.73
11 0.67
12 0.62
13 0.56
14 0.47
15 0.42
16 0.36
17 0.31
18 0.24
19 0.24
20 0.25
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.15
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.1
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.12
42 0.18
43 0.22
44 0.27
45 0.35
46 0.41
47 0.49
48 0.53
49 0.62
50 0.65
51 0.7
52 0.73
53 0.72
54 0.73
55 0.73
56 0.68
57 0.6
58 0.52
59 0.49
60 0.45
61 0.44
62 0.37
63 0.31
64 0.32
65 0.29
66 0.27
67 0.22
68 0.18
69 0.12
70 0.12
71 0.14
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.19
92 0.23
93 0.24
94 0.26
95 0.31
96 0.38
97 0.43
98 0.49
99 0.51
100 0.49
101 0.51
102 0.53
103 0.54
104 0.52
105 0.51
106 0.47
107 0.44
108 0.43
109 0.39
110 0.34
111 0.3
112 0.24
113 0.19
114 0.15
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.13
124 0.13
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.08
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.12
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.13
155 0.17
156 0.21
157 0.22
158 0.3
159 0.35
160 0.36
161 0.41
162 0.44
163 0.48
164 0.54
165 0.58
166 0.57
167 0.56
168 0.58
169 0.57
170 0.54
171 0.48
172 0.39
173 0.39
174 0.32
175 0.29
176 0.25
177 0.19
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.08
182 0.09
183 0.12
184 0.2
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.24
190 0.25
191 0.29
192 0.23
193 0.25
194 0.26
195 0.27
196 0.27
197 0.25
198 0.24
199 0.17
200 0.15
201 0.12
202 0.14
203 0.16
204 0.16
205 0.21
206 0.22
207 0.27
208 0.34
209 0.41
210 0.42
211 0.42
212 0.46
213 0.5
214 0.55
215 0.58
216 0.56
217 0.55
218 0.51
219 0.51
220 0.49
221 0.46
222 0.4
223 0.32
224 0.27
225 0.22
226 0.21
227 0.18
228 0.16
229 0.11
230 0.13
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.13
249 0.13
250 0.16
251 0.21
252 0.22
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.18
257 0.19
258 0.16
259 0.11
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.1
277 0.17
278 0.18
279 0.21
280 0.22
281 0.24
282 0.31
283 0.32
284 0.34
285 0.36
286 0.39
287 0.39
288 0.38
289 0.37
290 0.31
291 0.28
292 0.27
293 0.2
294 0.16
295 0.13
296 0.12
297 0.11
298 0.1
299 0.09
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.11
315 0.13
316 0.17
317 0.16
318 0.17
319 0.2
320 0.18
321 0.18
322 0.18
323 0.16
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.09
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.2
340 0.23
341 0.25
342 0.27
343 0.27
344 0.26
345 0.28
346 0.28
347 0.23
348 0.27
349 0.26
350 0.27
351 0.29
352 0.29
353 0.3
354 0.3
355 0.29
356 0.23
357 0.23
358 0.19
359 0.15
360 0.13
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.07
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.05
374 0.04
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.16
401 0.15
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.14
409 0.2
410 0.22
411 0.27
412 0.31
413 0.32
414 0.35
415 0.35
416 0.34
417 0.28
418 0.26
419 0.27
420 0.24
421 0.23
422 0.25
423 0.23
424 0.2
425 0.21
426 0.2
427 0.13
428 0.11
429 0.11
430 0.06
431 0.06
432 0.08
433 0.06
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.11
453 0.1
454 0.17
455 0.22
456 0.3
457 0.36
458 0.36
459 0.39
460 0.41
461 0.39
462 0.33
463 0.32
464 0.25
465 0.2
466 0.2
467 0.17
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.07
472 0.05
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.04
480 0.04
481 0.03
482 0.04
483 0.03
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.14
504 0.15
505 0.15
506 0.16
507 0.18
508 0.17
509 0.16
510 0.15
511 0.12
512 0.13
513 0.18
514 0.23
515 0.29
516 0.31
517 0.39
518 0.45
519 0.52
520 0.59
521 0.63
522 0.67
523 0.67
524 0.74
525 0.75
526 0.73
527 0.76
528 0.76
529 0.75
530 0.71
531 0.66
532 0.6
533 0.57
534 0.53
535 0.43
536 0.34
537 0.28
538 0.21
539 0.18
540 0.14
541 0.08
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.06
571 0.06
572 0.08
573 0.1
574 0.12
575 0.16
576 0.19
577 0.2
578 0.23
579 0.25
580 0.3
581 0.37
582 0.4
583 0.37
584 0.38
585 0.41
586 0.39
587 0.44
588 0.42
589 0.43
590 0.45
591 0.5
592 0.53
593 0.51
594 0.51
595 0.51
596 0.53
597 0.45
598 0.42
599 0.38
600 0.32
601 0.31
602 0.27
603 0.21
604 0.15
605 0.13
606 0.1
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.14
620 0.19
621 0.24
622 0.25
623 0.25
624 0.25
625 0.24
626 0.25
627 0.22
628 0.22
629 0.2
630 0.2
631 0.21
632 0.21
633 0.22
634 0.2
635 0.18
636 0.15
637 0.13
638 0.14
639 0.17
640 0.18
641 0.19
642 0.2
643 0.19
644 0.17
645 0.16
646 0.16
647 0.14
648 0.2
649 0.22
650 0.26
651 0.3
652 0.31
653 0.33
654 0.37
655 0.38
656 0.33
657 0.32
658 0.32
659 0.35
660 0.35
661 0.34
662 0.3
663 0.27
664 0.24
665 0.23
666 0.2
667 0.13
668 0.13
669 0.12
670 0.11
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.05
692 0.06
693 0.06
694 0.08
695 0.12
696 0.13
697 0.15
698 0.17
699 0.17
700 0.21
701 0.21
702 0.22
703 0.25
704 0.26
705 0.26
706 0.25
707 0.25
708 0.25
709 0.27
710 0.27
711 0.21
712 0.19
713 0.2
714 0.2
715 0.18
716 0.14
717 0.11
718 0.09
719 0.1
720 0.09
721 0.08
722 0.11
723 0.13
724 0.13
725 0.15
726 0.14
727 0.13
728 0.13
729 0.13
730 0.13
731 0.13
732 0.17
733 0.15
734 0.15
735 0.15
736 0.16
737 0.17
738 0.13
739 0.13
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.11
744 0.11
745 0.11
746 0.11
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.08
751 0.06
752 0.05
753 0.05
754 0.06
755 0.05
756 0.05
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.07
762 0.07
763 0.07
764 0.08
765 0.08
766 0.09
767 0.12
768 0.15
769 0.14
770 0.13
771 0.14
772 0.16
773 0.21
774 0.24
775 0.24
776 0.29
777 0.38
778 0.39
779 0.42
780 0.46
781 0.49
782 0.53
783 0.62
784 0.64
785 0.66
786 0.75
787 0.81
788 0.84
789 0.84
790 0.83
791 0.82
792 0.82
793 0.82
794 0.82
795 0.83
796 0.8
797 0.75
798 0.72
799 0.65
800 0.56
801 0.48
802 0.38
803 0.27
804 0.22
805 0.19
806 0.13
807 0.11
808 0.09
809 0.06
810 0.06
811 0.06
812 0.05
813 0.03
814 0.03
815 0.03
816 0.03
817 0.03
818 0.03
819 0.02
820 0.03
821 0.03
822 0.03
823 0.03
824 0.03
825 0.03
826 0.04
827 0.04
828 0.05
829 0.06
830 0.06
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.11
835 0.11
836 0.12
837 0.13
838 0.12
839 0.12
840 0.14
841 0.14
842 0.12
843 0.12
844 0.11
845 0.12
846 0.12
847 0.1
848 0.09
849 0.09
850 0.08
851 0.09
852 0.08
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.06
857 0.06
858 0.05
859 0.06
860 0.07
861 0.1
862 0.11
863 0.16
864 0.22
865 0.22
866 0.25
867 0.27
868 0.32
869 0.35
870 0.44
871 0.48
872 0.47
873 0.49
874 0.53
875 0.57
876 0.57
877 0.58