Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A125PJ26

Protein Details
Accession A0A125PJ26    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28TYNLTRFTRQVLKRHRRAPPSVVIHydrophilic
397-434REKAALEKKRLQQQQKRAQAQRRKERKKLELEKAQQAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
403-424EKKRLQQQQKRAQAQRRKERKK
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 8.5, cyto_nucl 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSGATYNLTRFTRQVLKRHRRAPPSVVIHLYPTHFRFEHQHGNFGYDSPMKCFLEAVREQKLPTDLLDVLDDAGVHDHRQSPAANPPNLRSSLSASFSLAQNREIPAASKAEVYRIVLAPNPATLWTELSIASRKTEQEAAAAGRNEVGWTEDEAVEIESVILNRTMPPLCLSPSIQTSRIANSMLRATTLRPPKRNRFCSTGDCSDGEDGEEGQKREREEHEKLMKVGDEGVPRTRGPAFSRLAFIQAYRERQQNPTLAAQPGSSATSIRLGGAQQQQQQQQAPHQAAAVHASALPAVASAQQAHAVRDSPRHSRAASPAVSVTSGRPHKKPKAHDGMMSDSGSGISATVTNAAAQQKKAAKLAAGAGAGAVGVDVVTAAAATPESQQAALERTEREKAALEKKRLQQQQKRAQAQRRKERKKLELEKAQQAGDLQVGTPGSSVAGTPNWQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.56
3 0.65
4 0.72
5 0.81
6 0.84
7 0.82
8 0.83
9 0.8
10 0.79
11 0.76
12 0.73
13 0.67
14 0.58
15 0.53
16 0.48
17 0.43
18 0.39
19 0.33
20 0.33
21 0.29
22 0.31
23 0.34
24 0.38
25 0.47
26 0.42
27 0.48
28 0.42
29 0.46
30 0.44
31 0.38
32 0.35
33 0.29
34 0.29
35 0.25
36 0.31
37 0.28
38 0.27
39 0.28
40 0.25
41 0.28
42 0.33
43 0.34
44 0.35
45 0.36
46 0.36
47 0.38
48 0.39
49 0.31
50 0.26
51 0.25
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.1
64 0.13
65 0.14
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.27
70 0.35
71 0.38
72 0.37
73 0.39
74 0.42
75 0.43
76 0.41
77 0.33
78 0.31
79 0.31
80 0.32
81 0.29
82 0.25
83 0.25
84 0.26
85 0.3
86 0.25
87 0.22
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.2
92 0.2
93 0.16
94 0.17
95 0.16
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.19
100 0.19
101 0.2
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.18
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.15
118 0.14
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.18
123 0.2
124 0.18
125 0.16
126 0.18
127 0.19
128 0.21
129 0.2
130 0.18
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.11
135 0.1
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.13
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.2
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.21
166 0.21
167 0.21
168 0.2
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.13
176 0.19
177 0.28
178 0.33
179 0.38
180 0.47
181 0.56
182 0.66
183 0.72
184 0.7
185 0.66
186 0.65
187 0.65
188 0.63
189 0.56
190 0.48
191 0.41
192 0.37
193 0.31
194 0.26
195 0.19
196 0.12
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.15
203 0.15
204 0.18
205 0.22
206 0.25
207 0.26
208 0.35
209 0.39
210 0.38
211 0.38
212 0.36
213 0.32
214 0.25
215 0.23
216 0.17
217 0.13
218 0.13
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.21
227 0.21
228 0.2
229 0.22
230 0.21
231 0.22
232 0.2
233 0.17
234 0.17
235 0.19
236 0.23
237 0.23
238 0.28
239 0.28
240 0.3
241 0.34
242 0.31
243 0.3
244 0.28
245 0.29
246 0.25
247 0.24
248 0.21
249 0.18
250 0.15
251 0.13
252 0.1
253 0.08
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.14
261 0.19
262 0.22
263 0.25
264 0.3
265 0.32
266 0.34
267 0.37
268 0.32
269 0.31
270 0.33
271 0.29
272 0.25
273 0.23
274 0.21
275 0.18
276 0.19
277 0.15
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.2
297 0.24
298 0.26
299 0.29
300 0.31
301 0.31
302 0.33
303 0.37
304 0.38
305 0.35
306 0.3
307 0.28
308 0.25
309 0.25
310 0.22
311 0.18
312 0.19
313 0.25
314 0.28
315 0.33
316 0.41
317 0.49
318 0.57
319 0.63
320 0.66
321 0.69
322 0.69
323 0.68
324 0.63
325 0.6
326 0.57
327 0.49
328 0.38
329 0.28
330 0.24
331 0.19
332 0.15
333 0.08
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.1
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.23
345 0.27
346 0.3
347 0.31
348 0.29
349 0.25
350 0.25
351 0.27
352 0.24
353 0.19
354 0.16
355 0.14
356 0.12
357 0.11
358 0.09
359 0.06
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.02
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.1
377 0.13
378 0.14
379 0.16
380 0.18
381 0.21
382 0.24
383 0.25
384 0.25
385 0.26
386 0.32
387 0.39
388 0.46
389 0.5
390 0.55
391 0.62
392 0.7
393 0.75
394 0.79
395 0.78
396 0.8
397 0.83
398 0.85
399 0.87
400 0.87
401 0.88
402 0.87
403 0.89
404 0.89
405 0.9
406 0.89
407 0.88
408 0.89
409 0.89
410 0.9
411 0.9
412 0.89
413 0.89
414 0.86
415 0.86
416 0.79
417 0.7
418 0.59
419 0.5
420 0.4
421 0.31
422 0.24
423 0.15
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.1